基于磁性颗粒微阵列与单碱基循环延伸技术的高通量和自动化的SNP检测方法研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    60801007
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0124.生物电子学与生物信息处理
  • 结题年份:
    2011
  • 批准年份:
    2008
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)是人类基因序列中最常见的变异,对他们的研究意义重大。目前已建立的SNP检测技术众多,但欠缺能够真正实用的对大量样本的多个SNP位点进行自动化分型检测的方法。本项目旨在结合纳米技术和基因芯片技术建立一种高通用性、高灵活性的SNP检测方法。为此,我们将磁性纳米颗粒微阵列和单碱基循环延伸技术首次应用与SNP检测,所提出的方法具有简单、准确、低成本、高通量的特点,并且该方法能够实现"样本提取- - 分型操作- - 信号检测"整个过程的全完自动化运行,与传统方法相比该方法预期具有更高的实用性。人类基因组SNP的信息能够广泛的应用于复杂疾病易感性、药物基因组学、法医学等各个方面,本项目的研究成果将大大加快SNP的应用研究进程,有利于个体化医疗技术的展开。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(5)
Fabrication and Characterization of Streptavidin gamma-Fe(2)O(3)@Au Nanocomposites for Biological Application
生物应用链霉亲和素γ-Fe(2)O(3)@Au纳米复合材料的制备和表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Acta Chimica Sinica
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    He Nongyue;Deng Yan;Liu Hongna;Li Song;Liu Lishang;Li Xiaolong
  • 通讯作者:
    Li Xiaolong
Multiplex single nucleotide polymorphisms genotyping using solid-phase single base extension on magnetic nanoparticles
使用磁性纳米颗粒上的固相单碱基延伸进行多重单核苷酸多态性基因分型
  • DOI:
    10.1016/j.ab.2008.11.035
  • 发表时间:
    2009-03-01
  • 期刊:
    ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Liu, Hongna;Li, Song;He, Nongyue
  • 通讯作者:
    He, Nongyue
Single Nucleotide Polymorphism Genotyping Based on Magnetic Bead Array and Dual-color Hybridization
基于磁珠阵列和双色杂交的单核苷酸多态性基因分型
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Chinese Journal of Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    Liu Hong-Na;Li Song;Liu Li-Shang;Tian Lan;Jia Ying-Ying;Li Zhi-Yang;Deng Yan;He Nong-Yue
  • 通讯作者:
    He Nong-Yue
A novel automated assay with dual-color hybridization for single-nucleotide polymorphisms genotyping on gold magnetic nanoparticle array
一种新颖的双色杂交自动检测方法,用于金磁性纳米颗粒阵列上的单核苷酸多态性基因分型
  • DOI:
    10.1016/j.ab.2010.05.016
  • 发表时间:
    2010-10-01
  • 期刊:
    ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Li, Song;Liu, Hongna;He, Nongyue
  • 通讯作者:
    He, Nongyue
A Novel Single Nucleotide Polymorphisms Detection Sensors Based on Magnetic Nanoparticles Array and Dual-Color Single Base Extension
基于磁性纳米颗粒阵列和双色单碱基延伸的新型单核苷酸多态性检测传感器
  • DOI:
    10.1166/jnn.2010.2386
  • 发表时间:
    2010-08-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF NANOSCIENCE AND NANOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu, Hongna;Li, Song;He, Nongyue
  • 通讯作者:
    He, Nongyue

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AM菌剂对大田甘蔗根际土壤AM真菌种群影响
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  • 通讯作者:
    陈廷速
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  • DOI:
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    2017
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 通讯作者:
    房殿吉

其他文献

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李松的其他基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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