circRNA0001992通过内源性竞争抑制miR-20b介导甲状腺乳头状癌侵袭转移的分子机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81772850
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Circular RNA (circRNA) targeting microRNA (miRNA) and mediating invasion and metastasis is increasingly becoming a hot field in cancer research. Our previous study demonstrated that circRNA0001992 may be used as an early diagnostic marker for papillary thyroid carcinoma (PTC). The expression level of circRNA0001992 is closely related to lymph node metastasis and Tumor-Node-Metastasis (TNM) stage, indicating that it may be involved in the invasion and metastasis of PTC. Simultaneously, similar changes were observed in purified microvesicles (MVs) isolated from PTC cell line condition medium and patients’ peripheral blood. Further software analysis identified specific sites, located in circRNA0001992, interacting with miR-20b. Based on above results, our present study will further validate the “sponge-like” effect of circRNA0001992 on miR-20b using RNA-ISH and Luciferase technology. Then, specific cell and animal models, together with Ago2 pull-down and other techniques, were performed to monitor the effect of circRNA0001992 on proliferation, invasion and metastasis, and to investigate the role of MAPK/ERK pathway in PTC invasion and metastasis mediated by circRNA0001992-miR-20b. Eventually, using tissues and peripheral blood samples from PTC patients, we intend to analyze the correlation between circRNA0001992 and clinicopathological parameters and the key genes in MAPK/ERK pathway in order to establish a SVM model predicting PTC invasion, metastasis and prognosis. The implementation of this study will provide a theoretical basis for elucidating the molecular mechanism of invasion and metastasis of PTC.
circRNA靶向miRNA介导侵袭转移日益成为肿瘤研究的热点。我们前期鉴定出与甲状腺乳头状癌(PTC)侵袭转移和分期密切相关的circRNA0001992,在PTC细胞株培养基和患者外周血纯化的微囊泡中也检测到circRNA0001992的存在;且找到了与circRNA0001992相关的靶向miR-20b。本课题通过RNA-ISH和Luciferase等技术验证circRNA0001992对miR-20b的“海绵”作用;利用细胞和动物模型研究circRNA0001992对细胞增殖和侵袭转移的影响,探明MAPK/ERK通路在circRNA0001992-miR-20b调控PTC侵袭转移中的作用;进一步分析circRNA0001992与临床病理及MAPK/ERK通路中关键基因的关系,建立预测PTC侵袭转移和预后的SVM模型。本课题实施将为阐明PTC侵袭转移的分子机制提供理论依据。

结项摘要

甲状腺乳头状癌(PTC)作为内分泌系统最常见的恶性肿瘤,研究其侵袭转移的机制具有重要的临床意义。本项目探讨circRNA、miRNA及TET1在PTC中的生物学作用。我们发现circRNA0007766在甲状腺癌组织中和细胞株中表达显著下降,可能抑制PTC细胞的侵袭和转移能力;miR-3619-3p通过稳定β-catenin的mRNA而激活wnt/β-catenin通路,从而促进PTC细胞迁移侵袭;我们发现PTC中5hmC低表达是由于TET1下调引起,5hmC可作为PTC发生的新的肿瘤标记物。TET1可以抑制PTC细胞迁移及侵袭,可能通过调控经典抑癌基因miR-7、miR-15/16家族、let-7家族和相关mRNA,参与Wnt/β-catenin信号通路发挥抑癌作用。该部分研究为探索甲状腺癌的侵袭转移机制提供理论依据。. 甲状腺结节在成人的检出率高达40-66%。甲状腺超声是鉴别结节良恶性的首选无创手段,但存在15%-20%的误诊率。鉴于甲状腺结节的庞大基数,进一步提高诊断的准确率具有极其重要的临床和社会意义。我们探讨BRAFV600E在PTC血浆样本、组织样本和血细胞样本中突变情况,发现BRAFV600E基因突变是一个非常可信的与疾病相关的变异,但在PTC患者循环游离DNA (cfDNA)样本中并没有检出。为进一步寻找可靠的诊断方法,利用深度学习技术,基于近2万张甲状腺结节超声图像构建了AI诊断模型ThyNet,并与12名资深超声医师进行交互,在7个中心的数据集对模型进行了验证。ThyNet模型在外部多中心验证的准确率超过了拥有10年以上甲状腺超声经验的专家的水平。该部分研究利用规范的图像处理和标准化方法对图像进行预处理,建立了标准化的人工智能分析数据集。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Deep learning-based artificial intelligence model to assist thyroid nodule diagnosis and management: a multicentre diagnostic study
基于深度学习的人工智能模型辅助甲状腺结节诊断和管理:一项多中心诊断研究
  • DOI:
    10.1016/s2589-7500(21)00041-8
  • 发表时间:
    2021-04-01
  • 期刊:
    LANCET DIGITAL HEALTH
  • 影响因子:
    30.8
  • 作者:
    Peng, Sui;Liu, Yihao;Xiao, Haipeng
  • 通讯作者:
    Xiao, Haipeng
Genetic alterations in cfDNA of benign and malignant thyroid nodules based on amplicon-based next-generation sequencing.
基于基于扩增子的下一代测序的良性和恶性甲状腺结节 cfDNA 的遗传改变。
  • DOI:
    10.21037/atm-20-4544
  • 发表时间:
    2020-10
  • 期刊:
    Annals of translational medicine
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cao S;Yu S;Yin Y;Su L;Hong S;Gong Y;Lv W;Li Y;Xiao H
  • 通讯作者:
    Xiao H
TET1 is a Tumor Suppressor That Inhibits Papillary Thyroid Carcinoma Cell Migration and Invasion
TET1 是一种肿瘤抑制剂,可抑制甲状腺乳头状癌细胞迁移和侵袭。
  • DOI:
    10.1155/2020/3909610
  • 发表时间:
    2020-02-08
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Yu, Shuang;Yin, Yali;Xiao, Haipeng
  • 通讯作者:
    Xiao, Haipeng

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其他文献

microRNA与甲状腺肿瘤的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    国际内分泌代谢杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    喻爽;修玲玲;肖海鹏;YU Shuang;XIU Ling-ling;XIAO Hai-peng
  • 通讯作者:
    XIAO Hai-peng

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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