基于核酸适配体的百草枯残留快速检测与去除研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21565009
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Paraquat was widely used as an efficient herbicide in agriculture over the past few decades. Due to improper use of paraquat, some adverse issues like pesticides residues and incidents of human poisoning have attracted people’s attention in recent years. The current technologies for paraquat detection and separation usually need complicated operations and expensive instruments, so they can not meet the demands of rapid and on-site residues assay or removal. Aptamer exhibits many advantages and has been regarded as an ideal recognition tool for biological detection and separation. Unfortunately, there still lack any report involving in the aptamer-based technology for the detection and removal of paraquat residues. In this project, we will adopt our previous strategy of “a novel SELEX method for aptamer toward small molecules without enough sites for immobilization”, for the selection of aptamers with high affinity to paraquat. The distinguished feature of our SELEX method is immobilizing ssDNA libraries rather than target molecules on a matrix. We will choose some functional nanoparticles like carbon dots (CDs) and gold nanoparticles as sensing signals of fluorescent, colorimetric and Rayleigh resonance scattering (RRS), and investigate the interactions among aptamers, nanoparticles and targets, thus propose several rapid detection methods for paraquat residues existing in agricultural and sideline products. Moreover, we will also employ the selected aptamer as an affinity ligand, to prepare functional materials for the efficient removal of paraquat residues in some special samples.
百草枯作为高效除草剂被长期广泛应用于农业生产中,由于使用不当等原因造成农产品残留超标、人体中毒等一系列突出问题。现有百草枯检测和分离技术存在如操作繁琐、依赖大型仪器等多方面缺陷,难以满足原位快速检测和去除的实际需求。核酸适配体作为识别分子展现出诸多优势,在生物检测和分离方面有广阔的应用潜力。遗憾的是目前还缺少有关核酸适配体技术进行百草枯残留检测和去除的报道。本项目以申请人前期提出的“无固定化点靶标的适配体筛选方法”为基础,将随机ssDNA库固定在介质上,先筛选出百草枯的高亲和性核酸适配体,并以其作为识别分子,再选择碳量子点(CDs)、金纳米颗粒(AuNPs)等纳米粒子作为信号输出载体,发展几种快捷的荧光、比色、共振散射等检测信号,建立基于核酸适配体的农副产品百草枯残留快速分析方法。此外,本项目还将筛选的核酸适配体作为亲和配体,制备相应的分离材料,实现对特定环境中百草枯残留的有效去除。

结项摘要

核酸适配体具有蛋白抗体类似作用,在靶标特异性识别上越来越受到重视,已被广泛应用于各种小分子、生物大分子甚至整个细胞的检测。小分子物质通常与环境污染和人类健康密切相关,然而小分子物质与核酸文库在性质上差异较小,在筛选过程中没有足够的活性位点难以固定,因而其核酸适配体筛选难度更大。百草枯属于小分子高效除草剂,毒性极大且口服中毒死亡率极高,因而有必要对其在农产品中的残留进行超灵敏检测。虽然近年来核酸适配体技术在农药检测领域取得一些进展,但是还未见利用该技术检测百草枯的报道。本项目先采用体外合成一条生物素修饰的碱基序列,通过氢键与随机文库3’-末端进行互补配对,将其固定在链霉亲和素修饰的纳米磁珠上。随后加入不同浓度的百草枯靶标进行孵育,通过洗脱得到百草枯的亲和性ssDNA,对其进行非对称PCR扩增后得到下一轮筛选所需的富集ssDNA库。经过9轮筛选后将所得亲和性ssDNA进行克隆测序,最后得到15条百草枯的亲和ssDNA序列。对亲和性序列进行聚类分析和二级结构预测,再根据同源性等条件从中挑选出6条ssDNA序列进行亲和力测定。结果表明PQ-15序列对百草枯的亲和力最高,其对靶标的解离常数(Kd)为(54 ± 4) nmol/L。最后利用PQ-15核酸适配体作为百草枯的识别分子,以阳离子化合物聚集的胶体金(AuNPs)作为传感信号,建立了基于核酸适配体识别的百草枯农药比色检测方法,检测限为25.2 nmol/L,其它竞争性靶标对百草枯检测无明显干扰,实际样品中百草枯的加标回收率为91.13% ~99.60%。此外,本项目开展了核酸传感信号的设计与检测应用研究。选择AuNPs、二硫化钨纳米片、氧化锰纳米颗粒、氯化血红素等作为比色信号材料,着重研究了它们的形态、成分、元素价态、底物种类等对其模拟酶活性的影响,并直接与危害物作用或通过功能性核酸序列对催化反应进行调控,从而建立了一系列危害物比色检测新方法。选择碳量子点(CDs)作为荧光信号,利用AuNPs和胶体银(AgNPs)作为荧光猝灭剂,并通过核酸适配体对荧光猝灭作用进行调控,从而建立了一系列危害物荧光检测新方法。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(12)
Colorimetric Determination of Isocarbophos Based on Enhanced Peroxidase-like Activity of Hemin
基于增强氯化血红素类过氧化物酶活性的异卡波磷比色测定
  • DOI:
    10.11895/j.issn.0253-3820.160875
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Chinese Journal of Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    Chen Huayun;Wu Yuangen;Yang Wenping;Zhao Jing
  • 通讯作者:
    Zhao Jing
基于Fe3O4过氧化物酶活性的Cd2 和Pb2 比色传感器
  • DOI:
    10.19586/j.2095-2341.2019.0093
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    生物技术进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨文平;吴远根
  • 通讯作者:
    吴远根
A novel fluorescent aptasensor for ultrasensitive and selective detection of acetamiprid pesticide based on the inner filter effect between gold nanoparticles and carbon dots
基于金纳米颗粒和碳点之间的内过滤效应的新型荧光适体传感器,用于超灵敏选择性检测啶虫脒农药
  • DOI:
    10.1039/c8an01166d
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Analyst
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Wang Jinlong;Wu Yuangen;Zhou Pei;Yang Wenping;Tao Han;Qiu Shuyi;Feng Caiwei
  • 通讯作者:
    Feng Caiwei
Oligonucleotide-induced regulation of the oxidase-mimicking activity of octahedral Mn3O4 nanoparticles for colorimetric detection of heavy metals
寡核苷酸诱导调节八面体 Mn3O4 纳米粒子的氧化酶模拟活性,用于比色检测重金属
  • DOI:
    10.1007/s00604-019-4069-2
  • 发表时间:
    2020-01-07
  • 期刊:
    MICROCHIMICA ACTA
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Wang, Jiajia;Wang, Jinlong;Wu, Yuangen
  • 通讯作者:
    Wu, Yuangen
Colorimetric detection of streptomycin in milk based on peroxidase-mimicking catalytic activity of gold nanoparticles
基于金纳米粒子模拟过氧化物酶催化活性的比色检测牛奶中的链霉素
  • DOI:
    10.1039/c7ra06434a
  • 发表时间:
    2017-08
  • 期刊:
    RSC Advances
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Zhao Jing;Wu Yuangen;Tao Han;Chen Huayun;Yang Wenping;Qiu Shuyi
  • 通讯作者:
    Qiu Shuyi

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其他文献

黑曲霉固态发酵麻疯树饼粕产蛋白酶及酶学性质研究
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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基于银基纳米漆酶催化的食品农药残留比色检测与传感响应机制研究
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基于适配体的纳米酶催化调控及其对食品农药残留检测新方法研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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