长海带与狭叶海带的种群遗传动力学研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900279
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0208.植物资源保护与利用
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Saccharina japonica is one of important marine crop in China. To understand the genetic diversity, genetic structure and interspecies isolation characteristics of the wild relatives of S. japonica are beneficial to the genetic selection and breeding for cultivated kelp. With simplified genome sequencing technology (2b-RAD), we aim to conduct the population genetic and comparative phylogeographic study for S. longissima and S. angustata. The objectives of our study are: 1) to explore genetic diversity and genetic differentiation patterns; 2) to explain the genetic structure patterns and mechanisms of demographic history; 3) to investigate the range shift and suitable distribution areas of the kelp with ecological niche models, and predict how the climate influence the distribution of these two relatives. We will conduct comprehensive research of population dynamics based on marine environmental data, genetic data and ecologic data. Our results will be important for the genetic improvement and effective use of wild germplasm of S. japonica, but also beneficial for biodiversity conservation of kelp resources in the Northwestern Pacific.
海带是中国海藻养殖产业的重要品种之一,厘清其原产地(北海道沿岸)海带近缘种的遗传多样性现状、种群结构和种间隔离特征等,是突破我国养殖海带种类单一和资源退化等瓶颈、保持海带养殖产业可持续发展的重要途径。本项目基于简化基因组(2b-RAD)技术对具有引种价值的2个近缘种(长海带和狭叶海带)进行群体进化和比较系统地理学研究,旨在:1)解析海带近缘种的多样性分布和种群遗传分化模式,检测近缘种间是否存在基因渐渗;2)探讨海带近缘种时空遗传格局及潜在的种群变动机制;3)基于生态位模型重建海带近缘种自末次冰盛期以来的扩散动态及适生分布,预测全球气候变暖对近缘种地理分布区的影响。本项目通过整合海洋气候、遗传及生态环境等多维数据,系统解析海带近缘种的种群动力学过程,相关结果不仅有助于我国海带杂交选育和野生种质资源的引种,而且可为西北太平洋沿岸海带属海藻的多样性保护提供重要理论指导。

结项摘要

海带养殖业是我国水产养殖的支柱产业之一,养殖海带产量位居世界第一。近年来,我国养殖海带面临种质退化、产量下降、抗病(逆)能力下降等诸多瓶颈问题,严重制约我国海带产业的可持续发展。野生海带变种及其近缘种是我国海带品系选育中最具有应用前景的种质资源,但缺乏对其遗传背景的详细了解。本研究基于线粒体标记、微卫星标记及全基因组SNP标记,从种群遗传学的角度厘清了原产地野生海带的遗传背景。主要研究目标包括:1)探明了野生海带及其近缘种的遗传多样性水平及遗传结构,检测了自然界中近缘种间的杂交水平;2)厘清野生海带及其近缘种间的起源演化关系;3)预测了全球气候变暖的背景下,海带及其近缘种的地理分布动态。相关结果不仅可以为野生海带种质资源的保护提供科学指导,还可为我国优质海带品种的培育和改良提供理论依据,这对解决我国海带养殖业现存问题、实现可持续发展具有重要的科学意义。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Detecting no natural hybridization and predicting range overlap in Saccharina angustata and Saccharina japonica
检测甜椒和粳稻的无自然杂交并预测范围重叠
  • DOI:
    10.1007/s10811-020-02300-3
  • 发表时间:
    2020-10
  • 期刊:
    Journal of Applied Phycology
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Jie Zhang;Norishige Yotsukura;Alex;er Jueterbock;Zi-Min Hu;Jorge Assis;Chikako Nagasato;Jianting Yao;Delin Duan
  • 通讯作者:
    Delin Duan
Genetic linkage map construction and QTL mapping of blade length and width in Saccharina japonica using SSR and SNP markers
利用SSR和SNP标记构建粳稻叶片长宽遗传连锁图谱及QTL定位
  • DOI:
    10.3389/fmars.2023.1116412
  • 发表时间:
    2023-01
  • 期刊:
    Frontiers in Marine Science
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Xiuliang Wang;Xiaoqi Yang;Jianting Yao;Qiuying Li;Chang Lu;Delin Duan
  • 通讯作者:
    Delin Duan
Status of genetic studies and breeding of Saccharina japonica in China
我国甘蔗遗传研究及育种现状
  • DOI:
    10.1007/s00343-020-0070-1
  • 发表时间:
    2020-07
  • 期刊:
    Journal of Oceanology and Limnology
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Xiuliang Wang;Jianting Yao;Jie Zhang;Delin Duan
  • 通讯作者:
    Delin Duan
Genome-Wide Mapping of Cytosine Methylation Revealed Dynamic DNA Methylation Patterns Associated with Sporophyte Development of Saccharina japonica.
全基因组胞嘧啶甲基化图谱揭示了与糖精孢子体发育相关的动态 DNA 甲基化模式
  • DOI:
    10.3390/ijms22189877
  • 发表时间:
    2021-09-13
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Yang X;Wang X;Yao J;Duan D
  • 通讯作者:
    Duan D

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    张杰

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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