折叠酶DsbA、DsbC、PDI在活细胞内和天然底物蛋白相互作用的分子机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31100559
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

二硫键的形成是蛋白质氧化折叠(oxidative protein folding)的关键步骤,对蛋白质的结构稳定性和功能都有重要的作用。所有生物体内都有一类折叠酶(foldase),例如大肠杆菌的DsbA和DsbC以及哺乳动物的PDI,负责催化其底物蛋白形成正确的二硫键。大量研究揭示了折叠酶在体外的催化机理以及结合模式底物蛋白的位点,但目前还不十分清楚其在体内的作用机制,例如,折叠酶在活细胞中催化哪些天然底物蛋白形成二硫键?依靠哪些残基识别、结合数百种天然底物蛋白?在体内研究这些问题受到技术手段的限制。近几年发展的非天然氨基酸标记法,可以定点引入目标蛋白并能进行体内交联反应,正成为研究体内蛋白质相互作用的有力手段。本申请中,我们将利用此方法,探测折叠酶(DsbA、DsbC、PDI)在体内结合天然底物蛋白的位点,鉴定其天然底物蛋白,并力图揭示折叠酶催化天然底物蛋白形成二硫键的生物学意义。

结项摘要

本项目的主要内容是通过化学交联和非天然氨基酸光交联的方法研究活细胞中二硫键形成相关的折叠酶(DsbA、DsbC、PDI)和天然底物蛋白的相互作用,并揭示这些相互作用的意义。项目执行三年后,总体完成了任务,获得了不少新的发现,包括系统地鉴定了折叠酶DsbA的底物结合位点,确定了DsbC的天然底物蛋白,进一步揭示了DsbC在不同生理条件下(热休克和氧化胁迫)和天然底物蛋白相互作用的生物学意义,也发现了胰腺特异表达的PDI表现出不依赖于酶活的分子伴侣活性,并能调控雌激素的生物学活性和功能。本研究为进一步了解活细胞中DsbA/DsbC催化二硫键形成的生物学功能奠定了良好基础,并暗示了DsbC在活细胞中可以不依赖于酶活而独立发挥其分子伴侣功能。总计发表代表性SCI论文1篇,另有受该基金标注支助的SCI论文7篇(均为第一作者或通讯作者),还有部分数据正撰写论文。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Chaperone-dependent mechanisms for acid resistance in enteric bacteria
肠道细菌耐酸性的分子伴侣依赖性机制
  • DOI:
    10.1016/j.tim.2012.03.001
  • 发表时间:
    2012-07-01
  • 期刊:
    TRENDS IN MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    15.9
  • 作者:
    Hong, Weizhe;Wu, Ye E.;Chang, Zengyi
  • 通讯作者:
    Chang, Zengyi
Chaperone function and mechanism of small heat-shock proteins
小热休克蛋白的伴侣功能和机制
  • DOI:
    10.1093/abbs/gmt152
  • 发表时间:
    2014-05-01
  • 期刊:
    ACTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA SINICA
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Fu, Xinmiao
  • 通讯作者:
    Fu, Xinmiao
strongIn vivo substrate diversity and preference of small heat shock protein IbpB as revealed by using a genetically incorporated photo-crosslinker/strong
通过使用基因整合的光交联剂揭示了小热休克蛋白 IbpB 的体内底物多样性和偏好
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Fu X;Shi X;Yan L;Zhang H;Chang Z
  • 通讯作者:
    Chang Z
DegP primarily functions as a protease for the biogenesis of beta-barrel outer membrane proteins in the Gram-negative bacterium Escherichia coli
DegP 主要作为革兰氏阴性细菌大肠杆菌中 β-桶外膜蛋白生物发生的蛋白酶发挥作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    FEBS Journal
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Ge, Xi;Wang, Rui;Ma, Jing;Liu, Yang;Ezemaduka, Anastasia N.;Chen, Peng R.;Fu, Xinmiao;Chang, Zengyi
  • 通讯作者:
    Chang, Zengyi
Small Heat Shock Protein IbpB Acts as a Robust Chaperone in Living Cells by Hierarchically Activating Its Multi-type Substrate-binding Residues
小热休克蛋白 IbpB 通过分层激活其多类型底物结合残基,在活细胞中充当强大的伴侣
  • DOI:
    10.1074/jbc.m113.450437
  • 发表时间:
    2013-04-26
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Fu, Xinmiao;Shi, Xiaodong;Chang, Zengyi
  • 通讯作者:
    Chang, Zengyi

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其他文献

ATP合酶旋转催化的一种新机制
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国科学:生命科学
  • 影响因子:
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  • 作者:
    刘佳峰;付新苗;昌增益
  • 通讯作者:
    昌增益

其他文献

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大肠杆菌ATP合酶的旋转催化机理和酶活调控研究
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    面上项目
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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