长江口海区腹毛亚纲纤毛虫的多样性与时空分布研究

The diversity and spatial-temporal distribution of hypotrichous ciliates in coastal waters near the Yangtze River estuary will be investigated using taxonomic, molecular and ecological methods. New species will be described, and poorly known species redescribed from specimens examined in vivo and following silver impregnation. Related marker genes will be sequenced as well. Based on these data, a user-friendly guide to the identification of hypotrichs in this area will be produced. In addition, spatial and temporal distribution will be determined by direct examination of environmental samples. This programme will be the first of its kind carried out in the East China Sea and will therefore reveal novel information on the species diversity, geography, and temporal-spatial patterns of hypotrichs. Furthermore, it will help to understand the role of hypotrichs in the estuarine and coastal ecosystems, and will benefit the formulation of a management strategy for the Yangtze River estuary whereby its biodiversity can be protected, and environmental amenity value improved.

结合现代分类学、分子生物学及生态学手段，对以我国长江口近岸海区为客体的腹毛亚纲纤毛虫的物种多样性进行研究，同时探讨其时空分布规律，填补我国东海海区本类群的研究空白，给出我国首份长江口海区基于现代研究分类学手段的腹毛亚纲纤毛虫多样性资料。内容涉及对该类群基本构成的摸底、种类鉴定、清理传统分类学中的混乱和错误，报道新阶元，建立相关的生态学数据，给出种名录及图鉴式资料，获得标记基因的分子序列信息。本工作将填补我国该海区腹毛亚纲的分类学空白，同时将获得有关区系构成及时空分布等的第一手数据，为深入了解该类生物在河口及近岸海洋生态系统中的地位与功能提供重要的基础资料，也为该海区生境的改善与评估建立一份"历史性"档案资料和中远期环境变迁的参照系。

本课题在2013-2015三年时间内，以现代分类学结合分子生物学和生态学手段，对长江口近岸海区的嵊泗养殖区、吕四渔港、洋山港潮间带、南汇湿地等多个生境的腹毛亚纲纤毛虫的物种多样性进行了研究，并初步探讨了其时空分布。主要内容包括：（1）结合传统光镜观察和现代银染技术，鉴定腹毛类纤毛虫近40种，包括6个新种，10多个存疑种，提供了种的分类学/形态学资料，对相关属长期存在的混乱、不明进行澄清和厘定；（2）对约30个种／种群进行DNA提取，SSU rRNA基因序列测定，部分种类进行了ITS测序，以此对多样性资料进行补充，对部分相关属／科的系统关系进行重建；（3）南汇湿地纤毛虫原生动物群落构成变化及其与环境因子的相互关系探讨。相关工作已形成7篇论文，其中6篇发表在SCI收录的国际主流期刊。研究成果填补我国长江口海区腹毛亚纲的分类学和系统学多处空白，建立了腹毛类纤毛虫的多样性本底信息和基础的生态学数据，为未来对该海区环境之修复和变迁的评估提供重要历史性档案资料。

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