基于定量构效关系的铜绿假单胞杆菌脂肪酶及其折叠酶的分子改造

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31360216
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    45.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Lipases catalyze various chemical reactions such as esterification,alcoholysis,aminolysis and acidlysis in organic solvents . However, lipase in organic solvents often exhibit a few orders of magnitude lower activity than in aqueous solutions.Therefore, it is necessary to improve lipase performance in organic solvents by all kinds of ways. Castanospermine-6-O-butyrate has antiviral activity. In order to simplify reaction steps and increase reaction yield, lipase is used for the synthsis of castanospermine-6-O-butyrate owing to its high regiospecificity. Genes mutant libraries of lipase and its cogante foldase from Pseudomonas aeruginosa CS-2 are built in the project, and the yields of castanospermine-6-O-butyrate are assayed in the lipase mutants-catalyzed reactions. Based on these results, the quantatitive activity-structure realtionship(QASR) models are built, and the molecular engineering of lipase and foldase is carried out, aided by the QASR models. According to the positive and negative results obtained from molecular engineering of lipases and foldases, the interactions between lipases and foldase are studied by anti-protease metohod and surface plasmon resonance method in order to support theory basis for the molecular engineering of lipase from P.aeruginosa.
脂肪酶在有机相中能催化酯化、酯的醇解、酯的氨解和酯的酸解等各种化学反应。然而脂肪酶在有机相中的催化活性比水相中低数个数量级,因此需用提高脂肪酶在有机相中的活性。栗精胺-6-O-丁酯具有抗多种病毒活性。在栗精胺-6-O-丁酯的合成中,利用脂肪酶催化酯化反应具有高度区域选择性的特点,就可以起到简化有机合成反应步骤和提高产率的效果。本研究以自主筛选的Pseudomonas aeruginosa CS-2为材料,构建其脂肪酶及折叠酶基因突变库,并测得脂肪酶突变体在有机溶剂中催化合成栗精胺-6-O-丁酯的产率。在此基础上,建立脂肪酶及其折叠酶的定量构效关系模型,并以此模型为基础进行脂肪酶及折叠酶的分子改造。同时通过分析脂肪酶及折叠酶的分子改造过程中出现的各种阳性和阴性结果,采用抗蛋白酶作用实验和表面等离子共振方法研究脂肪酶和折叠酶的相互作用,为铜绿假单胞杆菌脂肪酶的分子改造提供更完善的理论基础。

结项摘要

脂肪酶在有机相中能催化酯化、酯的醇解、酯的氨解和酯的酸解等各种化学反应。6-O -丁酰澳栗精胺具有抗多种病毒的活性。在6–O -丁酰澳栗精胺的合成中,利用脂肪酶的高效性和选择性,就能起到简化有机合成反应步骤和提高产率的效果。本项目采用双元表达载体pACYCDuet-1,在E.coli BL21(DE3) 共表达铜绿假单胞菌CS-2中的脂肪酶及其折叠酶。利用分子定向进化技术获得脂肪酶突变体R314Q,其活性提高到原来的1.65倍。根据脂肪酶分子改造的结果,建立了脂肪酶的构效关系。利用饱和突变和脂肪酶的构效关系获得脂肪酶突变体R314W, 其活性提高到原来的3.97倍。将纯化的脂肪酶突变体用于合成澳栗精胺衍生物,其中澳栗精胺的转化率为95.3%,6-O-丁酰澳栗精胺的得率为90.5%。利用分子定向进化技术获得折叠酶突变体G127E,最佳折叠酶突变体能使脂肪酶活性提高到原来的2.13倍。PDBepisa分析结果表明脂肪酶和折叠酶突变体复合物的亲和力大于脂肪酶和折叠酶复合物的亲和力。. 本项目通过定向进化和构效关系分析相结合的方法得到脂肪酶突变体,并将脂肪酶突变体用于合成6-O-丁酰澳栗精胺,为脂肪酶的分子改造提供了一种系统方法。通过定向进化得到了折叠酶突变体并研究了脂肪酶和折叠酶的相互作用,初步揭示了折叠酶如何影响脂肪酶活性的分子机制。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(1)
Recent progress in lipase immobilization
脂肪酶固定化研究最新进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Biotechnology: An Indian Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ren Peng
  • 通讯作者:
    Ren Peng
Preparation and biological activities of castanospermine and 6-O-butanoylcastanospermine
栗精胺和6-O-丁酰基栗精胺的制备及生物活性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Journal of Chemical and Pharmaceutical Research
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ren Peng;Haobo Xie;Liang Wu;Yanchao Zhou;Xiuyin Xiang;Shulin Peng;Jianhua Wu
  • 通讯作者:
    Jianhua Wu
Cloning and expression of lipase with microbial origin
微生物来源脂肪酶的克隆和表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Biotechnology: An Indian Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ren Peng;Yalin Liu;Pan Zhou;Qian Huang;Han Wu
  • 通讯作者:
    Han Wu
澳栗精胺衍生物的酶法合成研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    江西师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    彭仁;姚清文;洪彬文
  • 通讯作者:
    洪彬文

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    彭仁

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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