基于节肢动物线粒体宏基因组学的高通量生物多样性调查研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31500305
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0301.生态学理论与方法
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Biodiversity assessment is the important basis of biodiversity conservation. Documenting the diversity of invertebrate life was challenging until recently the appearance of metabarcoding, which promises to make biodiversity assessments of invertebrates feasible in a large scale. However, in our previous studies on biodiversity assessments by using metabarcoding, we found some unavoidable shortcomings, such as false positives due to DNA contamination, false negatives causing the dropout of some species, and biased amplification resulting in no reliable biomass information. To resolve these problems, we tested a new method – mito-metagenomics on some bee species in a subsequent work. The results show that this new method can improve the shortcomings of metabarcoding. So in this proposal, mito-metagenomics will be tested and used in a real biodiversity study, in which we will assess 20-years arthropod diversity of Zackenberg. The objectives of this proposal are: 1) improving mito-metagenomics to provide a better method for invertebrate biodiversity assessments; 2) establishing a time series of arctic arthropod community and using it as a model system for understanding how communities, ecosystems and their functions are impacted by climate change.
生物多样性调查是保护生物多样性的重要基础。然而我们对无脊椎动物的生物多样性现状知之甚少。直到metabarcoding技术的出现,才使得大规模的无脊椎动物多样性研究成为可能。但是我们在前期运用metabarcoding技术进行生物多样性调查时发现该技术仍然存在一些不足之处,如DNA污染产生的假阳性、物种信息丢失的假阴性以及PCR扩增偏差导致的无法提供可靠生物量信息等。在之后的一个方法测试工作中,我们以蜜蜂物种为研究对象,采用一个无PCR的新方法——线粒体宏基因组学成功改进了metabarcoding技术的这些不足之处。为了进行实例验证以完善这一新方法,本项目拟采用线粒体宏基因组学,对近二十年来萨肯博格地区的节肢动物多样性进行调查研究,一方面旨在为无脊椎动物多样性调查提供一个更为可靠的新方法,另一方面提供多样性数据建立时间尺度的生态系统模型,以帮助了解全球气候变化对高纬度节肢动物群落的影响。

结项摘要

项目成果

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专著数量(0)
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会议论文数量(0)
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其他文献

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季吟秋的其他基金

基于水eDNA的高黎贡山脊椎动物多样性调查研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于水eDNA的高黎贡山脊椎动物多样性调查研究
  • 批准号:
    32271739
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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