生物医学图像重建中的数学模型与计算方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11301520
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A0505.反问题建模与计算
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Biomedical image reconstruction is one of the most important research and development directions of the interdisciplinary area of applied mathematics, scientific computing, medical engineering, life science and information technology. The aim of this proposal is to investigate the mathematical models, computational methods and the related theory for image reconstruction problems arisen in the low-dose and sparse-angle X-ray computed tomography and high-noisy cryo-electron microscopy. In terms of the mathematical models, we will explore the generally geometric characteristics of the reconstructed image, and then seek the geometric regularization to characterize the prior knowledge of the reconstructed image, and then construct the appropriate geometric-regularized variational models. We will further study the applications of the geometric partial differential equations for image reconstruction, and make the geometric flow govern the reconstructing process, and hence obtain the desirable performance. In addition, we will focus on investigating the selection methods for the regularization parameters of the variational models based on total-variation and geometric regularizations. We also investigate the fast algorithms for the forward projection and back projection of the iterative reconstruction methods, and further develop the efficient iterative algorithms for the aforementioned reconstruction models. Finally, the correspondingly theoretical analysis of the proposed models and algorithms will be conducted.
生物医学图像重建是应用数学、科学计算、医学工程、生命科学与信息技术等多学科交叉领域最重要的研究和发展方向之一。本项目拟对低剂量稀疏投影角度的X射线计算机断层成像和高噪音的低温电子显微成像中图像重建问题的数学模型、计算方法以及相关理论进行研究。在数学模型方面,我们拟探索重建图像的一般几何特性,寻求能刻画图像先验信息的几何正则化项,构造合理的基于几何正则化的变分模型,并且深入研究几何偏微分方程模型在图像重建中的应用,让几何流来控制图像的重建过程,从而获得理想的重建效果。此外,我们还研究基于全变差正则化的变分模型与基于几何正则化的变分模型中正则化参数的选取方法。研究迭代重建方法中前投影与反投影的快速算法,并且发展求解上述重建模型的高效迭代算法。最后,我们拟对提出的数学模型和计算方法的理论进行分析。

结项摘要

生物医学图像重建是应用数学、科学计算、医学工程、生命科学与信息技术等多学科交叉领域最重要的研究和发展方向之一。本项目主要是对低剂量的X射线计算机断层成像和高噪音的低温电子显微成像中图像重建问题的数学模型、计算方法以及相关理论、后处理与可视化进行研究。围绕上述问题,针对图像重构中的经典的TV正则化变分模型,在算法上,我们提出了基于梯度流的混合格式有限元方法和线性化分裂Bregman迭代算法,并对相关理论问题进行了分析。在模型方法上,我们提出了基于曲面扩散流的多尺度双梯度方法,还基于计算解剖学的可变形模版机理,设计了一个具有形状先验信息的重构数学模型框架,创新性地利用了形状正则化项,结合线性变形的图像匹配方法,在重复核Hilbert空间中考虑线性变形模式。对重建的图像进行了分割后处理,提出了分片多项式的Mumford-Shah模型。为高效真实地可视化三维重构图像,我们还建立了大规模高性能科学计算数据可视化平台。这些模型,算法和平台不仅具有重要的应用价值,还为生物医学成像中图像重建和分割等应用问题的解决提供了新思路、新方法。更重要的是,我们在科学出版社“信息与计算科学丛书”出版名为《图像重构的数值方法》的专著。该书属于“十二五”国家重点图书出版规划项目,是国内计算与应用数学专业生物医学图像重构研究领域的第一本专著,为本研究领域的广大科技工作者的后续研究提供了重要的参考。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Shape Based Image Reconstruction Using Linearized Deformation
使用线性变形进行基于形状的图像重建
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Inverse Problems
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Chong Chen;Nevzat Onur Domani?;Pradeep Ravikumar;Ch;rajit Bajaj
  • 通讯作者:
    rajit Bajaj
大规模科学数据三维可视化系统的建设
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    科研信息化技术与应用
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    钱莹;陈冲;崔涛
  • 通讯作者:
    崔涛
A Multi-Scale Geometric Flow Method for Molecular Structure Reconstruction
分子结构重建的多尺度几何流方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Computational Science & Discovery
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Guoliang Xu;Ming Li;Chong Chen
  • 通讯作者:
    Chong Chen
BLENDED FINITE ELEMENT METHOD AND ITS CONVERGENCE FOR THREE-DIMENSIONAL IMAGE RECONSTRUCTION USING L-2-GRADIENT FLOW
L-2梯度流三维图像重建的混合有限元方法及其收敛性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Communications in Mathematical Sciences
  • 影响因子:
    1
  • 作者:
    Xu; Guoliang;Chen; Chong
  • 通讯作者:
    Chong
A General Framework of Piecewise-Polynomial Mumford-Shah Model for Image Segmentation
图像分割分段多项式Mumford-Shah模型的通用框架
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    International Journal of Computer Mathematics
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    Chong Chen;Junlin Leng;Guoliang Xu
  • 通讯作者:
    Guoliang Xu

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其他文献

遗传性痉挛性截瘫患者179例的临床与遗传学特点
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Chinese Journal of Neurology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王银光;唐北沙;WANG Yin-guang;SHEN Lu;DU Juan;CHEN Chong;ZHOU Zhi-fan;XIAO Zhi-quan;LUO Ying-ying;WANG Jun-ling;YAN Xin-xiang;沈璐;TANG Bei-sha;杜鹃;陈冲;周致帆;肖志权;罗莹莹;王俊岭;严新翔
  • 通讯作者:
    严新翔
基于近红外光谱预测南疆红枣品质的模型建立与参数优化
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    王亚运;陈冲;罗华平
  • 通讯作者:
    罗华平
小鼠腹腔巨噬细胞的异质性观察。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    山东医药
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    --
  • 作者:
    陈冲;冯文利;王荣;杨斐斐;王丽娜;郑国光
  • 通讯作者:
    郑国光
基于顾客选择行为的提前期和价格响应模式
  • DOI:
    10.13383/j.cnki.jse.2016.04.004
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    系统工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李怡娜;陈冲
  • 通讯作者:
    陈冲
基于模块化建模方法的寒区水文过程模拟——在中国西北寒区的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    冰川冻土
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周剑;张伟;John W.Pomeroy;程国栋;王根绪;陈冲;李弘毅
  • 通讯作者:
    李弘毅

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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