五大连池火山群铁氧化菌生物多样性及其与环境因子的关系

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基本信息

  • 批准号:
    31100006
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0101.微生物多样性、分类与系统发育
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

铁氧化菌(Iron oxidizing bacteria, IOB)是一类分布极为广泛的古老微生物,因其在铁的地球化学循环、生物浸出以及环境治理中的重要作用,而成为目前微生物学领域的一大研究热点。本项目拟以五大连池火山群IOB为研究对象,通过双层平板法和梯度试管法分别对嗜酸和嗜中性IOB进行分离;通过PCR-RFLP技术对富集IOB的多样性和系统发育进行研究;应用PCA和CCA探讨火山环境因子同IOB多样性的关系。以此来阐明五大连池火山群IOB的组成、系统发育及分布特征,揭示不同形成时期火山之间、陆相与水相环境之间,以及地表水和矿泉水之间IOB的结构差异,为研究火山环境铁元素的地球化学循环、阐明火山微生物的分布特征,揭示火山群微生物生态系统的结构和功能,开发利用极端环境微生物资源提供重要的基础资料。

结项摘要

本项目考察了五大连池火山群IOB的多样性、分布格局及其同环境因子的关系。在IOB资源挖掘及应用潜力研究方面,分离筛选获得了49株嗜酸IOB,主要包括Acidithiobacillus ferrooxidans(A.ferrooxidans)、Leptospirillum ferrooxidans (L. ferrooxidans)及Leptospirillum ferriphilum,获得了6个具有高效氧化亚铁活性的IOB复合菌系,利用这些IOB初步构建了五大连池IOB种质资源库。从五大连池火山区占主导的A.ferrooxidans的菌株中挑选一株进行全基因组测序,结果表明其DNA大小有3.14Mbp,含有32719个编码蛋白基因及64个RNA基因。对代表性IOB的亚铁氧化潜力及应用潜力研究结果显示,纯培养菌株及复合IOB均具有较好的亚铁氧化能力,A.ferrooxidans、L. ferrooxidans及L. ferriphilum均能高效浸出雄黄,其浸出率分别达到74.27%、52.55%及56.84%。理化参数分析显示,同一座火山不同采样点之间由于相隔较远,其理化性质存在较大差异,而水体理化性质差异较小。23个样品的RFLP分析后总共获得100个OTUs,其中嗜中性IOB主要分布在Gallionella、Sideroxydans 及Ferritrophicum三个属中,而嗜酸性IOB主要分布在Acidithiobacillus属和Leptospirillum属中。PCA及CCA分析显示,IOB的分布均或多或少与理化因子相关,尤其是pH以及亚铁、S浓度,其中,pH以及亚铁对IOB的分布影响贡献最大。新老两期火山之间在IOB分布上存在的差异主要表现为老年火山有嗜中性IOB及属于古菌域的IOB分布。地表水有嗜中性IOB分布,而地下水未见,而这些山体之间IOB分布相似特征是Acidithiobacillus.spp 及Leptospirillum.spp都为绝对优势菌种。陆相有古菌域的Ferroplasma acidiphilum分布,水相未发现,水相嗜中性IOB种类较陆相多。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(2)
Optimal conditions for growth and magnetosome formation of Acidithiobacillus ferrooxidans
氧化亚铁硫杆菌生长和磁小体形成的最佳条件
  • DOI:
    10.5897/ajmr12.157
  • 发表时间:
    2012-08
  • 期刊:
    African Journal of Microbiology Research
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张爽;晏磊;李红玉;刘和涛
  • 通讯作者:
    刘和涛
Magnetic properties of emAcidithiobacillus ferrooxidans/em
氧化亚铁硫杆菌的磁性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Materials Science and Engineering: C
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    晏磊;张爽;陈朋;王伟东;王彦杰;李红玉
  • 通讯作者:
    李红玉
Magnetotactic bacteria, magnetosomes and their application
趋磁细菌、磁小体及其应用
  • DOI:
    10.1016/j.micres.2012.04.002
  • 发表时间:
    2012-01-01
  • 期刊:
    MICROBIOLOGICAL RESEARCH
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Yan, Lei;Zhang, Shuang;Li, Hongyu
  • 通讯作者:
    Li, Hongyu

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其他文献

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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
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晏磊的其他基金

五大连池火山堰塞湖沉积物中趋磁细菌多样性、时空分布及磁性贡献
  • 批准号:
    41471201
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    82.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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