乳腺癌病人血清microRNA 表达谱:一种潜在的乳腺癌筛选标记

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基本信息

  • 批准号:
    81102182
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

早期乳腺癌患者通常缺乏明显的临床体征,而且目前临床上尚无有效的早期辅助诊断方法,多数病例在确诊时已是中晚期,治疗效果不佳,预后较差。因此寻找乳腺癌的前期发病标志,对于乳腺癌的早期诊治及实施一级预防具有重大意义。本课题拟采用小RNA测序方法,建立乳腺癌病人肿瘤组织和血清中miRNA表达谱;并采用生物信息学分析找出关键miRNAs,通过Real-Time PCR 鉴定其有效性,进一步在乳腺肿瘤病人中验证其灵敏度和特异性,阐明乳腺癌病人血清microRNA表达谱作为潜在的乳腺癌筛选生物标志的可靠性,为今后乳腺癌的早期诊断和预后判断提供重要的基础研究资料。

结项摘要

早期乳腺癌患者通常缺乏明显的临床体征,而且目前临床上尚无有效的早期辅助诊断方法,多数病例在确诊时已是中晚期,治疗效果不佳,预后较差。因此寻找乳腺癌的前期发病标志,对于乳腺癌的早期诊治及实施一级预防具有重大意义。近年来,越来越多的研究表明microRNA(miRNA)能够作为癌症的生物学标志。而在血液中检出癌症特异性的miRNA并将其作为癌症的生物学标志对于早期诊断癌症则具有至关重要的意义。本课题分别建立肿瘤组织和血清miRNA表达谱,经比对分析,发现7个miRNA(miR-103, miR-23a, miR-29a, miR-222, miR-23b, miR-24 and miR-25)在乳腺肿瘤组织和乳腺癌病人血清中都发生上调改变。对候选miRNAs进行两轮筛选,首先在小样本中(50份未经放疗和化疗的原发性乳腺癌病人肿瘤组织和癌旁组织),检测7个miRNAs的表达情况,发现miR-222在乳腺肿瘤组织中上调表达(P<0.05)。然后再在大样本中(未经放疗和化疗的原发性乳腺癌病人(100例)、乳腺良性肿瘤病人(乳腺纤维瘤、乳腺囊性增生病、乳腺大导管乳头状瘤、脂肪瘤,20例),卵巢癌病人(20例)和正常对照(100例)血清)验证其灵敏度和特异性。结果发现miR-222在乳腺癌病人血清中表达高于健康对照组,P=0.0032,差异有统计学意义。ROC曲线分析显示血清miR-222可以区分乳腺肿瘤病人和健康人)。而且miR-222在乳腺肿瘤病人,健康对照,乳腺良性肿瘤病人和卵巢癌病人血清中表达有明显差异(P=0.006),提示miR-222可能是潜在的乳腺肿瘤筛选标志物。同时针对前期测序结果利用生物信息学分析发现一新型miRNA,命名为miR-BS1,从二级结构,系统保守性,表达,生物功能,靶基因预测分析等方面综合验证其真实性。将不同物种miR-BS1成熟序列进行多序列比对分析,发现为第5位到第11位以及第13位到第17位碱基为保守碱基,说明miR-BS1基因在不同物种间的高度保守性。Real-Time PCR测定miR-BS1在乳腺肿瘤组织和乳腺肿瘤病人血清中的差异表达,发现miR-BS1在肿瘤组织和肿瘤病人血清中表达均下调。双荧光报告分析显示,miR-BS1可以显著抑制含KRAS 3’-UTR的报告基因活性。认为miR-BS1可能是一潜在的有功能的新miRNA。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification and characterization of novel microRNA candidates from deep sequencing
通过深度测序鉴定和表征新型 microRNA 候选物
  • DOI:
    10.1016/j.cca.2012.11.002
  • 发表时间:
    2013-01-16
  • 期刊:
    CLINICA CHIMICA ACTA
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Wu, Qian;Wang, Chao;Lu, Zuhong
  • 通讯作者:
    Lu, Zuhong
Global Analysis of miRNA Gene Clusters and Gene Familiesbr / Reveals Dynamic and Coordinated Expression
miRNA 基因簇和基因家族的全局分析揭示了动态和协调的表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Biomed Research International
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    li guo;sheng yang;yang zhao;hui zhang;qian wu;feng chen
  • 通讯作者:
    feng chen
microRNA在乳腺肿瘤诊治和预后中的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    医学综述
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈丽君;曹广义;王超;吴倩
  • 通讯作者:
    吴倩
Analysis of serum genome-wide microRNAs for breast cancer detection
用于乳腺癌检测的血清全基因组 microRNA 分析
  • DOI:
    10.1016/j.cca.2012.02.016
  • 发表时间:
    2012-07-11
  • 期刊:
    CLINICA CHIMICA ACTA
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Wu, Qian;Wang, Chao;Ge, Qinyu
  • 通讯作者:
    Ge, Qinyu
ER~+和ER~-乳腺肿瘤细胞中mRNA和非编码RNA的表达模式
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蔡晶晶;杨晟;张慧;郭丽;陈峰;吴倩
  • 通讯作者:
    吴倩

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    2018
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    范刚;王永红;吴倩
  • 通讯作者:
    吴倩

其他文献

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基于多组学分析的多环芳烃孕期暴露对子代哮喘影响的生物标志筛选和识别研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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