缺氧肿瘤细胞抑制ITGA3分泌的机制研究

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基本信息

  • 批准号:
    31500670
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

As solid tumors grow, those areas distant from the existing blood vessels can become chronically or intermittently hypoxia. These hypoxic conditions place tremendous pressure on tumor cells and drive development of increasingly malignant and metastatic phenotypes. In our previous studies of whole proteomics and glycol-proteomics for A431 cancer hypoxia, many pathways were found modulated by hypoxia, some of which were found with positive effects on cell migration. The changes of integrin alpha 3 (ITGA3) induced by hypoxia were interesting: independent of its protein level change, N-glycosylation modifications of ITGA3 were inhibited by hypoxia, which prevented its efficient translocation to the plasma membrane and promoted cell invasion under hypoxia. Mutagenesis studies demonstrated that simultaneous mutation of glycosites 6 and 7 of ITGA3 prevented its accumulation at K562 cell surface, which blocked integrin alpha 3 and beta 1 heterodimer formation and thus abolished its interaction with extracellular ligands. The conformation changes due to lack of glycans on sites 6 and 7 should be the keys to open the mysterious doors to reveal the interaction of integrin α3β1 complex. Immunoprecipitation and proteomics will be used to find ITGA3 partners which help its traffic to plasma membrane and binding orders. It could give clues for underlying mechanism behind ITGA3 secretion and metastatic cascades and provide new insights in the studies on cancer cell hypoxia and novel information for understanding glycoprotein secretion.
由于肿瘤细胞快速生长引起的缺氧,随着肿瘤细胞的适应性调控, 成为促进肿瘤恶化和迁移的重要原因。我们对缺氧肿瘤细胞的全、糖蛋白质组变化及随后的功能研究表明:肿瘤缺氧通过调控多条信号传导通路促进其迁移。其中,我们注意到缺氧调控的ITGA3的变化比较特殊:其蛋白表达总量没有明显的变化,仅在糖基化修饰上有明显的减少,因此导致其分泌到细胞膜上的量显著下降,从而提高细胞侵袭。我们进一步的研究发现其第6和7位点的糖基化修饰同时阻断会导致其分泌的完全缺失。可能正是由于糖链的缺失引发的结构变化,导致其无法与协作蛋白结合而无法分泌。我们拟主要采用IP结合蛋白质组学方法,以无分泌突变型为对照,鉴定ITGA3分泌过程中的动态蛋白质相互作用网络及作用顺序,并揭示这些蛋白对缺氧肿瘤细胞中ITGA3分泌及对细胞功能的影响。对于这种新型机制的揭秘可以填补目前研究的空白,并有利于发现肿瘤缺氧对细胞迁移调控的新方向。

结项摘要

我们发现ITGA3蛋白的第6和7位N-连接糖基化修饰被阻断后,该蛋白无法被转运到细胞膜。而一旦ITGA3在细胞膜上缺失后,会大大提升缺氧条件下肿瘤细胞的迁移性。本研究预采用免疫共沉淀(Co-IP)和蛋白质组学结合的方法,以无分泌突变型ITGA3-M6-7为对照, 鉴定ITGA3分泌过程中的动态蛋白质相互作用网络及作用顺序,寻找帮助ITGA3分泌到细胞膜的转运蛋白。并揭示这些蛋白对缺氧肿瘤细胞中ITGA3分泌及对细胞功能的影响。.. 我们首先确认了突变型ITGA3不可通过内质网检测点进入高尔基体;随后,我们在全细胞水平、亚细胞器水平、不同pH值条件下分别进行了ITGA3的常规Co-IP实验和LC-MS/MS质谱鉴定,同时也进行了cross-linking交联处理后的ITGA3 Co-IP实验和LC-MS/MS质谱鉴定,发现了多个潜在的ITGA3-WT特异结合蛋白,但是在常规Co-IP实验中那些被重复鉴定到的结合蛋白都是一些与ITGA3转运不太相关的蛋白;而在cross-linking交联处理后的ITGA3 Co-IP实验中,即使进行了大量的优化,也一直无法鉴定到和ITGA3直接结合的蛋白;仅发现帮助第6和7位N-连接糖基化位点突变后的ITGA3错误折叠的结合蛋白。.. 我们认为由于目标蛋白ITGA3在细胞中表达量不高,而与之结合的蛋白往往是瞬时的或是丰度非常低的,所以采用目前的技术很难发现帮助膜上ITGA3糖蛋白转运的结合蛋白。但是,在项目执行过程中,为了提升Co-IP复合物中少量蛋白的鉴定,我们发展了一种毛细管色谱柱装置及高效分离方法,该方法的专利已受理。同时进行了技术的改进以及方法学的优化,以期提升膜蛋白复合物的鉴定,虽然优化后的方法仍无法锁定ITGA3转运蛋白,但是该方法对于低丰度缺失蛋白的鉴定有明显的提升,因此在《Journal of Proteome Research》上发表文章一篇。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Multiparameter Optimization of Two Common Proteomics Quantification Methods for Quantifying Low-Abundance Proteins
用于定量低丰度蛋白质的两种常见蛋白质组学定量方法的多参数优化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Proteome Research
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Chengqian Zhang;Zhaomei Shi;Ying Han;Yan Ren;Piliang Hao
  • 通讯作者:
    Piliang Hao
Improved Peptide Retention Time Prediction in Liquid Chromatography through Deep Learning
通过深度学习改进液相色谱中的肽保留时间预测
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.8b02386
  • 发表时间:
    2018-09-18
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Ma, Chunwei;Ren, Yan;Liu, Siqi
  • 通讯作者:
    Liu, Siqi

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其他文献

血浆微小核糖核酸联合检测对胰腺癌的诊断价值
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  • 发表时间:
    2011-11
  • 期刊:
    中华消化杂志
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    --
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    路华
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  • 通讯作者:
    袁美

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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