基于DNA分子标记的木材识别技术研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31070636
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    34.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1614.竹学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

DNA分子标记木材识别技术是国际木材科学与分子生物学研究领域的交叉前沿和热点研究方向, 更是我国亟待开展的研究课题。本项目拟以我国重要红木树种中不同产地栽培的人工林海南黄花梨木材和市场上采购的海南黄花梨和越南黄花梨木材为对象,率先采用CTAB,DNAeasy总DNA抽提试剂盒(QIAGEN)和PTB三种不同方法进行木材的DNA提取、纯化,扩增ITS1、5.8S rDNA和ITS2序列并进行测序分析,获取适合海南黄花梨分子标记的基因序列,分析不同部位和不同干燥方式对海南黄花梨木材DNA提取及序列扩增的影响,揭示不同产地海南黄花梨以及海南黄花梨和越南黄花梨木材DNA序列的差异,将木材鉴定到种和产地,在与木材构造鉴定方法比较的基础上提出DNA木材识别的成熟技术和方法,为推动DNA技术在我国林业和木材科学上的应用,建立我国主要树种木材DNA数据库,促进木材的合理、高效利用提供新思路,探索新方法。

结项摘要

基于DNA分子标记的木材识别技术的研究不仅与木材贸易,木材保护和木材加工利用密切相关,而且与分子生物学、木材科学、林学以及木材加工工艺学等学科关系紧密,因而成为这些学科的交叉前沿和热点研究方向。本项目以我国珍稀、濒危红木树种降香黄檀及其混伪品多裂黄檀木材为研究对象,采用CTAB,DNAeasy总DNA抽提试剂盒(QIAGEN)和PTB三种不同方法进行木材DNA提取、纯化,扩增五条DNA条形码候选片段序列并进行测序分析,获取适合降香黄檀分子标记的基因序列,分析不同部位和不同干燥温度对降香黄檀木材DNA提取及序列扩增的影响,比对和分析降香黄檀和多裂黄檀各条形码序列遗传信息,揭示不同产地降香黄檀DNA序列之间的差异以及降香黄檀和多裂黄檀DNA序列之间的差异,为利用DNA条形码序列鉴定降香黄檀木材及其常见混伪品提供理论依据..经过三年的测定研究和分析,较好的完成了预期的研究计划,达到了预期的研究目标。通过研究表明PTB 法能够有效地从降香黄檀心、边材组织中提取出基因组DNA,且该方法提取的DNA质量和数量均要优与CTAB法和QIAGEN试剂盒法;通过研究不同干燥温度处理对降香黄檀心、边材DNA及PCR扩增ITS序列影响,结果表明随着干燥温度的升高将加剧木材基因组DNA降解程度,且干燥温度越高,对PCR扩增条形码序列影响越大;成功建立并优化了扩增降香黄檀和多裂黄檀ITS、ITS2、rbcL、trnH-psbA和matK各条形码片段的反应体系和反应程序,其中扩增反应中关键参数退火温度分别为:56.4℃,56.4℃,48℃,55℃ 和 61.1℃;通过对条形码序列的多重比较和分析,揭示了不同产地降香黄檀以及降香黄檀与多裂黄檀ITS、ITS2、rbcL、trnH-psbA和matK序列的差异;探明了适合降香黄檀木材分子标记的基因序列为ITS序列,通过ITS序列构建的系统发育树能够准确地将降香黄檀与多裂黄檀区分开来;本研究结果建议把ITS和ITS2序列作为鉴定降香黄檀与多裂黄檀的候选条形码片段。依托本基金项目培养研究生4名(博士1名,硕士3名),在国内重点核心期刊发表论文2篇,(其中,1篇文章已被EI期刊收录),在国内外学术会议上交流会议论文4篇。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(4)
专利数量(0)
降香黄檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列条形码分子鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    林产化学与工业
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    余敏;刘盛全
  • 通讯作者:
    刘盛全
降香黄檀木材DNA提取方法的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    安徽农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    余敏;刘盛全
  • 通讯作者:
    刘盛全

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其他文献

重金属Cd对一年生直立与倾斜生长杨树解剖特性的影响
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  • DOI:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘盛全
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    周亮;刘盛全;田根林;刘亚梅
  • 通讯作者:
    刘亚梅

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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