基于化学遗传学策略研究NDR1激酶抑制剂对细胞命运的影响

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21672201
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0704.化学遗传学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Human NDR1 (a nuclear serine/threonine kinase) is a member of evolutionary conserved NDR family kinases, which play important roles in many biological processes, such as function in mitotic regulation. Our further investigations revealed that PLK1-mediated phosphorylation suppresses the activity of NDR1 to ensure proper spindle orientation and signaling networks. Importantly, knockdown of NDR1 perturbs spindle orientation. However, the precise functions and the underlying regulatory mechanisms remain unclear. So, discovering potent and selective small-molecule inhibitors of the NDR1 has become one of the most active fields. In this project, we will explore a virtual screening-based inhibitor approach targeting NDR1 kinase and identify phosphorylation substrates of NDR1 by chemical genetics to investigate the molecular mechanisms of spindle orientation in vitro and in vivo. This project will provide novel insights into a better understanding of PLK1-NDR1 kinase cascade in mitotic spindle orientation dynamics and plasticity with bioinformatics and chemical probe methods.
人类NDR激酶家族非常保守,NDR1激酶参与有丝分裂相关调控等细胞生理过程。我们最新研究揭示: PLK1磷酸化修饰NDR1并动态调控其活性从而保证正确的纺锤体定向。为了进一步解析NDR1调控纺锤体正确定向的分子机制与信号转导网络, 本项目将基于虚拟筛选开发NDR1的小分子抑制剂并利用NDR1小分子抑制剂为探针解析纺锤体定向机制。以化学小分子探针为手段系统阐明细胞可塑性调控所涉及的信号转导分子机理对于理解生命活动的本质具有十分重要的意义。NDR1激酶化学探针的发掘将使我们能够阐明NDR1激酶活性在有丝分裂期的时空动力学特征及其调控染色体分离保真性的分子机制。

结项摘要

人类NDR激酶家族非常保守,NDR1激酶参与有丝分裂相关调控等细胞生理过程。我们最新研究揭示: PLK1磷酸化修饰NDR1并动态调控其活性从而保证正确的纺锤体定向。为了进一步解析NDR1调控纺锤体正确定向的分子机制与信号转导网络, 本项目将基于虚拟筛选开发NDR1的小分子抑制剂并利用NDR1小分子抑制剂为探针,解析纺锤体定向机制。本项目已发掘了NDR1化学小分子探针LCD1825,系统阐明了细胞可塑性调控所涉及的信号转导通络,从纳米尺度解析有丝分裂纺锤体正确定向的调控机制。LCD1825通过干扰NDR1的底物CENP-T的磷酸化修饰,导致其无法正确定位,产生滞后染色体。因此,NDR1相互作用蛋白质群的磷酸化、乙酰化等翻译后修饰关系的建立,对于解析有丝分裂时空动态性调控具有十分重要的意义。基于生物信息分析和化学生物学方法的应用,NDR1激酶化学探针LCD1825的发掘,使我们能够阐明SET7/9-PLK1-NDR1信号轴在有丝分裂期的时空动力学特征及其调控纺锤体定向的动态可塑性。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Methylation of PLK1 by SET7/9 ensures accurate kinetochore-microtubule dynamics
SET7/9 对 PLK1 的甲基化确保了准确的动粒微管动力学
  • DOI:
    10.1093/jmcb/mjz107
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Molecular Cell Biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Ruoying Yu;Huihui Wu;Hazrat Ismail;Shihao Du;Jun Cao;Jianyu Wang;Tarsha Ward;Fengrui Yang;Ping Gui;Mahboob Ali;Lingluo Chu;Fei Mo;Qi Wang;Youjun Chu;Yun Zhao;Mingliang Ye;Guowei Fang;Peng R. Chen;Zhen Dou;Xinjiao Gao;Wenwen Wang;Xing Liu;Xuebiao Yao
  • 通讯作者:
    Xuebiao Yao
Deep learning based prediction of reversible HAT/HDAC-specific lysine acetylation
基于深度学习的可逆 HAT/HDAC 特异性赖氨酸乙酰化预测
  • DOI:
    10.1093/bib/bbz107
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    Briefings in Bioinformatics
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    Yu Kai;Zhang Qingfeng;Liu Zekun;Du Yimeng;Gao Xinjiao;Zhao Qi;Cheng Han;Li Xiaoxing;Liu Ze-Xian
  • 通讯作者:
    Liu Ze-Xian
Mps1 dimerization and multisite interactions with Ndc80 complex enable responsive spindle assembly checkpoint signaling
MPS1 二聚化和与 Ndc80 复合体的多位点相互作用可实现响应性主轴装配检查点信号传导
  • DOI:
    10.1093/jmcb/mjaa006
  • 发表时间:
    2020-07-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Gui, Ping;Sedzro, Divine M.;Dou, Zhen
  • 通讯作者:
    Dou, Zhen

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高新娇的其他基金

有丝分裂动态翻译后修饰协同调控PLK1激酶功能的分子机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    重大研究计划
基于高特异性TTK激酶小分子探针筛选的细胞有丝分裂激酶调控网络的研究
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    31301099
  • 批准年份:
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  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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