从云南热泉中发掘高温放线菌新物种和新功能基因

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31070007
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    32.0万
  • 负责人：
    李文均
  • 依托单位：
    云南大学
  • 学科分类：
    C0101.微生物多样性、分类与系统发育
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

本项目以热泉高温放线菌为主要研究对象，主要探讨云南各地热泉环境放线菌的分离方法、物种多样性及PKS/NRPS基因多样性。在过去多年研究极端环境放线菌分离方法的基础上，摸索出适合云南热泉高温特殊生境放线菌的分离条件；以高温放线菌的纯培养技术为保障、结合免培养技术，通过系统发育分析，认识该区域高温放线菌的进化地位和进化关系，揭示云南不同地区高温热泉环境放线菌的群落组成、物种多样性；应用分子生物技术，研究可培养高温放线菌的PKS/NRPS合成基因簇的多样性。探讨放线菌源的聚酮类和非核糖体肽类新药开发从不可预见到可预见方法的可行性，为今后云南热泉高温生境放线菌源的新药研究开发提供可靠的技术保障和充足的菌种资源。

结项摘要

本项目以热泉高温放线菌为主要研究对象，主要探讨云南以及少数西藏热泉环境的放线菌分离方法、物种多样性及PKS/NRPS基因多样性。本课题在过去多年研究极端环境放线菌分离方法的基础上，初步摸索出适合云南热泉高温特殊生境放线菌的分离条件；以高温放线菌的纯培养技术为保障、结合454焦磷酸测序等免培养分析技术，通过系统发育分析，认识该区域高温放线菌的进化地位和进化关系，揭示云南不同地区高温热泉环境放线菌的群落组成、物种多样性；应用分子生物技术，研究可培养高温放线菌的PKS/NRPS合成基因簇的多样性，为今后云南热泉高温生境放线菌源的新药研究开发提供可靠的技术保障和充足的菌种资源。本项目已正式发表学术论文 18 篇，其中 SCI 源刊14 篇，其它国内外核心期刊论文4篇；出版《酶工程》（科学出版社，北京，2013）专著一部，参与编写国际伯杰氏细菌系统学手册中的6章；申请2件有关纤维素酶的发明专利。先后培养与本项目有关的博士后1名，博士生2名，硕士生5名。

项目成果

期刊论文数量（18）
专著数量（1）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（6）
专利数量（0）
A review of the microbiology of the Rehai geothermal field in Tengchong, Yunnan Province, China
云南腾冲热海地热田微生物学研究进展
  • DOI：
    10.1016/j.gsf.2011.12.006
  • 发表时间：
    2012-05-01
  • 期刊：
    GEOSCIENCE FRONTIERS
  • 影响因子：
    8.9
  • 作者：
    Hedlund, Brian P.;Cole, Jessica K.;Dong, Hailiang
  • 通讯作者：
    Dong, Hailiang
Thermus caliditerrae sp. nov., a novel thermophilic species isolated from a geothermal area.
栖热菌属 caliditerrae sp.
  • DOI：
    10.1099/ijs.0.056838-0
  • 发表时间：
    2014-02
  • 期刊：
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子：
    2.8
  • 作者：
    Ming, Hong;Yin, Yi-Rui;Li, Shuai;Nie, Guo-Xing;Yu, Tian-Tian;Zhou, En-Min;Liu, Lan;Dong, Lei;Li, Wen-Jun
  • 通讯作者：
    Li, Wen-Jun
响应面法优化Anoxybacillus sp. YIM 342产耐高温α-淀粉酶发酵条件
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012-07
  • 期刊：
    云南大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    杨心意;张峰;任万增;聂国兴;李帅;明红;唐蜀昆;张利莉;李文均
  • 通讯作者：
    李文均
Thermocatellispora tengchongensis gen. nov., sp. nov., a new member of the family Streptosporangiaceae.
腾冲热毛毛孢属
  • DOI：
    10.1099/ijs.0.036897-0
  • 发表时间：
    2012-10
  • 期刊：
    Int. J. Syst. Evol. Microbiol.
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    En-Min Zhou;Ling-Ling Yang;Zhao-Qi Song;Tian-Tian Yu;Guo-Xing Nie;Hong Ming;Yu Zhou;Shu-Kun Tang;Wen-Jun Li*
  • 通讯作者：
    Wen-Jun Li*
Bacterial and archaeal diversities in Yunnan and Tibetan hot springs, China.
中国云南和西藏温泉的细菌和古菌多样性。
  • DOI：
    10.1111/1462-2920.12025
  • 发表时间：
    2013-04
  • 期刊：
    Environmental Microbiology
  • 影响因子：
    5.1
  • 作者：
    Li, Wen-Jun;Wang, Feng-Ping;Zhi, Xiao-Yang;Chen, Jin-Quan;Zhou, En-Min;Liang, Feng;Xiao, Xiang;Tang, Shu-Kun;Jiang, Hong-Chen
  • 通讯作者：
    Jiang, Hong-Chen

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其他文献

植物内生菌活性代谢产物最新研究进展
  • DOI：
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    2018
  • 期刊：
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    --
  • 作者：
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  • 通讯作者：
    李文均
未培养微生物资源
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    微生物学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    崔晓龙*;徐丽华;文孟良;李铭刚;李一青;李文均;彭谦;姜成林
  • 通讯作者：
    姜成林
咸海岸边不同土壤带的土壤真菌和植物内生真菌多样性演化及其对环境变化的响应
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
    微生物学报
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  • 作者：
    黄建蓉;高磊;李丽;李文均;蒋宏忱
  • 通讯作者：
    蒋宏忱
深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652遗传操作系统的建立
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  • 发表时间：
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    李军;朱清华;张云;马俊英;田新鹏;李文均;张长生;鞠建华
  • 通讯作者：
    鞠建华
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中国兽医学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周育;吉小凤;李文均
  • 通讯作者：
    李文均

其他文献

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李文均的其他基金

中度嗜盐拟诺卡氏菌嗜盐机理研究
  • 批准号：
    31270054
  • 批准年份：
    2012
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    面上项目
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  • 批准号：
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  • 资助金额：
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    青年科学基金项目

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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