基于核小体动态水平研究解毒祛瘀滋肾方治疗系统性红斑狼疮的转录调控机制

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基本信息

  • 批准号：
    81102580
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    侯晓丽
  • 依托单位：
    浙江中医药大学
  • 学科分类：
    H3108.中医内科学
  • 结题年份：
    2014
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

系统性红斑狼疮（SLE）一种累及多器官系统的自身免疫性疾病，对人体的危害性极大。临床研究发现，解毒祛瘀滋肾法治疗SLE，疗效显著，但是其治疗作用的分子生物学机制还不清楚？近期研究表明组蛋白3第4位赖氨酸二甲基化（H3K4me2）可以在基因组水平，较好地标记受到外界刺激后核小体定位动态变化：核小体移位暴露的H3K4me2标记的DNA片段，可供转录因子结合，调控基因表达。因此，本研究拟采用染色质免疫沉淀-高通量测序（ChIP-seq）技术，分析解毒祛瘀滋肾治疗的SLE患者外周血单核细胞H3K4me2，运用生物信息学方法归类分析结果，从H3K4me2的分布分析核小体定位，推测验证与解毒祛瘀滋肾相关的基因转录调控位点及可能结合的转录因子位置与种类，探讨SLE解毒祛瘀滋肾法治疗机制。

结项摘要

系统性红斑狼疮（SLE）是一种累及多器官系统的自身免疫性疾病。我们前期研究表明解毒祛瘀滋肾方是从多靶点、多方位、多层次对机体进行综合调节而发挥作用。因此，本研究采用染色质免疫沉淀-高通量测序（ChIP-seq）技术，在基因组整体范围内，分析解毒祛瘀滋肾方治疗的SLE患者外周血单核细胞H3K4me2标记的核小体动态变化，运用生物信息学方法归类分析结果，得到中药方剂治疗后染色体开放区域（open chromatin）的变化及这类区域附近的基因，并推断变化区域可能结合的转录因子，从而得到中药治疗的具体作用机制与通路。项目进展受限的原因主要是目前数据库中无PBMCs的H3K4me2 ChIP-seq数据。因此，我们以PBMCs的主要细胞成分B或者T细胞搜索，获得相关数据；并寻找这些数据共有的且信号较强的H3K4me2区域，作为qPCR验证区域；然后选取结果较好的，进行高通量测序分析。.项目目前正在进行高通量测序分析，已投稿1篇文章，1篇综述。

项目成果

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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