利用转录组测序挖掘甘蓝菌核病抗病相关基因

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31171585
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    61.0万
  • 负责人：
    钱伟
  • 依托单位：
    西南大学
  • 学科分类：
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

菌核病是危害油菜生产的一种主要病害。然而，自然界中匮乏高抗菌核病油菜资源，致使油菜菌核病的相关研究和抗病育种受到很大局限。我们前期从油菜近缘种中鉴定出了高抗菌核病的野生甘蓝，构建了抗、感分离的F2无性系群体，并进行了2年的抗性鉴定，定位了抗性QTL。本研究拟从该群体中，挑选抗、感材料，取接种前、后菌斑周围组织的RNA进行表达谱测序，寻找感病和抗病材料表达差异的序列，参考已获得的甘蓝基因组序列，克隆抗病相关基因，开发抗病基因的功能标记，并进行QTL精细定位，对落在QTL区域的抗病相关基因进行功能验证。该研究对于揭示菌核病的抗性机制，以及转移甘蓝抗性基因到甘蓝型油菜，开展油菜抗菌核病的分子设计育种具有重要的理论和实践意义。

结项摘要

菌核病是危害油菜生产的一种主要病害。本项目从油菜近缘种中鉴定出了高抗菌核病的野生甘蓝，构建了抗、感分离的F2无性系群体，并进行了2 年的抗性鉴定，将主效QTL定位到了C09上。并从该分离群体中，挑选抗、感材料，取接种前、后的菌斑周围的叶片和茎杆组织进行表达谱测序。叶片表达谱分析表明抗病甘蓝可能是通过强烈的抗氧化活性和降低HR的产生来抑制病原物的侵染，而JA信号途径的增强则是诱导相关抗病基因的表达来抵御核盘菌的危害。在茎杆中也同样发现抗病甘蓝具有更强的抗氧化活性.本项目利用甘蓝‘C01’与甘蓝型油菜发展了AACCCC六倍体杂种，并与甘蓝型油菜亲本回交，通过C09-QTL区间标记辅助筛选及抗性鉴定，从中获得2份既携带抗病QTL又表现出良好抗性的、含38条染色体的个体（抗性是原油菜亲本的2-3倍）。并将甘蓝‘C01’的抗性转移到白菜中，从BC2F2中筛选到一份相对于白菜亲本其茎杆抗性提高1.7倍的抗病白菜型油菜，为进一步发展A、C亚基因组的抗性得到聚合的高抗菌核病甘蓝型油菜创建了材料。我们的研究揭示了一定的甘蓝抗菌核病机制，并转移了甘蓝抗性基因到甘蓝型油菜及白菜型油菜，对开展油菜抗菌核病的分子设计育种具有重要的理论和实践意义。

项目成果

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专著数量（0）
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  • 通讯作者：
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  • 发表时间：
    2020
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    毛宗强

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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