生物分子水溶液体系中非共价相互作用的理论研究-探讨其分子识别机理及质子和能量传递过程

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    20633050
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    140.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份:
    2010
  • 批准年份:
    2006
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2007-01-01 至2010-12-31

项目摘要

开展生物分子水溶液体系中非共价相互作用的理论研究,探讨分子识别机理及质子和能量传递过程,具有非常重要的科学和实际意义。分子识别是指分子间或分子的不同部分由非共价相互作用控制而形成的一组特殊现象。对于生物分子体系来说,分子识别现象是决定性的。然而,关于分子识别机理的研究还是一个挑战性的课题,这是因为非共价相互作用比较弱,同时溶剂化效应有强烈影响,使其研究更为复杂。本项目的宗旨将主要是建立和发展新一代的原子-键电负性均衡浮动电荷力场方法(ABEEM/MM),并与量子力学方法合理结合起来,以进行ABEEM/MM/QM分子动态研究(MD);建立和发展分子形貌理论;编制相应程序。将上述两种理论方法,用于研究生物分子体系和水溶液体系的分子间(或分子内)的非共价相互作用,探讨分子识别机理以及质子传递和能量传递过程,将会发现有规律性的认识,获得自主创新的结果,将在分子识别、分子和药物设计等领域中应用。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(102)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(68)
专利数量(0)
人体端粒中(3+1)混合结构G-四链体稳定性的分子动力学模拟
  • DOI:
    10.3866/pku.whxb200904241
  • 发表时间:
    2009-03
  • 期刊:
    物理化学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吕洋;李慎敏;沈新媛
  • 通讯作者:
    沈新媛
肝醇脱氢酶催化乙醇氧化生成乙醛反应机理的理论研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    催化学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王长生;李晓莹
  • 通讯作者:
    李晓莹
离子型氢化物MH(M=Li, Na, K和Rb)的分子形貌的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    辽宁师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵东霞;黄艳伟
  • 通讯作者:
    黄艳伟
分子ABEEM电荷分布的图形表示
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    高等学校化学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨忠志;李洋;宫利东;赵东霞
  • 通讯作者:
    赵东霞
脂肪族氨基酸二肽与水团簇的理论研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    分子科学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘翠;杨忠志
  • 通讯作者:
    杨忠志

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其他文献

NH4+(H2O)n(n=1~9)的量子化学和ABEEM/MM的理论研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    化学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵飞耀;刘翠;宫利东;杨忠志
  • 通讯作者:
    杨忠志
多种密度泛函方法计算碳氧单键解离能的性能比较
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨忠志;刘林林
  • 通讯作者:
    刘林林
ABEEMsp和OPLS-AA力场对蛋白质GA88/GB88的分子动力学模拟
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王晶晶;刘翠;杨忠志
  • 通讯作者:
    杨忠志
碱基分子中单电子作用势判断化学键强弱的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    辽宁师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨忠志;杜霞
  • 通讯作者:
    杜霞
电负性均衡
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Progress in Chemistry
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    杨忠志
  • 通讯作者:
    杨忠志

其他文献

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构建和发展先进的新一代可极化分子力场- - 探索和模拟复杂分子体系结构性能的新方法
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  • 资助金额:
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  • 项目类别:
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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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