茶树被茶尺蠖取食诱导的miRNA鉴定及其在诱导防御中的作用机理

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31171608
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

虫害是我国茶叶生产的主要限制因子,而茶树对害虫取食诱导防御的分子机制研究尚起步;同时miRNA在植物逆境中的调控机制是当今研究的热点,然而其在植物对害虫取食诱导防御机制中的调控研究尚属空白。本项目以茶树为试材,借助小RNA深度测序、降解组测序、基因芯片和qRT-PCR等技术,并结合生物信息学分析手段,获得茶树被茶尺蠖取食诱导相关的差异miRNA;比较茶树分别被茉莉酸甲酯、乙烯和茶尺蠖取食处理后各自对应的差异miRNA、靶基因和诱导防御相关基因表达的动态变化特征,及其在不同抗性品种间差别。通过这些研究,一方面明确茶树被茶尺蠖取食诱导的差异miRNA特征及其在诱导防御中的作用机理,进而在转录后水平上揭示茶树诱导防御体系的调控机制,同时还为茶树抗虫品种选育和害虫综合防治等方面提供理论支持,因此具有较大的科学意义和实际应用前景;另一方也为进一步认识植物miRNA特征和功能提供新视角。

结项摘要

虫害是我国茶叶生产的主要限制因子,而茶树对害虫取食诱导防御的分子机制研究尚起步;同时miRNA 在植物逆境中的调控机制是当今研究的热点,然而其在植物对害虫取食诱导防御机制中的调控研究尚属空白。本项目以茶树为试材,借助小RNA 深度测序、降解组测序、基因芯片和qRT-PCR 等技术,并结合生物信息学分析手段,研究了获得茶树被茶尺蠖取食诱导相关的差异miRNA及其作用靶基因。所取得的主要结果如下:.(1)分别对被茶尺蠖取食、机械损伤和未处理的茶树叶片样品(分别记作STL、SML和SCKL)构建small RNA文库,并进行高通量测序分别得到测序总量为2363062、2207927和 3775038 条reads。.(2)通过分析发现,在STL、SML和SCKL样品中分别获得101、106和112条保守的miRNA,以及462、406与478条茶树特异的miRNA;与对照试验组相比较,茶树被茶尺蠖取食后表达量存在差异的miRNA有56条,其中上调表达的有32条,下调表达的有24条;而进一步通过miRNA芯片检测,发现茶尺蠖取食茶树后,发生差异表达的miRNA共有37条,其中上调表达的有13条,下调表达的有24条。.(3)芯片鉴定出响应茶尺蠖取食后的差异表达的miRNA 9条,其中4条上调的miRNA,5条下调的miRNA。在响应茶尺蠖取食后的差异表达的miRNA中,扣除与响应机械损伤的相同的差异表达的5条miRNA后,余下的4条miRNA则可能是茶尺蠖取食茶树叶片时,其口腔分泌液所引起的差异表达的miRNA。.(4)基于降解组测序结果,发现有6条miRNA的靶基因,这些基因涉及调控转录因子TCP、生长响应因子与Ca2+运输ATPase等功能;利用RLM-5′RACE技术,成功验证了其中的3个差异表达miRNA对各自的靶基因具有调控作用。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Molecular Cloning and Characterization of Hydroperoxide LyaseGene in the Leaves of Tea Plant (Camellia sinensis)
茶树叶片过氧化氢裂解酶基因的分子克隆及表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Agricultural and Food Chemistry
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    韦朝领
  • 通讯作者:
    韦朝领
PASmiR: a literature-curated database for miRNA molecular regulation in plant response to abiotic stress
PASmiR:植物响应非生物胁迫中 miRNA 分子调控的文献整理数据库
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    BMC Plant Biology
  • 影响因子:
    5.3
  • 作者:
    Li; Ao;Hu; Xiaoyi;ShangGuan; Mingzhu;Wei; Chaoling
  • 通讯作者:
    Chaoling
Molecular cloning, functionnal analysis of three cinnamyl alcohol dehydrogenase (CAD) genes in the leaves of tea plant, Camellia sinensis
茶树叶片中3个肉桂醇脱氢酶(CAD)基因的分子克隆及功能分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Journal of Plant Pathology
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Wei-Wei Deng;Ming Zhang;Jian-Qiang Wu et al;Chao-Ling Wei
  • 通讯作者:
    Chao-Ling Wei

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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