建立利用激光显微切割联合质谱蛋白质组学技术鉴定系统性淀粉样变性患者中致淀粉样变性蛋白类型的方法

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81370672
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    16.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0816.血液系统疾病研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2014-12-31

项目摘要

The systemic amyloidosis is a group of complex diseases caused by tissue deposition of misfolded proteins that result in progressive organ damage. To date, at least 28 different proteins have been identified as causative agents of amyloid diseases. The various forms have overlapping manifestations, which make their differentiation impossible on a clinical basis, without the auxilium of laboratory and pathology techniques. Therefore, accurate and reliable differentiation of the amyloid subentity is of paramount importance, given the widely differing therapies, ranging from chemotherapy for AL amyloidosis to liver transplantation for some hereditary forms. Antibody based methods such as immunohistochemistry is proved to be unreliable for amyloid typing. Therefore, we will establish a novel method for subtyping the amyloidogenic proteins in patients with systemic amyloidosis by laser micro-dissection and mass-spectrometry based discovery proteomic analysis. The sensitivity and specificity of this method will be evaluated in patients with confirmed amyloidogenic proteins and those without amyloidosis. We will document the distribution of subentities in our hospital by analyzing all patients who were diagnosed as systemic amyloidosis during the last 15 years by the usage of laser microdissection and proteomic analysis. This novel method will enhance our ability to diagnose and treat patients with systemic amyloidosis and improve their clinical outcomes.
系统性淀粉样变性是一组异质性疾病,依照致淀粉样变性蛋白的不同可以分为不同的亚型。虽然各种淀粉样变性亚型的临床表现都很相似,但是不同亚型的病因、临床预后以及治疗策略却大相径庭。因此,对系统性淀粉样变性患者进行精确分型是患者接受正确治疗的基础。目前临床常用的组织病理学和免疫组化等分型方法都存在灵敏度低、特异性差的问题。国外近年开始将发现蛋白质组学技术用于鉴定致淀粉样变性蛋白类型,其灵敏度和特异性均高于常规方法。国内目前尚无相关研究。我们拟应用激光显微切割联合发现蛋白质组学技术建立鉴定致淀粉样变性蛋白类型的方法。该方法的建立和应用将显著提高我们诊治淀粉样变性的能力,并有助于改善系统性淀粉样变性患者的预后。

结项摘要

本研究旨在建立利用激光显微切割联合质谱蛋白质组学(LMD/MS)对淀粉样变进行分型的方法。在方法学方面,我们对大鼠经福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的显微切割标本进行蛋白提取及质谱蛋白质学测定,以测定到的多肽数、蛋白数、谱图数和蛋白丰度作为裂解液效率的判断标准,发现Zwittergent 3-16是LMD标本质谱分析首选的裂解液。同时应用微波辅助酶切的方法,可以显著缩短样本处理时间。我们还通过临床确诊的淀粉样变阳性对照组标本,证实了emPAI值较目前广为应用的谱图数能更为准确地判断丰度最高的致淀粉样变蛋白。同时,基于淀粉样物质沉积部位的致病蛋白百分比应高于非病变部位,以及致淀粉样变蛋白量高于其他因血液污染而带入的淀粉样变相关蛋白这两个假设,我们设立了P-score及D-score两个指标来判断鉴定结果的可信度。在建立方法之后,我们收集了北京协和医院138例病理确诊为系统性淀粉样变患者的FFPE标本。利用LMD收集刚果红染色阳性区域组织并行质谱蛋白质组学分析,根据丰度最高的致淀粉样变蛋白判定出淀粉样变亚型。在138例组织标本中,腹壁脂肪占26%,舌体占19%,齿龈占11%,肾脏占9%,胃肠道占9%,心脏占6%,其余类型样本占20%。总共121例获得了成功分型,分别为轻链型107例(88.4%),ATTR型7例(5.8%),AA型、AH/AL+AH型及AFib型各2例(1.7%),AApoA-II型1例(0.8%)。5例被排除淀粉样变诊断;12例分型失败。总体诊断准确率为91.3%。在各种组织类型标本中,腹壁脂肪组织的分型成功率最低,仅为83.3%。综上,LMD/MS是一种可靠、有效、快速的淀粉样变亚型鉴定方法。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
淀粉样变性分型的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国实验血液学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙维绎;李剑
  • 通讯作者:
    李剑

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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