SNAI1在人胚胎干细胞定向分化为定型内胚层过程中的作用研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31601100
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0703.细胞增殖及细胞周期
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

As a member of the SNAIL family, the most significant role of the zinc finger transcription factor SNAI1 is as an inhibitor of E-cadherin and regulation of epithelial-mesenchymal transition, thus affecting embryonic development and tumor development. But the role of SNAI1 in human embryonic development and embryonic stem cell fate decision is still not clear. A new in vitro endoderm differentiation (DE) system was established to investigate the stem cell fate decision according to the experiments we done before. Through rnaseq data, we found that the expression level of snai1 was significantly increased during the differentiation from hESCs to DE. On the other side, the expression level of snai1 was significantly inhibited by siRNA or Snai1 gene knockout. The results indicated that Snai1 has an important role during the differentiation from hESCs to DE. Therefore, in order to find out the regulatory network and the mechanism of snai1 during stem cell fate decision, gene knockout technology, chromatin immuno co-precipitation and sequencing Chip-Seq should be used in our study to understand the role of snai1.
锌指转录因子SNAI1是SNAIL家族成员之一,其最显著作用是作为E-cadherin的抑制因子,调控细胞的上皮间质转化,从而影响胚胎发育和肿瘤的发生。但是SNAI1在人的胚胎发育和胚胎干细胞命运转变过程中的作用仍然不清楚。我们通过前期实验建立了体外人胚胎干细胞(hESCs)向定型内胚层(DE)分化的体系来研究干细胞细胞命运转变过程中的关键因子,通过RNAseq发现hESCs分化为DE的过程中,SNAI1的表达有显著提高,通过siRNA技术降低SNAI1的表达或者敲除SNAI1基因,发现hESCs分化为DE的过程被显著抑制,说明SNAI1在hESCs分化为DE的过程中有重要的作用。因此,我们试图利用基因敲除技术、染色质免疫共沉淀及测序(Chip-Seq)等技术研究SNAI1的调控网络,阐明SNAI1是如何被激活并且调控哪些基因来调控hESCs分化为DE的机制

结项摘要

人多能干细胞向内、外胚层(尤其是神经外胚层)的分化,一直是研究的热点。有许多基因被认为是人内胚层或者神经外胚层分化的标记基因,但真正决定多能干细胞不可逆转化的关键基因却还未被证实。锌指转录因子SNAI1是SNAIL家族成员之一,其最显著作用是作为E-cadherin的抑制因子,调控细胞的上皮间质转化,从而影响胚胎发育和肿瘤的发生。但是SNAI1在人的胚胎发育和胚胎干细胞命运转变过程中的作用仍然不清楚。本研究通过体外人胚胎干细胞(hESCs)向定型内胚层(DE)分化的体系以及单细胞定量PCR的技术研究发现,整个肝分化过程发生了上皮-间质转化以及间质-上皮转化(EMT-MET)的现象,并且,通过基因敲除技术敲除SNAI1的胚胎干细胞不能分化为定型内胚层以及肝细胞。本研究还采用单细胞定量PCR的技术研究了TGFb通路抑制剂Repsox对内胚层以及外胚层分化的影响,结果表明,Repsox可以抑制内胚层的分化并促进细胞向外胚层命运方向转变。本研究将有助于人们进一步理解早期胚胎发育的机理,并为多能干细胞定向分化的机制研究提供重要思路。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A sequential EMT-MET mechanism drives the differentiation of human embryonic stem cells towards hepatocytes.
连续的 EMT-MET 机制驱动人胚胎干细胞向肝细胞分化。
  • DOI:
    10.1038/ncomms15166
  • 发表时间:
    2017-05-03
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Li Q;Hutchins AP;Chen Y;Li S;Shan Y;Liao B;Zheng D;Shi X;Li Y;Chan WY;Pan G;Wei S;Shu X;Pei D
  • 通讯作者:
    Pei D

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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