血清中“不可见”小分子代谢物定量测定的NMR方法研究

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基本信息

项目摘要

Quantitative determination of small molecule metabolites in blood serum or blood plasma is crucial to the clinical disease diagnosis or health assessment. NMR spectral-editing techniques are powerfull tools for quantitative analysis of serum metabolites because these techniques can quantify the metabolites in serum without the need of pretreatment. But existing NMR methods cannot quantify metabolites which bind to serum proteins. Our preliminary studies have shown that by adding small molecule compounds which bind strongly with serum proteins, some serum metabolites NMR signal is greatly enhanced. This indicates that metabolites which bind to biological macromolecules in serum can be replaced by strong binding small molecule compounds by competitive binding, and therfore turn bonded metabolites into free metabolites and NMR "invisible" signals into "visible". These make the quantitative determination of metabolites which bind to serum protein possible. Using small molecule drugs as competitive binding ligands, the project would build a NMR model for quantitative detection of bonded serum metabolites. It is of great significance to the human disease diagnosis and health assessment.
血清或者血浆中小分子代谢物的含量测定是临床疾病诊断或健康水平评估的依据。NMR谱编辑技术无需对血清样品进行预处理就可以检测血清中代谢物的含量,是血清代谢物定量分析强有力的手段。但现有的NMR方法不能定量测定在血清中与蛋白质结合的代谢物。我们的初步研究表明,在血清中加入与血清蛋白质有强结合作用的小分子化合物,可使血清中某些代谢物信号大大增强。这就表明强结合小分子化合物可通过竞争结合原理置换出血清中与生物大分子结合的小分子代谢物,使结合态代谢物变成游离态代谢物,使其NMR信号由"不可见"变为"可见",从而使与血清蛋白有结合作用的代谢物的定量测定成为可能。本项目拟以与血清蛋白有强结合作用的小分子药物作为竞争结合配体,建立测定血清中与蛋白结合的小分子代谢物含量的NMR方法,这对于血清代谢物的定量检测、人类疾病诊断及健康水平评估等均具有重大的意义。

结项摘要

血清或者血浆中小分子代谢物的含量测定是临床疾病诊断或健康水平评估的依据。但由于代谢多样性的存在,很难确定靶成分在血浆中的正常浓度范围。且许多代谢物在血清中通常以与蛋白结合的形式存在。但现有的NMR方法不能定量测定在血清中与蛋白质结合而“不可见”的的代谢物。因此,探讨小分子化合物与血清蛋白质的结合机理,研究血清的代谢多样性,构建血清中“不可见”小分子代谢物定量测定的NMR方法对于人类疾病诊断、个性化治疗及健康水平评估等均具有重大的意义。. 本项目采用NMR方法对70个血清样本研究了人类代谢多样性,结果表明NMR结合主成分分析(PCA)可用于定量表征人类血浆代谢多样性。同时,这一多样性还与药物布洛芬(IBP)引起的变化高度相关(P<0.0001)。我们以IBP为竞争性强结合小分子化合物,分别采集加入IBP 前后血清样本的NMR谱,对加入IBP 后新增或明显增强的谱峰进行了信号归属、结构分析及含量测定,确定乳酸(lactate)、丙酮酸(pyruvate)、酪氨酸(tyrosine)、苯丙氨酸(phenylalanine)及组氨酸(histidine)为与血清蛋白有相互作用的小分子代谢物。大约2/3的乳酸以结合态形式存在于血清中,而丙酮酸则为40%,因此,乳酸与血清蛋白的相互作用强于丙酮酸。含量测定的结果表明,血清中的小分子代谢物浓度存在明显的个体差异。另外,我们分别采用分子对接及分子动力学模拟方法探讨了小分子化合物布洛芬(IBP)与血清蛋白质——人血清白蛋白(HSA)相互作用的机理、结合位点及结合能。结果表明HSA分子可与32个IBP分子形成稳定的复合物。IBP与HSA的IB、IIA、IIIA等结构亚域均有强的相互作用,这就解释了IBP对作用于除site 2以外结合中心药物的替代现象,也解释了HSA对IBP的多个结合中心,同时,通过对不同IBP分子对HSA的结合能分析,也揭示了药物蛋白相互作用的共结合现象。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
NMR实验参数对IBP-血浆相互作用个性化差异研究的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    波谱学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    纪竹生;刘买利;DU Yuan-yuan1,2,JI Zhu-sheng1*,LIU Mai-li1* [1.State Key Laboratory of Magnetic Resonance;Atomic;2.Graduate School of the Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China)
  • 通讯作者:
    2.Graduate School of the Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China)
NMR spectroscopic approach reveals metabolic diversity of human blood plasma associated with protein-drug interaction.
核磁共振波谱方法揭示了与蛋白质-药物相互作用相关的人血浆代谢多样性。
  • DOI:
    10.1021/ac401738z
  • 发表时间:
    2013-08
  • 期刊:
    Anal Chem
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jiang, Bin;Zhou, Xin;Li, Conggang;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili
Saturation transfer difference nuclear magnetic resonance study on the specific binding of ligand to protein
配体与蛋白质特异性结合的饱和转移差核磁共振研究
  • DOI:
    10.1016/j.ab.2008.11.022
  • 发表时间:
    2009-02-15
  • 期刊:
    ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Ji, Zhusheng;Yao, Zhongxiu;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili

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其他文献

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纪竹生的其他基金

复杂体系个体差异的NMR表征及其在药物相互作用方面的应用
  • 批准号:
    20975112
  • 批准年份:
    2009
  • 资助金额:
    34.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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