微驱动软物质体系的拓扑结构和集体动力学

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11474210
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    88.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A2012.液态、准晶与非晶态物理
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Soft matter system can be driven far from equilibrium with the emergence of multi-scale collective dynamics through micro-driven processes. Combined with experimental systems, this project focuses on the simulation and theoretical studies on the abnormal dynamics of topological defects excitated in active matter system in different symmetry and dynamical conditions. We start from simulation and then derive corresponding dynamic mean field equations which are further truncated into hydrodynamic equations by mode expansions. Using such powerful theoretical approaches, we are going to illustrate and understand the excitation mechanism of topological defects and their abnormal collective dynamics. We are going to investigate the topological defects emerging in polar, nematic, chiral, and crystal order states etc. We will analyze the dynamic instability mechanism and compute or simulate the evolution dynamics of topological defects. This project will not only promote our understanding on the dynamics of topological defects including their excitation, annihilation and transportation, but also help to illustrate the dynamic instability mechanism and the origin of collective motion in active matter systems.
软物质系统在微驱动力作用下可导致系统远离平衡态,出现多尺度的集体动力学效应。这类体系就是最近引起人们广泛关注的所谓活力物质体系。本项目旨在结合相关的实验研究,通过模拟和理论分析结合来研究该类物质中不同对称性和动力学条件下所激发出来的拓扑缺陷结构的反常动力学行为。我们采用从模拟出发,推导相关动力学平均场方程,再通过模量展开近似到流体动力学表述并求解。我们将通过这一系列理论手段阐明不同活力物质体系中拓扑缺陷的生成机制及其集体动力学。该项目中将系统地涉及到活力物质体系的极化序,向列相,动力学及结构手性,晶态等有序结构中可能涌现的拓扑缺陷结构,分析其动力学失稳机制,通过数值计算和模拟研究这些体系中的拓扑缺陷演化动力学。这一项目的开展,不仅将促进我们对活力物质中拓扑缺陷动力学(包括激发,湮灭及输运)的认识,同时也将更深刻地揭示活力物质体系的动力学失稳机制及相关的集体动力学行为。

结项摘要

活性物质是一类十分广泛存在的物质状态。它突破了人们对于物质体系能量输入的传统认识。在活性物质体系,个体单元可以将能量转变为各种力学运动。这类物质体系在微观层次进行能量输入,突破体系能量瓶颈,从而驱动系统远离平衡态。同时个体的运动可以通过相互作用耦合在大尺度展现出极为惊人的集体动力学行为。活性物质有序态的拓扑结构由于其特殊的拓扑性质,在体系的集体动力学中起到及其重要的作用【Shi & Ma, Nature Communs, 2013】。本项目通过理论模拟结合的手段,对活性物质体系拓扑结构的重要的物理特性进行了深入的研究。(1)对自驱动方向可逆型极化活性粒子活性物质体系的相变动力学进行了深入的研究。发现体系的有序态具有BKT拓扑序,而体系的有序无序相变则类似于连续相变,有别于二维的KT相变。进一步的研究发现,相变过程中拓扑缺陷的奇异动力学可能是导致这种相变的根源。(2)发展了一套粒子流场耦合的理论模拟方法,可以研究活性物质体系大尺度的集体动力学行为。利用这一方法成功解释了细菌体系菌落中观察到的大尺度椭圆轨道振荡行为。发现其中Stokes流体的不可压缩性是体系轨道发生压缩的原因。(3)利用相关模型定量化研究杆菌体系产生的拓扑结构动力学。并利用拓扑结构和流场的动力学量来匹配模型参数,从而可以在简化的粒子模型中定量重现拓扑缺陷在大时空尺度的生灭和自发迁移。相关工作分别发表于PRL, Nature及PNAS. 该项目的研究表明复杂如细菌菌落可以用一套非常简单的动力学方程精确描述。对活性物质体系的深入研究不仅对理解生命体系所展现的丰富动力学行为具有重要的作用,同时利用体系优越的非平衡性质,可以尝试建立普适的非平衡统计理论。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Fore-aft asymmetric flocking
前后不对称植绒
  • DOI:
    10.1103/physreve.96.020601
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Physical Review E
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Chen Qiu-shi;Patelli Aurelio;Chate Hugues;Ma Yu-qiang;Shi Xia-qing
  • 通讯作者:
    Shi Xia-qing
Self-Propelled Particles with Velocity Reversals and Ferromagnetic Alignment: Active Matter Class with Second-Order Transition to Quasi-Long-Range Polar Order
具有速度反转和铁磁排列的自驱动粒子:具有二阶跃迁到准长程极序的活性物质类
  • DOI:
    10.1103/physrevlett.120.258002
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Physical Review Letters
  • 影响因子:
    8.6
  • 作者:
    Mahault B.;Jiang X. -C.;Bertin E.;Ma Y. -Q.;Patelli A.;Shi X. -Q.;Chate H.
  • 通讯作者:
    Chate H.
Self-Propelled Rods: Linking Alignment-Dominated and Repulsion-Dominated Active Matter
自驱动棒:连接排列主导和排斥主导的活性物质
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018-07
  • 期刊:
    arXiv:1807.00294
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xia-qing Shi;Hugues Chaté
  • 通讯作者:
    Hugues Chaté
Data-driven quantitative modeling of bacterial active nematics
数据驱动的细菌活性向列相定量建模
  • DOI:
    10.1073/pnas.1812570116
  • 发表时间:
    2019-01-15
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Li, He;Shi, Xia-Qing;Zhang, H. P.
  • 通讯作者:
    Zhang, H. P.

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其他文献

活力物质的非平衡结构和动力学
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    物理
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    施夏清;马余强
  • 通讯作者:
    马余强

其他文献

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活力物质非平衡有序结构理论研究
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  • 项目类别:
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相似海外基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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