联合细胞因子风暴、基因分型和临床特征的“人感染H7N9禽流感”支持向量机预后模型

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81401707
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2109.医学病毒学与病毒感染研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Human infection with avian influenza A (H7N9) virus is a newly emerging infectious disease, which shows special features like rapid onset, sever progress and bad prognosis in hundreds of cases mainly in China since March 2013. Proposer’s team member and/or colleagues found that Cytokine Storm (or hypercytokinemia) of host immune system is common in H7N9 infected cases and associated with the prognosis. Based on these published results, we aims to investigate the single nucleic polymorphism of those cytokine genes between individual patients. Secondly, since we are in urgent need of a simple and valid prognosis model based on the cytokine storm recently. The team will employ the Support Vector Machine (SVM) approach to establish a prognosis model by integrating the information from cytokine storm, cytokine genotypes and other clinical characteristic. This model is designed to make full usage of the data generated form the Peripheral Blood collected routinely in clinic, and is of great importance in predicting the prognosis or guiding choice of different therapies.
人感染H7N9禽流感是一种新发传染性疾病,起病急、病程发展迅速且预后较差。根据申请人所在团队前期已发表“细胞因子风暴”在H7N9感染患者中常见、并与治疗预后密切相关的研究结果,本课题进一步考察患者个体间在细胞因子基因分型上的不同特征。另一方面,H7N9治疗过程中亟需基于细胞因子风暴的简便、有效和可靠的预测模型。本课题将系统地联合细胞因子、基因分型及临床特征等数据,通过支持向量机算法这一生物信息学技术,构建符合研究需要的的预后预测模型。上述研究结果有望在基础研究层面更好地分析和利用临床来源H7N9禽流感病毒感染者的外周血检测结果,预测不同个体病情进展,并可能为临床方案制定提供较为可靠的实验性依据。

结项摘要

本项目实施期间,按照申请书“研究内容”、“分年度计划”以及“相关调整”,分别完成以下任务:完成对H7N9患者的细胞因子表达谱的建立、分析和预测,以及在此基础上重点筛选出在临床救治过程中难以降低的IL-6和TNF-alpha两种细胞因子,对其导致免疫系统紊乱的分子机制进行了更深入的研究。通过建立Con A、AAI等诱导的小鼠细胞因子风暴模型,项目组发现花生四烯酸经由5-脂氧合酶代谢通路激活的炎性终产物与主要脏器损伤密切相关。通过课题研究的推进,项目组在基本完成了H7N9患者的细胞因子表达谱和预测的基础上,还参与了通过人工肝支持系统对患者的临床救治研究。在救治过程中发现IL-6和TNF-alpha等细胞因子无法有效清除,可能是造成患者重症化、预后差的关键因素,并对此进行了深入的机制研究。在上述基础上,项目组还将对细胞因子风暴的研究扩展到了癌变前期的研究中,并取得了一定初步进展。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
Hepatic Premalignant Alterations Triggered by Human Nephrotoxin Aristolochic Acid I in Canines
人肾毒素马兜铃酸 I 引发犬类肝脏癌前改变。
  • DOI:
    10.1158/1940-6207.capr-15-0339
  • 发表时间:
    2016-04-01
  • 期刊:
    CANCER PREVENTION RESEARCH
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Jin, Ke;Su, Kun-kai;Lou, Yi-jia
  • 通讯作者:
    Lou, Yi-jia
Premalignant alteration assessment in liver-like tissue derived from embryonic stem cells by aristolochic acid I exposure.
马兜铃酸 I 暴露对胚胎干细胞来源的肝样组织的癌前改变评估
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.12424
  • 发表时间:
    2016-11-29
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li T;Jin K;Zhu DY;Li L;Mao ZR;Wu BW;Wang YF;Pan ZF;Li LJ;Xiang CS;Su KK;Lou YJ
  • 通讯作者:
    Lou YJ
MicroRNA-674-5p/5-LO axis involved in autoimmune reaction of Concanavalin A-induced acute mouse liver injury
MicroRNA-674-5p/5-LO轴参与伴刀豆球蛋白A诱导的小鼠急性肝损伤的自身免疫反应
  • DOI:
    10.1016/j.toxlet.2016.06.010
  • 发表时间:
    2016-09-06
  • 期刊:
    TOXICOLOGY LETTERS
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Su, Kunkai;Wang, Qi;Li, Lanjuan
  • 通讯作者:
    Li, Lanjuan

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其他文献

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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