稀有放线菌小单孢菌中接合转移相关基因和位点的克隆及其功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31070087
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    33.0万
  • 负责人：
    李晓华
  • 依托单位：
    中南民族大学
  • 学科分类：
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

小单孢菌是一类产生多种抗生素的稀有放线菌。小单孢菌40027菌株含有2个内源质粒- - pJTU101和pJTU112，其中，质粒pJTU112具有自主接合转移功能，本项目通过对小单孢菌内源质粒pJTU112全序列测定和生物信息学分析，预测小单孢菌中与接合转移相关的潜在基因和位点。进一步通过基因缺失和功能互补实验，确证小单孢菌中接合转移相关基因和位点；并利用不同拷贝数载体，研究小单孢菌中不同拷贝数接合转移相关基因和位点对接合转移的影响。再利用细菌双杂交、Pull-down等技术，筛选并验证小单孢菌中接合转移相关基因的互作基因。明确小单孢菌中接合转移相关基因和位点的生物学功能，阐明小单孢菌中接合转移的分子机理，建立小单孢菌接合转移系统。研究结果对小单孢菌中遗传信息水平转移分子机制的揭示具有重要的理论意义，对小单孢菌遗传育种和较大DNA片段的遗传转移具有重要的应用价值。

结项摘要

小单孢菌是一类产生多种抗生素的稀有放线菌。小单孢菌40027菌株含有2个内源质粒——pJTU101和pJTU112，其中，质粒pJTU112具有自主接合转移功能。对小单孢菌内源质粒pJTU112全序列测定和生物信息学分析，质粒pJTU112全长13,648bp，G+C含量为74.6%，包含13个ORF，其中pJTU112.3、pJTU112.4和pJTU112.5与质粒复制功能相关，pJTU112.1、pJTU112.2、pJTU112.12和pJTU112.13与质粒接合转移功能相关，pJTU112.6与质粒pJTU112的位点特异性重组相关，pJTU112.9与质粒的抗生素抗性相关。将质粒pJTU112的不同片段导入消除质粒的小单孢菌40027菌株，质粒pJTU112的复制区定位在约4.7kb的SacI-KpnI片段上。利用pHZ199构建了质粒pJTU112的衍生质粒pSCU213、pSCU214和 pSCU215等，通过大肠杆菌与小单孢菌间的接合转移，将重组质粒转入小单孢菌LXH20菌株中，再通过小单孢菌间的接合转移，确定了质粒pJTU112接合转移功能区。对pJTU112.1、pJTU112.2和pJTU112.12编码的蛋白比对分析，发现pJTU112.1（302aa）与红球菌细胞分裂蛋白FtsK有32%同源性，pJTU112.2（478aa）与小单孢菌细胞分裂蛋白FtsK/SpolIIE具有69%的同源性，并且pJTU112.2中包含保守的FtsK/SpolIIE结构域，同时pJTU112.2中含有一个保守的氨基酸序列（RAAGI）和一个保守的核酸结合位点GAGKS，pJTU112.12（785aa）与链霉菌(S. avermitilis)MA-4680中主要的质粒转移蛋白有38%的同源性，含有Ftsk_gamma结构域。明确小单孢菌中接合转移相关基因和位点的生物学功能，阐明小单孢菌中接合转移的分子机理，建立小单孢菌接合转移系统。研究结果对小单孢菌中遗传信息水平转移分子机制的揭示具有重要的理论意义，对小单孢菌遗传育种和较大DNA片段的遗传转移具有重要的应用价值。

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
烟碱降解菌DAB2菌株的筛选、鉴定和降解特性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中南民族大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李晓华;杨晓潼;翟贵发;郭利;王晓丽
  • 通讯作者：
    王晓丽
烟碱降解菌CW6菌株的分离鉴定及其降解特性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    华中师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    翟贵发;陈素卉;李涵;王映月;杨晓潼;王晓丽;郭利;李晓华
  • 通讯作者：
    李晓华
Bioreduction of chromium (VI) by Bacillus sp isolated from soils of iron mineral area
从铁矿区土壤中分离出的芽孢杆菌对铬 (VI) 的生物还原
  • DOI：
    10.1016/j.ejsobi.2009.06.009
  • 发表时间：
    2009-09-01
  • 期刊：
    EUROPEAN JOURNAL OF SOIL BIOLOGY
  • 影响因子：
    4.2
  • 作者：
    Cheng, Guojun;Li, Xiaohua
  • 通讯作者：
    Li, Xiaohua
抗真菌土壤放线菌的筛选鉴定、发酵培养基优化及发酵液稳定性的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    湖北农业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    谭晖;李汇龙;李文鑫;吴金龙;高剑锋;余丕宁;段颖;李晓华
  • 通讯作者：
    李晓华
β-甘露聚糖酶产生菌的分离鉴定和酶学性质
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    华中农业大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李长影;孔雯;王家昕;高剑锋;李晓华
  • 通讯作者：
    李晓华

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直流系统保护对交流故障的响应机理与交流故障引发的直流系统保护误动分析
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  • 作者：
    李晓华;王士猛;杨晓春;于戈
  • 通讯作者：
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其他文献

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李晓华的其他基金

稀有放线菌小单孢菌中三种类型位点特异性重组及其相互作用的分子机理
  • 批准号：
    30570046
  • 批准年份：
    2005
  • 资助金额：
    28.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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