水稻粒长基因GS3-2的图位克隆及其分子生物学机理研究

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基本信息

  • 批准号：
    30971550
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    何予卿
  • 依托单位：
    华中农业大学
  • 学科分类：
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

水稻长粒是水稻优质性状之一同时也是重要的产量性状。本研究在前期发现并精细定位水稻第3染色体上控制粒长主效QTL（GS3-2）和构建的珍汕97（GS3-2）近等基因系材料的工作基础之上，通过基于图谱的基因克隆法克隆GS3-2基因。同时通过转基因技术、互补测验进一步验证GS3-2基因，利用RNAi抑制技术、cDNA芯片技术以及RT-PCR等获得与GS3-2表达的相关基因及其差异表达模式。另外结合酵母双杂交试验、表达谱分析和亚细胞定位技术探讨GS3-2的分子生物学机理。研究结果为培育高产优质水稻新品种提供理论依据。

结项摘要

【摘要】：对两籼稻珍汕97和SLG杂交而来的重组自交系分析粒型形状，我们检测一个位于第三染色体上在SSR标记RM156和MGR2513之间的一个粒长QTL——qGS3.2。通过大小为396株的，对qGS3.2的随机群体的QTL分析发现，该QTL可以解释群体粒长变异的27.31%，其加性效应为0.65mm。通过发展大群体，克隆粒长基因GS3.2。该基因属不完全显性基因，在表型上，杂合基因型的表型值位于纯和基因型的表型值之间。GS3.2位于STS标记S144和S153之间，大约40kb的区段内。通过对双亲间基因组内比较测序和水稻开花期的基因表达模式的分析，确定了4个候选基因分别命名为GS3.2-1、GS3.2-2、GS3.2-3和GS3.2-4。对这四个候选基因分别进行遗传转化，确定GS3.2并分析其功能，并根据实验结果，推断GS3.2是位于qGS3.2内不同于GL3.1的一个微效粒长基因。

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
水稻株高ＱＴＬ Ｑｐｈ１的精细定位
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    华中农业大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿
Identification of quantitative trait loci for grain size and the contributions of major grain-size QTLs to grain weight in rice
水稻粒级数量性状位点鉴定及主要粒级QTL对粒重的贡献
  • DOI：
    10.1007/s11032-012-9802-z
  • 发表时间：
    2013-03
  • 期刊：
    Molecular Breeding
  • 影响因子：
    3.1
  • 作者：
    何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿
利用分子标记辅助选择和花药培养改良光温敏不育系Y58S 的稻瘟病 抗性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    基因组学和应用生物学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿
Natural variation in GS5 plays an important role in regulating grain size and yield in rice
GS5 的自然变异在调节水稻籽粒大小和产量方面发挥着重要作用
  • DOI：
    10.1038/ng.977
  • 发表时间：
    2011-12-01
  • 期刊：
    NATURE GENETICS
  • 影响因子：
    30.8
  • 作者：
    Li, Yibo;Fan, Chuchuan;Zhang, Qifa
  • 通讯作者：
    Zhang, Qifa
利用花药培养和分子标记选择相结合改良水稻稻瘟病和褐飞虱抗性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    分子植物育种
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿

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其他文献

利用高世代回交群体定位水稻抽穗期和株高QTL
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    分子植物育种
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    蒋海潮;高冠军;张庆路;何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿
利用RIL群体比较定位糙米和精米蛋白质含量的QTL
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    分子植物育种
  • 影响因子：
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  • 作者：
    何予卿;钟明;罗利军;王令强
  • 通讯作者：
    王令强
利用籼粳交探讨水稻株高和抽穗期
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
    分子植物育种，2006，4（4）：527－534
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    曾晶;姜功好;何予卿;张端品
  • 通讯作者：
    张端品
水稻糙米中维生素E相关QTL分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    分子植物育种
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    高冠军;张庆路;罗利军;何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿
水稻柱头外露率QTL定位
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    分子植物育种
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    高冠军;张庆路;罗利军;何予卿
  • 通讯作者：
    何予卿

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利用永久群体探讨亚种间杂交稻籽粒充实度的遗传基础
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    面上项目

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  • 批准号：
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相似海外基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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