水稻中与水稻-稻瘟病菌相互作用相关的小RNA筛选鉴定

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31101406
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    23.0万
  • 负责人：
    李燕
  • 依托单位：
    四川农业大学
  • 学科分类：
    C1401.植物病理学
  • 结题年份：
    2014
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

近年来的研究证明植物中的小RNA（miRNA和siRNA）参与调控植物生长发育的各个信号途径，并能有效调控植物抗病性。在水稻中已经分离鉴定出几百个小RNA，但与水稻-稻瘟病菌相互作用相关的小RNA尚未见报道。稻瘟病是水稻的最重要病害之一，筛选鉴定出与之相关的小RNA必能帮助我们进一步认识水稻-稻瘟病菌的相互作用机制，进而研制广谱持久抗病水稻新种质。本项目拟用稻瘟病普感品种和其相应的含广谱抗病基因的近等基因系为材料，结合高通量测序和生物信息学分析，分别比较稻瘟病菌接种前后小RNA表达的差异，筛选鉴定与水稻感病和抗病相关的小RNA，长远目标是利用这些小RNA及其靶基因来研制稻瘟病的广谱持久抗病性。

结项摘要

利用在四川地区大田收集的稻瘟病菌种，对普感品种丽江新团黑谷（LTH）和普抗品种IRBLkm-Ts （带一个抗性基因位点Pikm）接种后0，12及24小时提取小RNA进行高通量测序及分析，筛选到了33个受稻瘟病菌调控的miRNA。RNA杂交实验验证了其中部分miRNA的表达与测序基本一致，证明我们的测序结果可靠。根据这些miRNA在感病和抗病品种中受稻瘟病调控的不同表达水平，我们将这些miRNA分为三类，即抗性正调因子，负调因子以及基础抗性因子。我们挑选了其中的miRNA160a和miRNA398b构建了过表达的转基因水稻材料。接菌实验证明miRNA160a和miRNA398b转基因材料上稻瘟病菌的侵染显著低于对照材料。稻瘟病菌侵染诱导的抗性标志基因OsPR1和OsPR10和PBZ1的转录水平在转基因材料上显著高于对照材料。另外，PTI标志基因KS4， NAC4的转录水平在miRNA398b材料上的表达显著高于对照，说明miRNA398b参与了水稻对稻瘟病菌的PTI抗性（早期抗性），而miRNA160则可能调控水稻对稻瘟病的后期抗性（ETI抗性）。.本项目基本完成预期目标，完成对水稻中参与调控稻瘟病抗性的miRNA的初步筛选，获得部分转基因水稻材料用于后续研究，研究成果发表两篇SCI论文，累积影响因子超过8.

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Mechanism of plantemicrobe interaction and its utilization in disease-resistance breeding for modern agriculture
植物微生物互作机制及其在现代农业抗病育种中的应用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Physiological and Molecular Plant Pathology
  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Yan Li;Fu Huang;Yuangen Lu;Yi Shi;Min Zhang;Jing Fan;Wenming Wang
  • 通讯作者：
    Wenming Wang
Multiple rice miRNAs are involved in immunity against the blast fungus Magnaporthe Oryzae
多种水稻 miRNA 参与抗稻瘟菌 Magnaporthe Oryzae 的免疫
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Plant Physiology
  • 影响因子：
    7.4
  • 作者：
    李燕
  • 通讯作者：
    李燕

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
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