肠道菌群及其代谢产物影响刺参生长差异的机理研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31902395
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1906.水产养殖学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

There are significant differences in the growth of individual sea cucumber (Apostichopus japonicus) during cultivation, and some individuals show growth retardation and even growth stagnation. Gut microbiome and metabolite play an important role in the growth of the host, which may be the potential cause of the growth differences. Taking A. japonicus of the same family yet with significant growth differences as the object of this study, microbiological techniques are used to analyze the structure and functional characteristics of the gut microbiome in the growth-differentiated A. japonicus. Based on the metabolomics method, the growth-related differentiated metabolites are screened. In addition, the metabolic pathways of differentiated metabolites will be annotated, and a regulatory network will be constructed for the co-metabolism of gut microbiome and host. A correlation model is built between host’s metabolism and gut microbiome to investigate the influence of gut microbiome on host’s metabolism through its metabolism and co-metabolism with the host, and to explain the correlation between gut microbiome, host’s co-metabolism and growth function. The results will provide a micro-ecological way for yield improvement of aquaculture.
刺参养殖过程中个体生长存在显著性差异,部分个体出现生长迟缓,甚至生长停滞的现象。肠道菌群及其代谢产物在宿主生长发育方面发挥着重要作用,是引起刺参生长差异的潜在因素。本项目立足于肠道微生态理论,选择同家系生长显著差异的幼参为研究对象,采用微生物组测序技术和代谢组分析,解析生长差异刺参肠道菌群结构及功能特征,筛选肠道差异代谢物,注释代谢通路信息,构建肠道菌群与宿主共代谢调控网络,查明肠道菌群如何通过自身代谢及与宿主共代谢影响宿主的代谢状态,鉴定对宿主生长代谢影响显著的功能细菌和代谢产物,阐释肠道菌群-宿主共代谢-生长机能三者间的相关性,探索提高养殖产量的微生态调控途径。

结项摘要

国家自然科学基金青年基金项目“肠道菌群及其代谢产物影响刺参生长差异的机理研究”按计划完成全部研究内容。研究以同家系生长显著差异的幼参为研究对象,主要开展(1)生长差异刺参肠道组织切片观察;(2)生长差异刺参肠道菌群结构特征研究;(3)生长差异刺参肠道菌群功能特征研究;(4)生长差异刺参肠道代谢表型分析;(5)生长差异刺参肠道基因转录表达模式分析;(6)生长差异刺参肠道菌群-宿主共代谢-生长机能相关性研究;(7)刺参肠粪菌群移植实验研究。项目从肠道微生态角度,查明了肠道差异菌群Lutibacter、Gramella、Formosa及Lactobacillus通过调控机体IGF1、HK、PK基因的表达,介导PI3K-Akt信号通路、糖代谢及脂代谢通路,进而影响代谢表型,最终导致刺参产生生长性能上的差异。为今后以肠道菌群为靶点,优化肠道菌群结构,提高养殖产量及促进绿色健康养殖提供一定的理论参考。项目共发表第一标注第一/通讯作者学术论文9篇,其中SCI收录3篇;培养硕士研究生2名。项目进展顺利,全面完成研究内容和考核指标。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Characterization of the Bacterial Community in the Ecosystem of Sea Cucumber (Apostichopus japonicus) Culture Ponds: Correlation and Specificity in Multiple Media
海参(Apostichopus japonicus)养殖池塘生态系统中细菌群落的特征:多种介质的相关性和特异性
  • DOI:
    10.3390/w14091386
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Water
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Yeqing Zhou;Jingjing Zhang;Luo Wang;Hanchen Xu;Zhiping Lin;Yanxia Liu;Zhenlin Hao;Jun Ding;Yaqing Chang
  • 通讯作者:
    Yaqing Chang
Response of bacterial community in sea cucumber Apostichopus japonicus intestine, surrounding water and sediment subjected to high-temperature stress
海参肠道及周围水体和沉积物细菌群落对高温胁迫的响应
  • DOI:
    10.1016/j.aquaculture.2021.736353
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Aquaculture
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    王荦;魏冲;常亚青;丁君
  • 通讯作者:
    丁君
不同季节刺参养殖池塘水体菌群结构与功能特征研究
  • DOI:
    10.19663/j.issn2095-9869.20200716002
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    渔业科学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谭八梅;王荦;裴泓霖;夏兴龙;丁君;常亚青;郝振林
  • 通讯作者:
    郝振林
刺参养殖池塘患病区域沉积物菌群结构与功能特征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    生态学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林志萍;周叶青;张靖婧;王荦;刘艳霞;丁君;常亚青
  • 通讯作者:
    常亚青
夏季仿刺参养殖池塘水体菌群地域性特征及其影响因素
  • DOI:
    10.16378/j.cnki.1003-1111.20198
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    水产科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨小佩;王荦;徐翰晨;丁君;常亚青;郝振林
  • 通讯作者:
    郝振林

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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