黄瓜单性结实基因Pc的精细定位与候选基因分析

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31101540
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1505.蔬菜、瓜果种质资源与遗传育种学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

黄瓜单性结实是植物果实发育生物学和设施黄瓜生产的重要性状,其分子机理是尚未解决的重要科学问题。本项目拟以鉴定得到的全雌性、非单性结实黄瓜品系XNU11(pcpc)为试材,利用4个单性结实黄瓜品系(PcPc)与其配制杂交组合和分离群体,对其非单性结实性状进行遗传分析并利用SSR标记进行分子标记初步定位。随后,利用黄瓜全基因组序列信息和扩大的分离群体,对Pc基因进行精细定位、染色体步移和候选基因区间鉴定。同时,将对所有材料不授粉、授粉条件下果实发育早期的生长素含量进行测定,明确供试材料单性结实性与生长素的关系。在此基础上,对候选基因区间的潜在基因进行生长素相关性生物信息学分析,多亲本间等位基因结构和表达情况差异分析,鉴定黄瓜单性结实基因Pc的候选基因。该结果对于最终克隆黄瓜单性结实基因,全面理解黄瓜单性结实的机制,以及我国黄瓜单性结实育种工作具有重要。

结项摘要

选用黄瓜单行不结实材料XNU11和单性结实材料XNP02,XNP05,XNP06配制杂交组合和分离群体,通过多年多群体分析,研究该性状的遗传规律,并对候选基因和QTL位点进行定位研究。同时还借助本课题的支持对黄瓜子房发育早期基因CsACS2进行了部分探索。获得主要研究结果如下:.1)分析了黄瓜全雌系单行不结实材料XNU11的表型特点,明确了黄瓜子房发育的分化时期,明确单性结实表型的判定时期为子房发育时期V。此时的黄瓜子房在单性不结实材料中表现为膨大期终结,未出现褪绿现象,花冠完全萎蔫;在单性结实材料中该时期后子房继续膨大。因此,明确该时期是单性结实性状判断的关键时期。同时明确黄瓜材料XNU11为全雌系单行不结实材料,黄瓜材料XNP02,XNP05,XNP06均为全雌系,单性结实材料。.2)利用XNU11与XNP02,XNP05,XNP06分别配制杂交组合和分离群体。数据分析表明,单性结实性状比较复杂,受环境影响明显。秋季种植群体表现出明显的数量性状遗传的特点。而春季数据表现为质量性状。.3)利用两组秋季群体构建两张黄瓜遗传连锁图谱。图谱覆盖度较高,标记分布均匀。图谱分别包含60个SSR标记,总图距587.8 cM和62个SSR分子标记,总图距597.5 cM。整合图谱表明,上述两图谱共线性较高,作图准确。整合后图谱包含62个SSR分子标记,总图距620.2 cM,不存在共定位的分子标记。.4)利用遗传图谱分析黄瓜单性结实QTL,表明在两个秋季群体中存在一个共同的QTL位点,pc6.1-12A/13A。该位点位于黄瓜染色体VI上,位于分子标记S6004与S6021之间,定位区间长19.5 cM(2012年秋季数据)和13.7 cM(2013年秋季数据)。该位点可以进行染色体代换系构建。.5)对春季表型数据进行质量性状基因定位,结果发现6个可能与单性结实控制位点连锁的分子标记,分别位于黄瓜染色体V的6.0 cM处,和黄瓜染色体VII的35.6~59.3 cM区段。与秋季数据数量性状QTL定位并不一致,表明环境因素可能通过不同基因对黄瓜单性结实表型发挥作用。.6)分析黄瓜子房早期发育相关基因CsACS2的功能。表明该基因可以产生乙烯,同时乙烯可以诱导该基因表达。推测可能存在以乙烯为核心的正回馈诱导表达现象,从而维持该基因在黄瓜雌花/子房发育中的“长期”表达。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A putative positive feedback regulation mechanism in emCsACS2/em expression suggests a modified model for sex determination in cucumber (emCucumis sativus /emL.)
CsACS2 表达中假定的正反馈调节机制提出了黄瓜 (Cucumis sativus L.) 性别决定的改良模型
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Journal of Experimental Botany
  • 影响因子:
    6.9
  • 作者:
    Zheng Li;Shu Wang;Qianyi Tao;Junsong Pan;Longting Si;Zhenhui Gong;Run Cai
  • 通讯作者:
    Run Cai
A further analysis of the relationship between yellow ripe-fruit color and the emCapsanthin-Capsorubin Synthase/em gene in pepper (emCapsicum sp./em) indicated a new mutant variant in emC. annuum/em and tand
黄色熟果颜色与果实品质关系的进一步分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    PLos One
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    李征
  • 通讯作者:
    李征
A further analysis of the relationship between yellow ripe-fruit color and the emCapsanthin-Capsorubin Synthase /emGene in Pepper (emCapsicum/em sp.) Indicated a new mutant variant inem C. annuum /emand a ta
进一步分析辣椒 (Capsicum sp.) 黄色成熟果实颜色与辣椒红素-辣椒红素合酶基因之间的关系,表明辣椒 (Capsicum sp.) 中存在新的突变体变种和 a ta
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    PLOS ONE
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zheng Li;Shu Wang;Xiaoling Gui;Xiaobei Chang;Zhenhui Gong
  • 通讯作者:
    Zhenhui Gong

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其他文献

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  • 通讯作者:
    赵兴
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李文华;李征
  • 通讯作者:
    李征

其他文献

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黄瓜侧枝形成的分子机制与育种应用研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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