atp7b基因外显子编码区变异致mRNA异常剪接的致病机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81400580
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H03.消化系统
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Wilson’s disease (WD) is an abnormal copper metabolism disorder that is caused by atp7b gene mutation. Up-to-date, there are clear limitations in the mechanism research about atp7b gene mutation dysfunction. They just studied the changes of amino acid caused by mutation, but overlooked the mRNA abnormal splicing. According to the current research dates, there are 25%~50% of known mis-sense and nonsense disease-causing mutations alter functional splicing signals within exons. Forty different mutations, including 14 novel mutations, were identified in our preliminary study. 38 mutations of them located in exon coding area and most of them unknown the dysfunction. Addition to, there are distinctive difference between the genotype and the phenotype in some patients. These dates further suggest that the current researches have limitation. By gene sequencing, reverse transcription sequencing, exon trapping, RT-PCR etc. technology, we can find the abnormal mRNA splicing and study the error frequency and dysfunction caused by mutations which located in exon coding area. The present study therefore aimed to broaden the knowledge of pathogenesis of WD and contribute to diagnosis and future therapy of WD.
肝豆状核变性(WD)是我国非病毒性肝炎较为常见的肝病致病原因, 为atp7b基因突变导致的铜代谢异常的疾病。目前已有的atp7b基因突变的致病机制的研究方法存在明显的局限性,仅考虑了基因突变对蛋白序列的影响,而忽视了突变对mRNA剪接的影响。据目前数据显示,至少25%~50%的人类致病突变会影响基因剪接。我们的前期研究共检测到atp7b基因40种不同的变异,38种突变位于外显子编码区,其中大部分突变对功能的影响至今未知,另外部分患者也存在临床表型与基因表型明显不一致的情况,这进一步提示目前的研究方法存在不足的地方。本研究拟从外显子编码区突变对mRNA剪接的影响入手,利用基因测序、RNA逆转录测序、exon trapping、RT-PCR等技术发现异常剪接体,并从突变导致异常剪接出错的频率及功能上两方面入手解释突变的分子致病机制,加深我们对WD发病机制的认识,为临床诊断及将来的治疗提供依据。

结项摘要

肝豆状核变性(WD)为我国非病毒性肝炎较为常见的肝病致病原因,为ATP7B基因突变导致的铜代谢异常的疾病。目前已有的ATP7B基因突变的致病机制的研究方法存在明显的局限性,仅考虑了基因突变对蛋白序列的影响,而忽视了突变对mRNA剪接的影响。据目前相关研究的数据显示,至少25%~50%的人类致病突变会影响基因的剪接。本研究从外显子编码区突变对mRNA剪接的影响入手,利用基因测序、RNA逆转录测序、exon trapping、RT-PCR等技术发现异常剪接体,并从突变导致异常剪接出错的频率及功能上两方面入手解释突变的分子致病机制。项目研究已经建立成熟的ATP7B基因突变的生物信息学分析方法。已经开展临床ATP7B基因检测确诊WD病人41例,发现变异28种,其中新突变6个扩展了ATP7B基因突变谱,为我们认识WD的分子致病机制提供了数据支持;通过对部分WD病人及正常肝脏组织mRNA逆转录PCR测序分析未发现外显子区基因变异对mRNA异常的影响;构建了ATP7B基因外显子捕获质粒并完成正常及基因突变剪接捕获实验,为今后研究ATP7B剪接核心序列剪接突变的分子致病机制研究提供了新手段;构建了ATP7b正常及体外基因突变的真核表达克隆,并在 HepG2肝癌细胞及 CHO 细胞的真核表达,建立研究突变蛋白的稳定性、亚细胞定位及铜毒性试验的研究方法,可为今后ATP7B分子致病机制的研究提供基础。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Novel gain of function mutation in the SLC40A1 gene associated with hereditary haemochromatosis type 4
与 4 型遗传性血色病相关的 SLC40A1 基因的新功能获得性突变。
  • DOI:
    10.1111/imj.12764
  • 发表时间:
    2015-06-01
  • 期刊:
    INTERNAL MEDICINE JOURNAL
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Chen, S. -R.;Yang, L. -Q.;Li, X. -H.
  • 通讯作者:
    Li, X. -H.
从遗传角度看“不明原因肝病”的临床基因诊断
  • DOI:
    10.3969/j.issn.1672-5069.2018.01.002
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    实用肝病病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李新华;崇雨田
  • 通讯作者:
    崇雨田
Soluble ST2 plasma concentrations predict mortality in HBV-related acute-on-chronic liver failure.
可溶性 ST2 血浆浓度可预测 HBV 相关慢加急性肝衰竭的死亡率。
  • DOI:
    10.1155/2015/535938
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Mediators of inflammation
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Lei Z;Mo Z;Zhu J;Pang X;Zheng X;Wu Z;Wang K;Li X;Xie D;Gao Z
  • 通讯作者:
    Gao Z

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其他文献

副干酪乳杆菌对甘薯浆液中淀粉絮凝机理研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    李新华;赵晓阳;张荔力
  • 通讯作者:
    张荔力
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  • 作者:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    尹国华

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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