tRNA碎片对IUGR仔猪肌肉代谢综合征的表观调控

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31902135
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1702.家畜种质资源与遗传育种学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The high mortality and morbidity caused by Intra-Uterine Growth Restriction (IUGR) have always been a major restraining factor in the development of China's pig industry. However, the molecular mechanism of IUGR biogenesis is not well characterized yet. Recent studies have shown that tRNA-derived fragments (tRFs) can act as a novel epigenetic molecule, which has similar functions as miRNAs on regulating target gene expression. Based on previous studies about epigenetic regulation of IUGR pigs and molecular mechanism of tRFs, the applicant intend to construct tRFs transcriptome maps of both normal and IUGR piglets’ muscle tissue, and identify tRFs associated with IUGR pig’s muscle metabolism syndrome. Furthermore, in vivo and in vitro experiments would be used to verify that tRFs participate in the biological processes of glucose tolerance of IUGR muscle, mitochondriopoiesis, and myoblast differentiation. All these would help to prove that tRFs are novel epigenetic regulatory molecules in IUGR biogenesis. The research will further improve and supplement the epigenetic regulation mechanism of pig IUGR biogenesis, which is conducive to the improvement of pig production efficiency, and also provides new research ideas for human IUGR research.
仔猪宫内发育迟缓(Intra-Uterine Growth Restriction, IUGR)引起的高死亡率和发病率一直是制约我国猪业发展的一大“瓶颈”,然而IUGR形成的分子机理目前尚不清楚。最新研究表明tRNA衍生片段(tRFs)作为一种新型的表观遗传分子,具有类似miRNAs调控靶基因表达的功能。申请人在已有对IUGR猪的表观调控和tRFs作用机制的研究基础上,通过构建正常和IUGR仔猪肌肉的tRFs转录组图谱;筛选和鉴定与IUGR猪肌肉代谢综合征相关的tRFs;并在细胞和活体水平验证tRFs参与肌肉的葡萄糖耐受、线粒体生成、成肌分化的生物学功能,从而在多个层面论证tRFs是IUGR形成的新型表观调控分子。本研究成果将进一步完善和补充猪IUGR形成的表观遗传调控机制,有利于养猪业生产效益的提高,也为人类IUGR的研究提供了新的研究思路。

结项摘要

仔猪宫内发育迟缓(Intra-Uterine Growth Restriction, IUGR)引起的高死亡率和发病率一直是制约我国猪业发展的一大“瓶颈”。肌肉作为受IUGR影响最为严重的器官,且与猪的瘦肉率、生长速度、肉质等重要经济性状密切相关,然而IUGR形成的分子机理目前尚不清楚。本项目聚焦一种来源tRNA衍生片段(tRFs)的新型表观遗传分子,进一步完善和补充猪IUGR形成的表观遗传调控机制。项目深度剖析了IUGR猪肌肉组织的表型特征,率先建立IUGR猪肌肉的tRFs转录组图谱,解析tRFs表达谱在IUGR条件下的变化规律,构建了关键tRFs调控IUGR肌肉代谢综合征的遗传调控网络;通过丰富的分子遗传学以及细胞生物学手段在细胞以及活体水平验证了tRF-Glu-TTC-047通过靶向IGF1促进IUGR猪肌肉组织蛋白质降解和抑制细胞增殖的调控机制、5'tiRNA-Gly通过靶向Tgfbr1促进肌肉再生和肌细胞的分化能力的调控机制、miR-29靶向IGF1和CCND1促进IUGR猪肌肉发育不良的遗传调控机制、miR-152靶向PKM参与IUGR猪肌肉肉质性状的调控机制。研究筛选和鉴定的特异性调控猪IUGR发生的tRFs和miRNAs,不仅可以推动养猪业的发展,也将为人类IUGR的预防与治疗提供重要的理论基础。.项目执行期间发表SCI学术论文7篇(第一标注6篇,第二标注1篇),中文核心期刊2篇(第一标注1篇,第二标注1篇),授权国家发明专利2项。项目负责人获四川省科技进步一等奖1项(排名第7)、全国农牧渔业丰收奖农业技术推广成果二等奖1项(排名第3,已公示),圆满完成了计划研究任务。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Identification of tRNA-derived small RNAs and their potential roles in porcine skeletal muscle with intrauterine growth restriction.
tRNA 衍生的小 RNA 的鉴定及其在宫内生长受限的猪骨骼肌中的潜在作用
  • DOI:
    10.3389/fphys.2022.962278
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in physiology
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
  • 通讯作者:
Characteristics of tRNA-Derived Small RNAs and microRNAs Associated with Immunocompromise in an Intrauterine Growth-Restricted Pig Model.
tRNA 衍生的小 RNA 和 microRNA 与宫内生长受限猪模型中免疫功能低下相关的特征
  • DOI:
    10.3390/ani12162102
  • 发表时间:
    2022-08-17
  • 期刊:
    Animals : an open access journal from MDPI
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
tRNA-derived small RNA, 5'tiRNA-Gly-CCC, promotes skeletal muscle regeneration through the inflammatory response.
tRNA 衍生的小 RNA,5âtiRNA-Gly-CCC,通过炎症反应促进骨骼肌再生
  • DOI:
    10.1002/jcsm.13187
  • 发表时间:
    2023-04
  • 期刊:
    Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
  • 通讯作者:
tsRNAs的作用机制及其在相关疾病中的潜在应用
  • DOI:
    10.13523/j.cb.2108037
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    中国生物工程杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    廖天赐;郑婷;沈林園;赵叶;牛丽莉;张顺华;朱砺
  • 通讯作者:
    朱砺
MiR-29a Family as a Key Regulator of Skeletal Muscle Dysplasia in a Porcine Model of Intrauterine Growth Retardation.
MiR-29a 家族作为宫内生长迟缓猪模型中骨骼肌发育不良的关键调节因子
  • DOI:
    10.3390/biom12091193
  • 发表时间:
    2022-08-28
  • 期刊:
    Biomolecules
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
  • 通讯作者:

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其他文献

Vitamin D Alleviates Rotavirus Infection through a Microrna-155-5p Mediated Regulation of the TBK1/IRF3 Signaling Pathway In Vivo and In Vitro
维生素 D 通过 Microrna-155-5p 介导的体内和体外 TBK1/IRF3 信号通路调节减轻轮状病毒感染
  • DOI:
    10.3390/ijms20143562
  • 发表时间:
    2019-07
  • 期刊:
    International Journal of Molecular Sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    赵叶;冉智明;蒋勤;胡宁敏;余冰;朱砺;沈林園;张顺华;陈蕾;陈洪;姜俊;陈代文
  • 通讯作者:
    陈代文

其他文献

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沈林園的其他基金

tRNA m7G修饰介导tRFs生物发生在IUGR猪肌肉代谢综合征中的机制研究
  • 批准号:
    32372844
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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