大规模几何建模和自适应笛卡尔网格生成并行算法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61170310
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    56.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0204.计算机系统结构与硬件技术
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

在计算电磁学、计算流体力学等诸多领域,随着实际工程计算中几何外形和物理特性越来越复杂,几何建模和网格生成这两个前处理组成部分花费的时间越来越长。前处理已经成为大规模实际工程计算中的主要性能瓶颈,而并行和自适应计算是最有可能的解决途径。本项目将针对笛卡尔网格应用的前处理部分,面向上万个处理器核,系统地研究以下内容:高效的三维实体建模并行算法、面向特征的复杂外形自适应网格生成并行算法;基于上述理论和技术,研制高效的三维并行前处理软件包,作为共性层面的软件模块服务于若干实际问题的大规模并行数值模拟。. 本项目的研究具有很强的应用牵引,是当前迫切需要解决的重要科学问题,并具有广泛的应用价值。

结项摘要

在计算电磁学等诸多领域,随着实际工程设计面临的几何外形和物理特性越来越复杂、以及庞大的计算量带来的实效性问题,几何建模和网格生成这两个前处理部分变得越来越困难,成为制约大规模数值模拟实际应用的主要瓶颈之一。大幅减少前处理时间并实现高精度计算是这些领域具有挑战性的问题,具有重大的科学意义。. 本项目面向大规模计算,针对电磁等典型应用前处理中并行计算瓶颈问题展开,实现前处理与并行计算主体之间的无缝连接,系统地研究了以下内容:分析了对称体旋转扫描、拉伸扫描、耦合孔等多种基本几何体建模方法,提出并实现了相对应的并行计算算法,形成了基本体素并行建模库;提出了并行变换技术,实现了不同并行建模方法导致的不同通信模式之间的并行转换;针对FDTD建模,提出了一种基于多重索引的影像区填充并行算法;在网格生成和自适应细化方面,提出了基于几何和物理特性的网格重构方法,以及多块结构网格拼接方法;在结合实际应用耦合并行前处理和计算主体程序研究中,提出了前后处理策略,以及基于共享与分布随机数的粒子发射算法等。上述方法和技术被应用于多个典型并行应用中,其中,具有自主建模模块的全电磁粒子模拟程序突破了网格规模难以扩展的瓶颈,前处理的并行实现使得网格规模从原来的最大千万量级扩展到上亿量级;基于CAD建模的JEMS-FDTD并行程序在天河二号计算机上的19万多个处理器核上实现了257亿网格规模的模拟计算。. 这些方法和技术的研究,着眼于实际应用瓶颈问题的解决,在促进具有复杂几何的实际应用大规模数值模拟上具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(3)
专利数量(0)
大规模粒子团簇识别分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    计算机工程与科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    沈卫超;曹立强;夏芳
  • 通讯作者:
    夏芳
A finite element recovery approach to eigenvalue approximation with applications to electronic structure calculations
特征值近似的有限元恢复方法及其在电子结构计算中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Journal of Scientific Computing
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    J.Fang;X. Gao;A. Zhao
  • 通讯作者:
    A. Zhao
基于网格片的氧碘化学激光器多块并行数值模拟
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    强激光与粒子束
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭红;李艳;安恒斌
  • 通讯作者:
    安恒斌
JASMIN框架中多块结构网格拼接并行计算及其应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    计算机工程与科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭红;莫则尧;张爱清
  • 通讯作者:
    张爱清
科学计算双路并行I/O优化方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    计算机学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    莫则尧;沈卫超;夏芳;陈军
  • 通讯作者:
    陈军

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  • 通讯作者:
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其他文献

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  • 财政年份:
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  • 项目类别:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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