细菌趋化性组氨酸激酶CheA活性调控机制的结构基础

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31670792
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Bacterial chemotaxis is a mechanism by which motile bacteria move to favorable living condition. Bacterial chemotaxis histidine kinase CheA converts the sensory information detected by transmembrane chemoreceptors to a tunable chemical signal in the cytosol. The gross architecture of the ternary complex formed by CheA, CheW and chemoreceptor has been uncovered, but the key question of how the regulation of the kinase activity of CheA is achieved in the platform of the ternary complex remains unanswered. Given the difficulties in revealing this dynamic mechanism, I propose a new experimental strategy that focuses on the two interdomain linkers in CheA’s kinase core: hunting for the linker mutants that mimic the regulation states (“kinase-on” and “kinase-off” states) of CheA and subsequently analyzing the structures of these mutants will help understand the structural basis of CheA regulation as well as receptor signaling.
细菌趋化性是游动类细菌选择适宜生长环境的机制。细菌趋化性组氨酸激酶CheA把膜蛋白化学受体探测到的环境中的感受信号转化为细菌细胞内的可控的化学信号。多年对CheA、CheW和化学受体所组成的复合物的结构研究已描绘了此复合体的大致构造,但我们仍不清楚在这一基本结构框架中CheA活性调节是如何实现的。经过分析,我提出解决此问题的新的研究思路并将研究范围缩小至CheA激酶核心结构域之间的两个连接上: 我将通过以这两个连接为对象筛选不同激酶活性的CheA突变体来模拟CheA被抑制或激活的调节状态,并通过进一步研究这些突变体的结构来揭示CheA和化学受体信号转导的结构基础。

结项摘要

细菌趋化性是游动细菌选择适宜生长环境的机制。细菌趋化性组氨酸激酶CheA把膜蛋白化学受体探测到的环境中的感受信号转化为细菌细胞内的可控的化学信号。多年对CheA、CheW和化学受体所组成的复合物的结构研究已描绘了此复合体的大致构造,但我们仍不清楚CheA在此复合物中是如何被调节。近期我们发现CheA的二聚结构域(P3)、催化结构域(P4)和调节结构域(P5)之间的两个结构域间连接对CheA的激酶的活性及调控起到重要作用。本项目以这两个连接为研究目标:1)设计定向进化策略分离不同激酶活性的CheA连接突变体;2)筛选出几个CheA P4-P5连接的突变体,其激酶活性的范围为野生型CheA激酶活性的30%到670%,丧失了被受体激活的能力,甚至是在缺少P5结构域的情况下,此连接突变株足以对激酶活性造成改变。这表明此连接是一个活跃的功能模块,能够对P4结构域的催化活性施加调控作用。3)筛选出了几个CheA P3-P4连接高活性突变体,其中获得的最高激酶活性为野生型CheA激酶活性的46倍。在缺少P5或同时缺失P5和P4-P5连接时,这些P3-P4连接突变体无法实现提高自磷酸活性,表明其对激酶活性的影响需要P5结构域甚至P4-P5连接的配合来实现。这些P3-P4突变体在体内无法行使正常的细菌趋化性,受体介导的激酶活性的抑制途径被干扰,表明CheA原有的处于激活和抑制状态之间的平衡被打破, CheA表现出了高基础自磷酸化活性。4)通过将高活性的P3-P4连接和高活性P4-P5连接组合,虽然没有实现更高的激酶活性,但呈现出不同的CheA活性,甚至是低于野生型的抑制状态,表明两个域间连接对激酶活性的影响不是叠加性的,但相互影响、共同影响激酶的催化结构域活性。5)对多结构域蛋白质的研究显示多结构域蛋白在功能方面的优势。由此课题的启发,我们运用蛋白质工程技术成功改进了一个具有应用价值的能将脂肪酸转化为烯烃的酶的活性和底物范围。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Regulatory Role of an Interdomain Linker in the Bacterial Chemotaxis Histidine Kinase CheA
域间连接子在细菌趋化组氨酸激酶 CheA 中的调节作用
  • DOI:
    10.1128/jb.00052-18
  • 发表时间:
    2018-05-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF BACTERIOLOGY
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Ding, Xueye;He, Qiang;Wang, Xiqing
  • 通讯作者:
    Wang, Xiqing
An Engineered Self-Sufficient Biocatalyst Enables Scalable Production of Linear alpha-Olefins from Carboxylic Acids
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    12.9
  • 作者:
    Chen Lu 陆晨;Fenglin Shen 沈枫林;Shuaibo Wang 王帅博;Yuyang Wang 王郁杨;Juan Liu 刘娟;Wen-Ju Bai 白文举;Xiqing Wang 王喜庆
  • 通讯作者:
    Xiqing Wang 王喜庆
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欣赏天然产物合成中的对称性
  • DOI:
    10.1039/c7np00045f
  • 发表时间:
    2017-12-01
  • 期刊:
    NATURAL PRODUCT REPORTS
  • 影响因子:
    11.9
  • 作者:
    Bai, Wen-Ju;Wang, Xiqing
  • 通讯作者:
    Wang, Xiqing

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

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本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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