栉孔扇贝细胞遗传学图谱构建
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:30901096
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:22.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C1902.水产生物遗传育种学
- 结题年份:2012
- 批准年份:2009
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2010-01-01 至2012-12-31
- 项目参与者:邵明瑜; 陆维; 程洁; 王珊; 胡丽萍;
- 关键词:
项目摘要
细胞遗传学图反映DNA标记或基因在染色体上实际的物理位置,揭示基因与分子标记间的真实连锁关系,为基因工程育种提供理论依据。本研究结合栉孔扇贝已有的基因组学研究基础,应用荧光原位杂交技术(FISH),从四个方面开展细胞遗传学图构建工作: a.筛选包含转座子、卫星、小卫星等重复序列的Fosmid克隆,将这些重复序列定位到染色体上,分析栉孔扇贝基因组中重复序列在染色体上的分布特征;b.将遗传连锁图谱上的SSR标记定位到染色体上,为栉孔扇贝遗传连锁图谱与物理图谱的整合奠定基础;c.将与生长、抗逆相关的功能基因定位到染色体上,为研究基因网络提供细胞遗传学证据;d.绘制栉孔扇贝细胞遗传学图谱,实现栉孔扇贝单条染色体的识别鉴定。研究结果将丰富扇贝细胞遗传学研究内容,有助于了解功能基因、分子标记、重复序列的连锁关系及进一步的遗传育种应用。
结项摘要
细胞遗传学图反映DNA标记或基因在染色体上实际的物理位置,揭示基因与分子标记间的真实连锁关系,为基因工程育种提供理论依据。经过3年的研究工作,课题组取得以下重要成果:1) 建立了贝类多色多重荧光原位杂交技术(M-FISH),绘制出第一张栉孔扇贝细胞遗传学图谱,图谱共包含61个位点,包括5个功能基因、32个SSR标记、8个重复序列以及16个包含未知序列的BAC克隆,实现了栉孔扇贝19条染色体的区分鉴定; 2) 将遗传连锁图谱上的SSR标记(包含与重要经济性状相关的QTL)64个标记进行染色体定位,有40个位点成功定位到栉孔扇贝的染色体上,实现了遗传连锁图谱与细胞学图谱的初步整合,定位结果显示SSR标记在染色体的位置与其在连锁图上的位置存在一定的偏差,研究结果遗传图谱与物理图谱的整合提供了依据;3) 将包含重复序列的28个fosmid克隆进行染色体定位,发现栉孔扇贝重复序列主要分布于染色体的端部位置,其次是着丝粒位置,少数定位在染色体臂的中间位置;4)定位了16个包含生长、发育、抗逆相关功能基因的Fosmid、BAC克隆,获得了这些基因在染色体上的位置。研究结果为扇贝基因组学、基因网络以及进化研究提供了重要依据。
项目成果
期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
应用基因组原位杂交技术分析扇贝重复序列在染色体上的分布
- DOI:--
- 发表时间:--
- 期刊:中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编
- 影响因子:--
- 作者:黄晓婷;胡丽萍;孙妍;张玲玲;包振民
- 通讯作者:包振民
栉孔扇贝DAPI带型和PI带型研究
- DOI:--
- 发表时间:--
- 期刊:中国海洋大学学报(自然科学版)
- 影响因子:--
- 作者:徐俊;包振民;任晓亮;王珊;胡丽萍;黄晓婷;XU Jun1,2,BAO Zhen-Min1,REN Xiao-Liang1,WANG Shan1;2.Shanghai Pharmaceutical School,Shanghai 200135,C
- 通讯作者:2.Shanghai Pharmaceutical School,Shanghai 200135,C
Fertilization and cytogenetic examination of interspecific reciprocal hybridization between the scallops, Chlamys farreri and Mimachlamys nobilis.
扇贝、栉孔扇贝和密扇贝种间互杂交的受精和细胞遗传学研究
- DOI:10.1371/journal.pone.0027235
- 发表时间:2011
- 期刊:PloS one
- 影响因子:3.7
- 作者:Huang X;Bi K;Hu L;Sun Y;Lu W;Bao Z
- 通讯作者:Bao Z
Development of in situ loop‐mediated isothermal amplification technique for chromosomal localization of DNA sequences
开发用于 DNA 序列染色体定位的原位环介导等温扩增技术
- DOI:--
- 发表时间:2012
- 期刊:Chinese Journal of Oceanology and Limnology
- 影响因子:--
- 作者:Shi wang;Lingling Zhang;Xiaoting Huang;Zhenmin Bao
- 通讯作者:Zhenmin Bao
控制虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因的筛查
- DOI:--
- 发表时间:2012
- 期刊:中国海洋大学学报(自然科学版)
- 影响因子:--
- 作者:王珊;战渊超;黄晓婷;包振民
- 通讯作者:包振民
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- 作者:黄晓婷;张玲玲;陆维;包振民
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