利用关联分析和连锁分析发掘甘蓝型油菜分枝优异等位变异

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31360344
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    50.0万
  • 负责人：
    向阳
  • 依托单位：
    贵州省农业科学院
  • 学科分类：
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份：
    2017
  • 批准年份：
    2013
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The number of primary branches (FB) is an important agronomic trait of rapeseed. In this research, yield and quality related traits were investigated and analyzed for 250 Brassica napus inbred lines, and the 96 B. napus inbred lines will be genotyped using SSR, SRAP or SNP molecular markers. The extent of linkage disequilibrium (LD) between markers is examined, and its features are revealed. Meanwhile, the association mapping between markers and FB data are performed, and some markers or chromosomal regions involved in FB will be characterized. The major QTLs for tillering-like trait will be identified through composite interval mapping analyses in the F2 segregating population. Combining the fine association mapping and linkage analysis, the accuracy of QTL mapping will be further improved, and some elite alleles for FB will be screened out. These results give an insight into the characteristics of LD in Brassica napus, and obtaining target gene,allelic variants for high yield breeding, and provide the solid foundation for functional analysis of candidate genes.
一次有效分枝数是甘蓝型油菜的一个重要农艺性状。本项目在鉴定250份甘蓝型油菜种质材料的产量和品质相关性状的基础上，利用SSR、SRAP、SNPs等标记检测96份代表性材料的基因型；通过标记连锁不平衡的分析揭示甘蓝型油菜的连锁不平衡特征；通过基因型与一次有效分枝数表型关联分析，鉴定出与一次有效分枝数显著关联的基因／染色体区段；利用F2分离群体对类分蘖一次有效分枝数进行区间作图，鉴定类分蘖一次有效分枝数主效QTLs；在此基础上，通过关联分析与连锁分析相结合的方法，进一步提高定位的准确性，并筛选出一次有效分枝数的优异等位变异。研究结果对了解甘蓝型油菜连锁不平衡特征、发掘育种目标基因及其等位变异油菜高产育种有重要意义，也是下一步开展候选基因功能分析的基础。

结项摘要

（1）一次有效分枝数是甘蓝型油菜品种选育中关注的重要农艺性状，优异的种质材料缺乏，是限制密植高产油菜新品种选育的关键。本项目利用分子标记与表型鉴定，从627份核心种质遴选遗传多样性高的300份种质构成自然群体，并获得10份一次分枝优异种质，为品种选育奠定基础。.（2）甘蓝型油菜遗传多样性低是限制高产品种改良的重要因素。利用重测序和224个SSR 标记，揭示甘蓝型油菜的连锁不平衡特征，整个基因组的衰减距离为18.8 kb(R2=0.28)。该特征为油菜加强C基因组改良的策略提供理论支撑。.（3）针对油菜一次分枝数及分枝角度的标记开发少有报道，本项目对自然群体一次有效分枝数进行4年2点表型鉴定，全基因组关联分析获得12个位点，同时在chrC04 号染色体上定位得到类分蘖基因位点；构建了包含208个株系的DH群体，利用基因芯片获得高密度遗传连锁图谱1张, 并分别定位一次有效分枝角度和一次分枝部位QTLs/染色体区段4个和5个；在自然群体中共获得一次分枝优异等位变异7个。为分子标记辅助育种提供支撑。.（4）申请专利3项，发表SCI论文4篇。

项目成果

期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（1）
GENETIC SEGREGATION ANALYSIS OF A RAPESEED DWARF MUTANT
油菜矮化突变体的遗传分离分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    Pak. J. Bot.,
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    YANG XIANG;CHAOBO TONG;SHIZHOU YU;TAO ZHANG;JIXIAN ZHAO;SHAOLIN LEI;CAIFU DU;SHENGYI LIU
  • 通讯作者：
    SHENGYI LIU
Major co-localized QTL for plant height, branch initiation height, stem diameter and flowering time revealed in an alien introgression derived DH population for Brassica napus
外来基因渗入衍生的甘蓝型油菜 DH 群体中揭示的株高、分枝起始高度、茎直径和开花时间的主要共定位 QTL
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Frontiers in Plant Science
  • 影响因子：
    5.6
  • 作者：
    向阳
  • 通讯作者：
    向阳

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SIRT1通过抑制NF-κB信号通路而抑制oxLDL诱导的VSMC源性泡沫细胞形成
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一种甘蓝型油菜理想株型控制基因的克隆与功能分析
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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