中国蜈蚣目物种多样性调查及药用物种转录组学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81373379
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3411.药物资源
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Venomous animals are the important drug resources, they secreted toxins can regulate ion channel specifically and constitute the abundant leading medicine resources. As one member of the "Five venomous", same as scorpions, spiders, and snakes, although centipedes have been used as a traditional Chinese folk medicine for a long time and have comprehensive medical purposes, but its toxin polypeptide research is relatively backward. The basic research of centipede taxonomy is incomplete in China, and this raises the difficult of species identification in the toxin studies of medical centipedes. The digging efficiency of centipede toxin polypeptides is reduced as international new functional gene detection methods and analysis methods were not adopted in time. This subject will systematically investigate the biodiversity of the order Scolopendromorpha of China, complete its taxonomy research; sequence the transcriptomes of the venom gland and body of five species (or subspecies) typical medical centipedes by High-throughput sequencing technology, construct the polypeptide genes resource library of Chinese medical centipedes, combining the molecular evolutionary analysis at the transcriptome level, finish the cloning, expression and functional identification of toxin polypeptides. We sequenced and analysised the global transcriptome of the Centipede (Hubei) Scolopendra subspinipes mutilans recently, and found many toxin polypeptide genes targeting ion channel protein. In the specific period for choosing the efficient regulatory polypeptides for many ion channels, to carry out tThis research will excavate the ion channel activity peptides of Chinese centipedes completely, and actively promote the rational development and utilization of Chinese medical centipede resources.
有毒动物是重要的药物资源,分泌的毒素多肽特异性调节离子通道功能,构成了丰富的药物资源库。相比于蝎、蛇、蜘蛛等有毒动物,同为五毒动物之一的蜈蚣,虽然药用历史长,疾病治疗作用广泛,但其毒素多肽开发研究相对滞后。我国蜈蚣分类学基础不完善,增加了药用蜈蚣毒素研究过程中物种鉴定的难度。为及时运用国际上新的功能基因检测手段和分析方法,提升对药用蜈蚣毒素多肽的挖掘和利用,本课题拟系统开展我国蜈蚣目物种多样性调查研究,完善我国蜈蚣目分类;对5种(亚种)具有代表意义的药用蜈蚣毒腺和去毒腺整体进行高通量转录组研究,构建我国药用蜈蚣毒素多肽功能基因资源库;结合转录组水平的分子进化分析,对有价值的毒素多肽进行表达纯化和功能鉴定。课题组前期对湖北少棘蜈蚣毒腺进行了全转录组测序和分析,提示存在多种靶向离子通道蛋白毒素多肽基因。开展本课题研究,将全面挖掘中国药用蜈蚣毒腺中离子通道调节肽,推动我国药用蜈蚣资源的开发利用。

结项摘要

蜈蚣药用历史长,疾病治疗作用广泛,但其毒素多肽开发研究相对滞后。为推动我国药用蜈蚣资源的开发利用,本课题拟系统开展我国蜈蚣目物种多样性调查研究,完善我国蜈蚣目分类;对具有代表意义的药用蜈蚣毒腺和整体进行高通量转录组研究,构建我国药用蜈蚣毒素多肽功能基因资源库;结合转录组水平的分子进化分析,对有价值的毒素多肽进行表达纯化和功能鉴定。.课题组通过对不同产地蜈蚣生存环境的调查,发现我国野生蜈蚣种类资源主要分布于长江以南,而长江以北物种较少;亚热带、热带地区和滇藏地区较北方温带丰富,为以后更广泛的蜈蚣资源调查及野生蜈蚣资源保护指明了方向。在对蜈蚣目物种进行资源调查过程中,目前收集已知物种19种和待发表新种6种,蜈蚣目标本库的建设有助于后续蜈蚣分类学研究的深入开展。.采用Ⅱ代转录组学测序技术,相继对收集的具潜在药用价值的六种蜈蚣目物种进行了全转录组学测序,测序的物种包括广西多棘蜈蚣、西藏贝氏耳孔蜈蚣、多刺耳孔蜈蚣、非洲卫蜈蚣、湖北少棘蜈蚣、湖北糙耳孔蜈蚣等。通过对六种蜈蚣的转录组学测序,有效保护了稀有物种的基因资源,为后续开展功能基因的生物活性鉴定提供了编码基因数据库。通过对转录组测序数据进行比较,发现不同产地的少棘蜈蚣毒素编码基因具有较大的变异性。通过对蜈蚣毒腺、去毒腺的蜈蚣残体及蜈蚣完整个体的转录组数据进行对比研究,能最大程度的挖掘蜈蚣来源的生物活性多肽编码基因。.联合使用转录组学测序和基因工程制备技术,表达纯化了50余种蜈蚣和蝎子源性的生物活性多肽并进行了质谱鉴定,部分进行了电生理学功能鉴定。阐明了Beta防御素多肽在病理性痒发生中所起的作用,揭示了蜈蚣叮咬致痒的分子机制。开发了一个基于Web的可视化系统,依托该系统设计了几种有关生物大分子3D结构局部观察研究的新方法和技术路线。在本项目资助下,课题组发现类维生素A通过激活辣椒素受体TRPV1而引起哺乳动物神经过敏反应。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Scorpiops ingens sp.nov.,found in Xizang, and an updated key of Scorpions from China(Scorpiones:Euscorpidae, Scorpiopinae)
西藏发现的 Scorpiops ingens sp.nov.,以及中国蝎子的更新检索表(蝎目:Euscorpidae、Scorpiopinae)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Shijin Yin;Yunfeng Zhang;Zhaohui Pan;Shaobin Li;Zhiyong Di
  • 通讯作者:
    Zhiyong Di
Chaerilus pseudoconchiformus sp. nov., a new species found in Xizang, and an updated key of the chaerilid scorpions from China (Scorpiones:Chaerilidae)
假贝壳状毛虫 sp.
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Shijin Yin;Yanning Qiu;Zhaohui Pan;Shaobin Li;Zhiyong Di
  • 通讯作者:
    Zhiyong Di
PDBlocal: A web-based tool for local inspection of biological macromolecular 3D structures
PDBlocal:基于网络的生物大分子 3D 结构局部检查工具
  • DOI:
    10.1142/s1793545818500025
  • 发表时间:
    2017-07
  • 期刊:
    Journal of Innovative Optical Health Sciences
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Pan Wang;Guangxiao Yang;Guangyuan He
  • 通讯作者:
    Guangyuan He
糙耳孔蜈蚣毒素多肽STX-Osp1的基因工程制备
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    生物技术世界
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陆春兰;陈璇;张丰;胡青兰;王冠;黄鑫;尹世金
  • 通讯作者:
    尹世金
用序列文本动态参照协助生物分子3D结构观察
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    华中科技大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王攀;何光源;杨广笑
  • 通讯作者:
    杨广笑

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端粒和端粒酶的发现及其与衰老和一些人类疾病的关系
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    黄文涛;郭向前;尹世金;戴甲培
  • 通讯作者:
    戴甲培
海南斑等蝎钾通道阻断剂 Im58 克隆、表达纯化与鉴定
  • DOI:
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  • 期刊:
    中南民族大学学报(自然科学版)
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  • 作者:
    尹世金
  • 通讯作者:
    尹世金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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