中国结核分枝杆菌系统流行病学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81273144
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    60.0万
  • 负责人：
    李卫民
  • 依托单位：
    首都医科大学
  • 学科分类：
    H3009.传染病流行病学
  • 结题年份：
    2016
  • 批准年份：
    2012
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Tuberculosis is still one of seriously publish health problems in china. The study utilized the concept of "system epidemiology", that means extended TB epidemiology based on system biology approaches. The content was composed of four parts. 1) The ten Chinese representative Mycobacterium tuberculosis (including Beijing/W lineage) was implemented genomic sequences and achieved their phylogenetic resolution. 2) It was analyzed evolutionary characteristics of T, B cell and MHC binding (ⅠandⅡ）epitopes and explored the effect human immunity on M.TB by immune epitope database and analysis resource. 3) Base on above results, we would screen a set of SNP, which was suitable to genotype Chinese M.TB, and further use them to evaluate the phylogeographical population structure of M.TB and describe the Chinese M.TB spatio-temporal epidemic.4) We also would analyze the reason that Beijing/W lineage M.TB dominate in local area by the function alteration of PknA gene. In a word, the result of this study would provide some data for the Chinese prevention and control of TB.
在中国结核病仍然为严重的公共卫生问题之一。本研究围绕系统流行病学的概念，以系统生物学为基石，发展结核流行病学。具体包括四部分内容：1）对有中国代表性的10株结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis M.TB）(含北京/W谱系)进行全基因组序列分析，分析其系统进化特征；2）通过免疫表位数据库（IEDB），分析中国M.TB的T, B细胞抗原表位和MHC（Ⅰ和Ⅱ）结合表位的系统进化特征，探讨人免疫反应对M.TB的影响。3）在此基础上筛选出适合中国M.TB的一套SNP位点；利用这套SNP位点评价中国M.TB发育-地理的群结构特征以及从时间和空间描述其流行特征。4）通过分析PknA基因功能的变化，初步探讨北京/W及其亚谱系M.TB的适应性。总之该工作的研究结果必将为我国结核病的预防和控制提供更为科学的依据。

结项摘要

1.鉴定78个谱系/亚谱系的SNP（位点）方法的建立。通过对2372个结核菌全基因组序列分析（Genbank数据库免费下载），极大似然法构建系统进化树，筛选出能够鉴定78个谱系/亚谱系的285个SNP位点。该套SNP分类靶标为研究中国M.TB的发育-地理的群结构特征奠定基础（目前专利正在审理中）。.2.从系统进化的角度初步描述了中国M.TB时间、空间流行特征：1）采用VNTR分析北方五省流行的212株北京谱系M.TB，估算出其最近共祖年代（the time of most recent common ancestor (TMRCA)）时间为 5073(95%CI 4000-6200)；2）采用LSP分析413株四川盆地流行的M.TB，发现欧美谱系的流行程度为42.8%(181/413)，进入该地区可能源于720 年前的一次历史事件；3）采用LSPs和MLSA分析187株新疆和甘肃流行的M.TB，发现在新疆除北京谱系(42.1%; 56/133)、欧美谱系(33.1%; 44/133)外，还存在东非-印度谱系(24.8%; 33/133)；而且北京谱系的流行于病人咯血和发热密切相关（p<0.05）；4）采用LSP分析中国耐药性基线调查的3929株M.TB，提示在中国，北京谱系M.TB（lineage 2 ）在东、北部流行程度高；南、西部地区，欧美谱系M.TB(lineage 4) 流程程度较高；东非-印度谱系M.TB(lineage 3)在新疆、西藏地区出现；而在福建和广东发现了环印度洋谱系M.TB(lineage 1) ；5）采用LSP和VNTR-15基因分型方法和PCA和population structure软件对中国耐药性基线调查的3929株M.TB的群体遗传分析提示，在中国，北京谱系M.TB（lineage 2 ）的传播与人口流动密切相关（数据正在处理中）。上述的结果为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据。.3. M.TB适应性研究的结果：1）围绕分枝杆菌噬菌体SWU1 gp39的生物学研究提示，SWU1 gp39蛋白通过改变细胞壁的通透性，对各种药物和外界环境压力更敏感。该结果为结核菌休眠机制的研究提供平台；2）通过比较不同谱系M.TB的全基因组水平上的差异，鉴定出北京谱系强烈分化的，与休眠密切相关的基因，例如：Rv1720c。

