基于南亚人群遗传分析探讨东亚人群的祖先

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31060156
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    Palanichamy MG
  • 依托单位：
    云南大学
  • 学科分类：
    C0605.遗传与进化
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

亚洲是连接新旧大陆的关键地区，其人群的起源一直备受关注。南亚语系代表着南亚，东亚和东南亚较为古老的语系，在一定程度上是连接着南亚，东亚和东南亚人群之间的桥梁。印度全基因组数据提示印度的南亚语系群体和人类基因组计划的北京群体之间有相对较近的遗传关系，而印度的南亚语系群体是南亚较为古老的人群，有着较大的群体数，提示它们并非是来自于东亚地区近期基因流，因此，我们推断印度南亚语系人群也极有可能是东亚人群的祖先，为了深入探讨东亚人群是否起源于印度古老的南亚语系群体，然后经印度东北部扩散到东亚？本研究将首先以高分辨率的线粒体DNA为标记，分析涵盖南亚，东南亚和东亚的南亚语系群体的高变区和编码区数据，然后在南亚群体中筛选出代表东亚人群祖先的个体，进行线粒体全基因测定，根据线粒体全基因组数据选择代表性个体进行全基因组分析，并结合已发表数据，探讨南亚语系群体的遗传学结构，追溯东亚人群的祖先。

结项摘要

亚洲是连接新旧大陆的关键地区，其人群的起源一直备受关注。南亚语系代表南亚，东亚和东南亚较为古老的语系，在一定程度上是连接着南亚，东亚和东南亚人群之间的桥梁。印度全基因组数据提示印度的南亚语系群体和人类基因组计划的北京群体之间有相对较近的遗传关系，而印度的南亚语系群体是南亚较为古老的人群，有着较大的群体数，提示它们并非是来自于东南地区近期的基因流，因此，我们推断印度南亚语系人群也极有可能是东亚人群的祖先，为了深入探讨东亚人群是否起源于印度古老的南亚语系群体，然后经印度东北部扩散到东亚。本研究将首先以高分辨率的线粒体DNA为标记，分析涵盖南亚，东南亚和东亚的南亚语系群体的高变区和编码区的数据，然后再南亚群体中筛选出代表东亚人群祖先的个体，进行线粒体全基因测定，根据线粒体全基因组数据选择代表性个体进行全基因组分析，并结合已发表的数据，他闹南亚语系群体的遗传学结构，追溯东亚人群的祖先。

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Are ATPase6 polymorphisms associated with primary ovarian insufficiency?
ATPase6 多态性与原发性卵巢功能不全有关吗？
  • DOI：
    10.1007/s00404-010-1640-9
  • 发表时间：
    2011-03
  • 期刊：
    Arch Gynecol Obstet
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Palanichamy MG
  • 通讯作者：
    Palanichamy MG
Y-chromosome haplogroup diversity in the sub-Himalayan Terai and Duars populations of East India
东印度喜马拉雅山以下特莱人和杜阿尔人群体的 Y 染色体单倍群多样性
  • DOI：
    10.1038/jhg.2011.98
  • 发表时间：
    2011-11-01
  • 期刊：
    JOURNAL OF HUMAN GENETICS
  • 影响因子：
    3.5
  • 作者：
    Debnath, Monojit;Palanichamy, Malliya G.;Zhang, Ya-Ping
  • 通讯作者：
    Zhang, Ya-Ping
Mitochondrial DNA evidence supports northeast Indian origin of the aboriginal Andamanese in the Late Paleolithic.
线粒体 DNA 证据支持原住民安达曼人在旧石器时代晚期起源于印度东北部。
  • DOI：
    10.1016/j.jgg.2011.02.005
  • 发表时间：
    2011-03
  • 期刊：
    J Genet Genomics
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Palanichamy MG
  • 通讯作者：
    Palanichamy MG
Identifying potential pitfalls in interpreting mitochondrial DNA mutations of male infertility cases
识别解释男性不育病例线粒体 DNA 突变的潜在陷阱
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011-10
  • 期刊：
    Indian J Med Res
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Palanichamy MG
  • 通讯作者：
    Palanichamy MG

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其他文献

Inland post-glacial dispersal in East Asia revealed by mitochondrial haplogroup M9a'b.
  • DOI：
    10.1186/1741-7007-9-2
  • 发表时间：
    2011-01-10
  • 期刊：
    BMC biology
  • 影响因子：
    5.4
  • 作者：
    Peng MS;Palanichamy MG;Yao YG;Mitra B;Cheng YT;Zhao M;Liu J;Wang HW;Pan H;Wang WZ;Zhang AM;Zhang W;Wang D;Zou Y;Yang Y;Chaudhuri TK;Kong QP;Zhang YP
  • 通讯作者：
    Zhang YP
Potential pitfalls in MitoChip detected tumor-specific somatic mutations: a call for caution when interpreting patient data.
  • DOI：
    10.1186/1471-2407-10-597
  • 发表时间：
    2010-10-30
  • 期刊：
    BMC cancer
  • 影响因子：
    3.8
  • 作者：
    Palanichamy MG;Zhang YP
  • 通讯作者：
    Zhang YP
Population phylogenomic analysis of mitochondrial DNA in wild boars and domestic pigs revealed multiple domestication events in East Asia.
  • DOI：
    10.1186/gb-2007-8-11-r245
  • 发表时间：
    2007
  • 期刊：
    Genome biology
  • 影响因子：
    12.3
  • 作者：
    Wu GS;Yao YG;Qu KX;Ding ZL;Li H;Palanichamy MG;Duan ZY;Li N;Chen YS;Zhang YP
  • 通讯作者：
    Zhang YP
Tamil merchant in ancient Mesopotamia.
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0109331
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Palanichamy MG;Mitra B;Debnath M;Agrawal S;Chaudhuri TK;Zhang YP
  • 通讯作者：
    Zhang YP

其他文献

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Palanichamy MG的其他基金

东亚藏缅语系的起源和迁移：从印度东北部的遗传角度探讨
  • 批准号：
    31240018
  • 批准年份：
    2012
  • 资助金额：
    15.0 万元
  • 项目类别：
    专项基金项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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