长链非编码RNA-NR037844在肝癌转移过程中的功能及机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81402325
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

In recent years, metastasis and recurrence of hepatocellular carcinoma (HCC) has been the biggest obstacle to affect the postoperative survival of HCC. Therefore, investigating the molecular mechanism of recurrent and metastasis has important theoretical guidance and clinical significance. In this research, we carried out a genome-wide lncRNA microarray analysis through different transfer potential of HCC lines. The results revealed differential expression of a subset of lncRNAs, notably a specific differentially expressed lncRNA NR037844. To validate microarray analysis findings, we randomly selected lncRNAs among the differential lncRNAs and analyzed their expression using qRT-PCR in 43 pairs of HCC and corresponding nontumor liver tissues, as well as 97L 97H and LM3 cell lines. The results confirmed that the lncRNA NR037844 was up-regulated in HCC tissues and cell lines with varying degrees. Furthermore, we find that it can promote the proliferation, migration and invasion ability of HCC cell lines. While the regulation mechanism of lncRNA NR037844 during HCC metastasis is still unknown and the biology function also needs to be verified. Based on the above results, we will further study the possible interacting protein of the lncRNA NR037844 and then explore the molecular mechanism of the lncRNA NR037844 in HCC. In addition, we will examine the expression levels of the lncRNA NR037844 in a large sample of liver tissues to determine the correlation between lncRNA NR037844 expression and metastasis, prognosis, recurrence and survival of HCC patients. Taken together, our results will identify the contribution of lncRNA NR037844 in hepatocarcinogenesis, and determine whether deregulation of the lncRNA NR037844 could be used as prognostic biomarkers of HCC.
肝癌的转移和复发是影响肝癌术后生存的最大障碍,因此探讨肝癌转移复发的分子机理,具有重要的理论指导和临床应用意义。本研究通过lncRNA/mRNA表达谱芯片筛选了不同转移潜能的肝癌细胞系中关键的lncRNA NR037844, 研究证实其在43对肝癌组织中表达上调及在不同转移潜能的肝癌细胞系97L、97H、LM3表达逐渐上调,并且可以促进肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。但NR037844调控肝癌转移的机制尚不明,其对肝癌的生物学作用也有待验证。因此我们将进一步研究NR037844在肝癌转移中发挥功能的分子机制,寻找NR037844可能的作用蛋白,探索其调控机制;本项目还将在大样本肝癌组织中检测NR037844的表达水平,结合临床资料分析其与肝癌转移、预后、生存期等临床指标的相关性,为肝癌诊断提供参考。

结项摘要

肝癌的转移和复发是影响肝癌术后生存的最大障碍,因此探讨肝癌转移复发的分子机理,具有重要的理论指导和临床应用意义。本研究利用lncRNA/mRNA 表达谱芯片技术,筛选不同转移潜能的肝癌细胞系(97L、97H、LM3)中差异表达的lncRNA 1051 个,mRNA 528 个。利用生物信息学、多因素统计分析等手段对差异lncRNA 及mRNA 进行聚类分析、表达差异基因筛选、共表达网络分析及GO、Pathway 分析,并对差异的lncRNA 进行了功能预测,确定了与肝癌转移有关的候选lncRNA LRATS(lncRNA NR037844), 研究证实其在43对肝癌组织中表达上调及在不同转移潜能的肝癌细胞系97L、97H、LM3表达逐渐上调,并且通过细胞及裸鼠的体内外实验证实:lncRNA LRATS 可以促进肝癌细胞的增殖及迁移能力,在裸鼠体内可促进肝癌的增殖及转移能力。机制方面:申请者通过研究证实了lncRNA LRATS 可在体内外通过与绝缘子CTCF 在空间染色质结构水平相互靠近形成失活的loop 环而抑制了APC 基因表达,致使Wnt/β-Catenin 信号通路激活,从而通过上调此信号通路的下游靶分子C-myc、Cyclin D1 的表达最终促进了肝癌细胞增殖,通过调节E-cadherin、MMP-7 促进了肝癌细胞迁移。并且缺氧促进了染色质组蛋白乙酰化作用上调了lncRNA LRATS 的表达。此外,在大规模肝癌组织中进一步验证了lncRNA LRATS 的表达,结果显示lncRNA LRATS 在140 对肝癌组织中表达上调,并且其高表达与肝癌转移及血管侵袭有关;通过生存分析研究显示,lncRNA LRATS 可作为肝癌患者的一项重要的生物学预后指标。并且本研究明确了lncRNA LRATS 在肝癌转移过程中的作用,探索了其发挥功能的分子机制,为肝癌的发病机制提供新的思路,为阐明lncRNA 的调控机制提供理论依据,完善肝癌调控机制的表观遗传调控网络。

项目成果

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RNA去甲基化酶FTO介导的lncRNA-m6A修饰对肝癌细胞代谢重编程的调控作用及机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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