阪崎肠杆菌O抗原多样性的遗传基础和分子进化研究

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基本信息

  • 批准号:
    31000044
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

阪崎肠杆菌是重要的食源性致病菌,感染治愈率低、致死性强,死亡率高达40-80%。O抗原是革兰氏阴性细菌表面的主要多糖抗原和致病因子,对细菌的生存、致病性和免疫性等均有重要作用。目前国际上对阪崎肠杆菌的O抗原研究刚刚起步,本项目拟对阪崎肠杆菌的O抗原进行系统的研究,包括对100多株阪崎肠杆菌进行O抗原酶切分型,破译各类型的基因簇、测定化学结构、预测和鉴定O抗原中的单糖合成途径和糖基转移酶功能、并建立各型阪崎肠杆菌的快速检测方法,在此基础上阐明阪崎肠杆菌O抗原进化和多样性的遗传机制。通过该项目的研究,我们将建立完整的阪崎肠杆菌的O抗原分子分型及快速检测系统,不仅能为研究阪崎肠杆菌的致病机理、遗传进化和流行病学调查奠定理论基础,还能为发展快速检测技术、运用生物酶法合成罕见单糖等提供技术支持。

结项摘要

克罗诺杆菌(Cronobacter,原称Enterobacter sakazakii)是一种重要的食源性致病菌,在多种食物中均分离到该属菌株。可导致任何年龄层人群的疾病,尤其是免疫力低下的婴幼儿和老人,能够引起严重的坏死性小肠结肠炎、败血症和脑膜炎。. 本研究针对整个Cronobacer属的O 抗原进行了系统的研究。确定了Cronobacer属的13个O血清型,分别为C. sakazakii O3-O7 血清型、C. dublinensis O1-O2血清型、C. turicensis O2-O3血清型、C. muytjensii O2血清型和C. malonaticus O1血清型。并完成了这些血清型的基因簇的破译和化学结构解析。从整体上分析了O 抗原基因簇的基本特征和特殊特征,深入分析O 抗原结构和O 抗原基因簇之间的对应关系。研究发现,某些Cronobacer的O抗原基因簇与大肠杆菌相似,例如C. malonaticus O1和E. coli O29,C. sakazakii O4和E. coli O103之间,且这些O抗原内部基因的相似性明显低于持家基因之间的相似性,这意味着O 抗原承受更大的选择压力。此外,分析显示在Cronobacer属的不同种之间,存在着5对相似的O antigen基因簇,这意味着共享的O 抗原类型可能具有共同的祖先并随着种分化而分化形成,这些O 抗原类型可能更适应生存环境。在获得O抗原基因簇序列的基础上,筛选获得了O 抗原特异基因,建立了基于特异PCR的O血清型分型系统,结果显示筛选到的特异引物准确、特异,DNA灵敏度0.01ng,纯菌灵敏度103CFU。此外,根据已获得的O抗原结构以及O抗原基因簇,预测发现C. turicensis O2 G3882中的罕见单糖CMP-Legp5Ac7Ac共由7个基因编码的蛋白合成,分别为orf5-orf11。另外本研究还预测了C. sakazakii O6 G2704中负责半乳糖转移的糖基转移酶基因的功能。. 本研究更好地帮助我们理解Cronobacter O 抗原多样性形成机制,理解O 抗原与致病性的关系,为Cronobacter的菌株分型、监测及流行病学调查提供技术支持和理论基础。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structure and genetics of the O-antigen of Cronobacter sakazakii G2726 (serotype O3) closely related to the O-antigen of C. muytjensii 3270
与 C. muytjensii 3270 的 O 抗原密切相关的坂崎克罗诺杆菌 G2726(血清型 O3)的 O 抗原的结构和遗传学
  • DOI:
    10.1016/j.carres.2012.02.031
  • 发表时间:
    2012-07-01
  • 期刊:
    CARBOHYDRATE RESEARCH
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Arbatsky, Nikolay P.;Sun, Yamin;Knirel, Yuriy A.
  • 通讯作者:
    Knirel, Yuriy A.
Genetic Analysis of the Cronobacter sakazakii O4 to O7 O-Antigen Gene Clusters and Development of a PCR Assay for Identification of All C. sakazakii O Serotypes
坂崎克罗诺杆菌 O4 至 O7 O 抗原基因簇的遗传分析以及用于鉴定所有坂崎克罗诺杆菌 O 血清型的 PCR 检测方法的开发
  • DOI:
    10.1128/aem.07825-11
  • 发表时间:
    2012-06-01
  • 期刊:
    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Sun, Yamin;Wang, Min;Wang, Lei
  • 通讯作者:
    Wang, Lei
Development of an O-Antigen Serotyping Scheme for Cronobacter sakazakii
坂崎克罗诺杆菌 O 抗原血清分型方案的开发
  • DOI:
    10.1128/aem.02229-10
  • 发表时间:
    2011-04-01
  • 期刊:
    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Sun, Yamin;Wang, Min;Wang, Lei
  • 通讯作者:
    Wang, Lei

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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