项目成果

期刊论文数量（11）
专著数量（0）
科研奖励数量（1）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
北京市昌平区肺结核发病数ARIMA模型预测
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    疾病监测
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王路钦;张峣;李卫民;高基民
  • 通讯作者：
    高基民
The Epidemiological Characteristics of Beijing Lineage Mycobacterium tuberculosis from a National Referral Center in China
中国国家转诊中心北京系结核分枝杆菌的流行病学特征
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    Biomed Environ Sci
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    DAI Wen Tao;HUANG Yan Feng;LI Ying;LI Wei Min
  • 通讯作者：
    LI Wei Min
Mycobacteriophage SWU1 gp39 can potentiate multiple antibiotics against Mycobacterium via altering the cell wall permeability.
分枝杆菌噬菌体 SWU1 gp39 可通过改变细胞壁通透性来增强多种抗生素对抗分枝杆菌的作用
  • DOI：
    10.1038/srep28701
  • 发表时间：
    2016-06-28
  • 期刊：
    Scientific reports
  • 影响因子：
    4.6
  • 作者：
    Li Q;Zhou M;Fan X;Yan J;Li W;Xie J
  • 通讯作者：
    Xie J
The discovery, function and development of the variable number tandem repeats in different Mycobacterium species
不同分枝杆菌属中可变数量串联重复序列的发现、功能和发展
  • DOI：
    10.3109/1040841x.2015.1022506
  • 发表时间：
    2016-01-01
  • 期刊：
    CRITICAL REVIEWS IN MICROBIOLOGY
  • 影响因子：
    6.5
  • 作者：
    Sun，Zhaogang;Li，Weimin;Huang，Hairong
  • 通讯作者：
    Huang，Hairong
Differences in the population of genetics of Mycobacterium tuberculosis between urban migrants and local residents in Beijing, China
北京市城市流动人口与本地居民结核杆菌遗传学群体差异
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.0366-6999.20130216
  • 发表时间：
    2013-11-05
  • 期刊：
    CHINESE MEDICAL JOURNAL
  • 影响因子：
    6.1
  • 作者：
    Dai Guang-ming;Zhang Zhi-guo;Li Chuan-you
  • 通讯作者：
    Li Chuan-you

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

黄芪散对2型糖尿病大鼠心肌MG53/PPAR-α通路的影响
  • DOI：
    10.13422/j.cnki.syfjx.2017090123
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中国实验方剂学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    高颖;秦阳;王春怡;高英;李卫民
  • 通讯作者：
    李卫民
黄芪散有效部位群对Ⅱ型糖尿病大鼠肝脏AMPK/SREBP-1c通路的影响
  • DOI：
    10.19378/j.issn.1003-9783.2018.06.001
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    中药新药与临床药理
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王春怡;郝梦娇;胡方利;许沛鑫;李卫民
  • 通讯作者：
    李卫民
体异质结有机光伏电池物理性能模拟
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    太阳能学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    孙秀泉;李卫民;郭金川;周彬
  • 通讯作者：
    周彬
一种基于改进区分矩阵的属性约简
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机工程与应用（2007年32期）
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陶志;刘庆拯;李卫民
  • 通讯作者：
    李卫民
基于决策支持度的不完备信息系统
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中山大学学报（2007年02期）
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陶志;商维;李卫民
  • 通讯作者：
    李卫民

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

李卫民的其他基金

基于基因组流行病学的耐多药结核病社区传播精准溯源及细菌学危险因素研究
  • 批准号：
    82373641
  • 批准年份：
    2023
  • 资助金额：
    49 万元
  • 项目类别：
    面上项目
结核分枝杆菌谱系3在南疆4区（州）遗传进化规律的研究
  • 批准号：
    U1903118
  • 批准年份：
    2019
  • 资助金额：
    57 万元
  • 项目类别：
    联合基金项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码