青藏高原湖泊钩虾的适应性辐射

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31772417
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The uplift of the Tibetan Plateau and the Pleistocene climate cycles is assumed to have triggered organism diversification. The crustacean gammarids are widespread in Tibetan lakes, which are adapted to high-elevation and low temperature of water. In this project, we are going to collect specimens from the Tibetan Plateau and adjacent areas, and investigate the gammarid adaptive radiation based on morphology, genome-wide dataset and bioinformatics. We aim at (1) exploring the phylogenetic affinities and colonization histories of gammarids across the Tibetan Plateau, (2) determining whether dates of lineage splitting coincide with glacial cycles on the basis of coalescent theory, (3) characterizing the species composition and distribution pattern based on phylogenetic framework and morphological examination, (4) uncovering the genetic mechanism between the adaptive radiation and Tibetan extreme environment conditions by genomic analyses. This project seeks to understand how Tibetan uplift and associated climate changes influence the radiation of species and, in turn how animals adapt to ecological changes.
青藏高原是地球上海拔最高、湖泊数量最多、面积最大的高原湖群区,多样的湖泊类型和特殊的地理位置,决定了青藏高原是研究生物演化与极端环境相互作用的理想地区。 本项申请以青藏高原湖泊广泛分布的甲壳动物钩虾为研究对象,结合形态学、基因组学及生物信息学方法,探讨湖泊钩虾在青藏高原的适应性辐射。研究目标包括(1)基于基因组数据构建系统发育关系,推测钩虾进入青藏高原的时间和路径;(2)基于溯祖理论分析钩虾在青藏高原湖泊中辐射的过程,揭示冰期气候旋回对钩虾多样性分化的影响;(3)基于分子系统学研究结果,结合形态学特征,阐明青藏高原钩虾的物种组成及分布格局;(4)挖掘基因组数据,探索钩虾适应青藏高原极端环境(高海拔、高盐、低水温)的遗传机制。研究结果将揭示青藏高原湖泊水生生物的分布规律及其对湖泊环境变化过程的响应,为进一步研究生物对高海波、低温等极端环境的适应、全球气候变化等重大科学问题提供科学依据。

结项摘要

青藏高原湖泊众多,栖息着丰富的冷水适应性钩虾。本申请项目拟通过探讨青藏高原湖泊钩虾的适应性辐射,解析青藏高原物种多样性的起源与演化路径,探明湖泊钩虾适应青藏高原极端环境而快速辐射的遗传机制。研究成果包括:(1)开展青藏高原及其周边地区湖泊采集,新增510个采集点,新增钩虾标本1500余号;发现新种16个,雌性新描述1个,并对青藏高原、天山和中亚地区的钩虾进行了系统研究给出了这些地区的分布图和检索表。(2)构建了青藏高原及其周边地区湖泊钩虾的系统发育关系,发现青藏高原湖泊钩虾从天山拓殖而来,具有明显的遗传结构,分为藏东南支系、喜马拉雅支系和藏北支系,揭示上新世/更新世青藏高原湖泊的大量形成为钩虾适应性辐射提供生态机遇。(3)抚仙湖等高原湖泊钩虾祖先分布在北太平洋海洋中,由于渐新世全球气候变冷海平面下降而转移到淡水生境中,在10百万年前扩散至云南高原湖泊中,并在湖泊中发生辐射演化形成特有属种。(4)对甲壳动物等水生动物的化石、系统发育关系及现生分布资料,发现1500万年前特提斯海闭合导致地中海和印度-西太平洋动物的隔离分化,板块运动和特提斯海闭合极大地扩大了印度-西太平洋区的浅海生境,为浅海动物多样性分化提供生态机遇,促进印度-西太平洋区成为动物多样性热点地区。(5)分析了采自248个地点的雾灵钩虾的生物地理历史、多样性分化速率和生态位分布,探索长白山对淡水钩虾多样性演化的影响,发现雾灵钩虾28个百万年前起源于长白山,与长白山在渐新世晚期的初次火山活动时间相吻合,各支系的多样性分化与长白山在中新世的剧烈隆升以及日本海的打开事件相关,长白山火山活动是东北亚钩虾多样性分化的物种泵,多次向周边地区输送物种。依托本项目发表论文13篇,包括发表在Biological Reviews、Molecular Ecology、Journal of Biogeography等SCI源刊文章11篇,其他论文2篇。.本项目基本厘清青藏高原及其周边地区钩虾物种多样性起源演化路径,为资源保护提供关键数据,为预测当今气候环境变迁对生物多样性的影响提供科学依据。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Floresorchestia xueli, a new terrestrial crustacean (Amphipoda, Talitridae) from Yunnan, China
Floresorchestia xueli,来自中国云南的一新陆生甲壳类动物(片足纲,螟科)
  • DOI:
    10.11646/zootaxa.4991.2.5
  • 发表时间:
    2021-06-24
  • 期刊:
    ZOOTAXA
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    Tong,Yan;Hao,Jiasheng;Hou,Zhonge
  • 通讯作者:
    Hou,Zhonge
Seven new freshwater species of Gammarus from southern China (Crustacea, Amphipoda, Gammaridae).
华南淡水虾属七新种(甲壳纲、片足纲、虾科)
  • DOI:
    10.3897/zookeys.749.23165
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Hou Z;Zhao S;Li S
  • 通讯作者:
    Li S
Four new Gammarus species from Tibetan Plateau (Crustacea: Amphipoda: Gammaridae) with a key to Tibetan freshwater gammarids
青藏高原四种新的伽马属物种(甲壳类:片足纲:伽马科)以及青藏淡水伽马科的关键
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Zhonge Hou;Shuqiang Li
  • 通讯作者:
    Shuqiang Li
Sarothrogammarus yiiruae, a new species of Amphipoda (Gammaridae) from China
Sarothrogammarus yiiruae,中国片足纲(Gammaridae)一新种
  • DOI:
    10.3897/zookeys.861.35538
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    ZooKeys
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Zheng Yami;Hou Zhonge;Li Shuiqiang
  • 通讯作者:
    Li Shuiqiang
Eocene-Oligocene climate changes drove amphipod habitat shift from marine to freshwater in the Far East
始新世-渐新世气候变化导致远东片脚类栖息地从海洋转向淡水
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Zoologica Scripta
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Yulong Li;Shuqiang Li;Hongguang Liu;D. K. Kurenshchikov;Zhonge Hou
  • 通讯作者:
    Zhonge Hou

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其他文献

中国淡水钩虾的物种多样性
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李枢强
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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
    侯仲娥
海侵驱动的生物多样性增加
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  • 通讯作者:
    李枢强
中国四川省洞穴钩虾属一新种(甲壳纲,端足目,钩虾科)(英文)
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  • 发表时间:
    2013
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  • 发表时间:
    2021
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    河北大学学报(自然科学版)
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  • 作者:
    李枢强;赵喆;侯仲娥
  • 通讯作者:
    侯仲娥

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侯仲娥的其他基金

跳钩虾从海洋到陆地高山的多样性演化
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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