栉孔扇贝细胞遗传学图谱构建

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30901096
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1902.水产生物遗传育种学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

细胞遗传学图反映DNA标记或基因在染色体上实际的物理位置,揭示基因与分子标记间的真实连锁关系,为基因工程育种提供理论依据。本研究结合栉孔扇贝已有的基因组学研究基础,应用荧光原位杂交技术(FISH),从四个方面开展细胞遗传学图构建工作: a.筛选包含转座子、卫星、小卫星等重复序列的Fosmid克隆,将这些重复序列定位到染色体上,分析栉孔扇贝基因组中重复序列在染色体上的分布特征;b.将遗传连锁图谱上的SSR标记定位到染色体上,为栉孔扇贝遗传连锁图谱与物理图谱的整合奠定基础;c.将与生长、抗逆相关的功能基因定位到染色体上,为研究基因网络提供细胞遗传学证据;d.绘制栉孔扇贝细胞遗传学图谱,实现栉孔扇贝单条染色体的识别鉴定。研究结果将丰富扇贝细胞遗传学研究内容,有助于了解功能基因、分子标记、重复序列的连锁关系及进一步的遗传育种应用。

结项摘要

细胞遗传学图反映DNA标记或基因在染色体上实际的物理位置,揭示基因与分子标记间的真实连锁关系,为基因工程育种提供理论依据。经过3年的研究工作,课题组取得以下重要成果:1) 建立了贝类多色多重荧光原位杂交技术(M-FISH),绘制出第一张栉孔扇贝细胞遗传学图谱,图谱共包含61个位点,包括5个功能基因、32个SSR标记、8个重复序列以及16个包含未知序列的BAC克隆,实现了栉孔扇贝19条染色体的区分鉴定; 2) 将遗传连锁图谱上的SSR标记(包含与重要经济性状相关的QTL)64个标记进行染色体定位,有40个位点成功定位到栉孔扇贝的染色体上,实现了遗传连锁图谱与细胞学图谱的初步整合,定位结果显示SSR标记在染色体的位置与其在连锁图上的位置存在一定的偏差,研究结果遗传图谱与物理图谱的整合提供了依据;3) 将包含重复序列的28个fosmid克隆进行染色体定位,发现栉孔扇贝重复序列主要分布于染色体的端部位置,其次是着丝粒位置,少数定位在染色体臂的中间位置;4)定位了16个包含生长、发育、抗逆相关功能基因的Fosmid、BAC克隆,获得了这些基因在染色体上的位置。研究结果为扇贝基因组学、基因网络以及进化研究提供了重要依据。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
应用基因组原位杂交技术分析扇贝重复序列在染色体上的分布
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄晓婷;胡丽萍;孙妍;张玲玲;包振民
  • 通讯作者:
    包振民
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Huang X;Bi K;Hu L;Sun Y;Lu W;Bao Z
  • 通讯作者:
    Bao Z
Development of in situ loop‐mediated isothermal amplification technique for chromosomal localization of DNA sequences
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Shi wang;Lingling Zhang;Xiaoting Huang;Zhenmin Bao
  • 通讯作者:
    Zhenmin Bao
控制虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因的筛查
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中国海洋大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王珊;战渊超;黄晓婷;包振民
  • 通讯作者:
    包振民

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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