氢交换质谱研究蛋白质与DNA药物复合物之间的相互作用

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    21055002
  • 项目类别：
    专项基金项目
  • 资助金额：
    10.0万
  • 负责人：
    罗群
  • 依托单位：
    中国科学院化学研究所
  • 学科分类：
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2011-12-31

项目摘要

DNA结合蛋白与DNA之间的分子识别是一种非共价键弱相互作用。由于基于非共价键的蛋白质－DNA复合物在气相状态下不稳定，常规的质谱分析很难得到完整的复合物结构信息，因而，发展新的质谱分析技术非常必要。蛋白质和DNA的相互作用，通过改变作用位点及周边区域的微化学环境，影响主链上酰胺氢与溶液中氘的交换速率，为蛋白质及其复合物的构象研究提供了一系列离散的传感器。本项目拟整合稳定同位素标记、蛋白质快速酶解、多肽低温超快速分离和高分辨MS/MS分析，建立氢氘交换质谱分析方法，通过测定蛋白质与DNA结合前后，主链酰胺氢与氘交换速率的变化，确定蛋白质和DNA相互作用的位点。为下一步研究DNA-金属抗癌药物复合物与蛋白质的非共价键相互作用、探索DNA结合蛋白在细胞药物应答中的功能和作用提供方法学基础和平台。

结项摘要

项目成果

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其他文献

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  • DOI：
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    --
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
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  • 通讯作者：
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
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  • 通讯作者：
    汪福意

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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