猪BAG6可变剪接体鉴定及其在精子发生中的功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31772561
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1704.畜禽繁殖学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Alternative splicing plays an important role in the process of animal spermatogenesis. In our previous study, RNA-seq of the sexually mature and immature testes from Large White pigs have been done. The alternative splicing event analysis of RNA-seq data showed that BAG6 emerged exon skipping, leading to protein truncation. Exon-skipped BAG6 transcript was up-regulated in immature testes. Furthermore, inactivation of BAG6 in mice resulted in widespread apoptosis of meiotic male germ cells and complete male infertility. However, it still remains unknown on the characteristics, functions and the relative genetic mechanism of porcine BAG6 splice variants in spermatogenesis. In this proposal, we will identify porcine BAG6 splice variants and detect their spatiotemporal expression profiles, and study the effect of porcine BAG6 splice variants on spermatogenesis through suppressed-expression and over-expression in porcine ST cell, then identify cis-trans regulatory factors and interacting proteins of porcine BAG6 splice variants by dual luciferase reporter system, site-directed mutagenesis, co-immunoprecipitation, and yeast two-hybrid system, and finally investigate the effect of porcine BAG6 splice variants on spermatogenesis in vivo via testicular -specific BAG6 splice variants knockout mice model. We expect to systematically investigate the essential role of porcine BAG6 splice variants in spermatogenesis and to establish the related genetic network in vitro and in vivo. This proposal will provide a basic foundation and a new insight into the genetic regulation of spermatogenesis in the boar.
选择性剪接在动物精子发生等过程中起重要调控作用。申请人前期通过对性成熟前后大白猪睾丸组织RNA-seq,分析其选择性剪接事件,发现BCL2相关抗凋亡基因6(BAG6)出现外显子跳跃而导致蛋白截短,且该剪接体在性成熟前猪睾丸组织中显著高表达。此外BAG6敲除会出现减数分裂期的小鼠精子细胞凋亡,导致雄性完全不育。然而猪BAG6可变剪接体及其在精子发生过程中的功能和相关机制尚不清楚。有鉴于此,本项目首先鉴定猪BAG6可变剪接体,检测其时空表达谱;然后在猪睾丸ST细胞中,通过抑制表达、超表达等研究猪BAG6可变剪接体功能;再综合利用双荧光报告系统、定点突变、免疫共沉淀、酵母双杂交等,鉴定猪BAG6剪接体的顺反式调控因子、互作蛋白及结合位点;最后通过睾丸组织条件性敲除小鼠模型,从活体水平较系统地研究BAG6可变剪接体参与精子发生的机制和调控网络。本项目研究为猪精子发生的遗传调控提供理论基础和新见解。

结项摘要

选择性剪接在动物精子发生等过程中起重要调控作用。申请人前期通过对性成熟前后大白猪睾丸组织RNA-seq,分析其选择性剪接事件,发现BCL2相关抗凋亡基因6(BAG6)出现外显子24跳跃而导致蛋白截短,且该剪接体在性成熟前猪睾丸组织中显著高表达。此外BAG6敲除会出现减数分裂期的小鼠精子细胞凋亡,导致雄性完全不育。然而猪BAG6可变剪接体及其在精子发生过程中的功能和相关机制尚不清楚。有鉴于此,本项目首先鉴定猪BAG6可变剪接体,检测其时空表达谱;然后在猪睾丸ST细胞中,通过抑制表达、超表达等研究猪BAG6可变剪接体功能;再综合利用双荧光报告系统、定点突变、免疫共沉淀、蛋白质组学测序等,鉴定猪BAG6剪接体的互作蛋白;最后通过24外显子敲除小鼠模型,从活体水平较系统地研究BAG6可变剪接体参与精子发生的机制和调控网络。分离克隆猪精液品质相关基因标记5个,开展了miR-638、miR-124a调控猪未成熟睾丸支持细胞生长的机制探究。本项目研究为猪精子发生的遗传调控提供理论基础和新见解。本项目实施期间,发表SCI收录论文4篇,申请国家发明专利2项,其中1项获得授权,培养研究生4名。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
miR-638 Inhibits immature Sertoli cell growth by indirectly inactivating PI3K/AKT pathway via SPAG1 gene
miR-638 通过 SPAG1 基因间接灭活 PI3K/AKT 通路,抑制未成熟支持细胞生长
  • DOI:
    10.1080/15384101.2017.1380130
  • 发表时间:
    2017-01-01
  • 期刊:
    CELL CYCLE
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Hu, Pandi;Guan, Kaifeng;Li, Fenge
  • 通讯作者:
    Li, Fenge
H2AFZ, RNF4 and NR4A1 loci are associated with boar semen quality by population association studies
根据群体关联研究,H2AFZ、RNF4 和 NR4A1 基因座与公猪精液质量相关
  • DOI:
    10.1080/10495398.2018.1521825
  • 发表时间:
    2018-12
  • 期刊:
    Animal Biotechnology
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhao L;Ma C;Song H;Feng Y;Li Y;Xia X;Li J;Li F
  • 通讯作者:
    Li F
AR regulates porcine immature Sertoli cell growth via binding to RNF4 and miR-124a
AR 通过与 RNF4 和 miR-124a 结合调节猪未成熟支持细胞生长
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Reprod Domest Anim
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨鑫鹏;冯越;李阳;陈大可;夏宣炎;李家连;李凤娥
  • 通讯作者:
    李凤娥
The Function of Pre-mRNA Alternative Splicing in Mammal Spermatogenesis
前体mRNA选择性剪接在哺乳动物精子发生中的作用
  • DOI:
    10.7150/ijbs.34422
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL SCIENCES
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Song, Huibin;Wang, Ling;Li, Fenge
  • 通讯作者:
    Li, Fenge

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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    李凤娥;杨琳;龙见坤;常志敏;陈祥盛
  • 通讯作者:
    陈祥盛
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    控制与决策
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  • 作者:
    黄敏;李凤娥;孙艺红;王兴伟
  • 通讯作者:
    王兴伟

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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