橡胶树CRISPR/Cas9-sgRNA RNP基因组编辑体系构建及橡胶转移酶复合体解析研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31700598
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1610.林木遗传育种
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Natural rubber is an important strategic material and industrial raw materials, however, rubber clones specified for producing military and civil high performance natural rubber are margin in the world. Rubber hydrocarbon length is one of the key factors affecting the performance of natural rubber, and the latest in vitro experimental results show that the CPTL\CPT\REF complex controls the length of rubber hydrocarbon. However, the in vivo experimental evidence is lacking, and members of this complex are not clear. Based on the efficient somatic embryo regeneration system and particle gun technology, this project will first establish the rubber tree CRISPR/Cas9-sgRNA RNP genome editing system, and then delete functional domains of members of CPTL\CPT\REF gene family by double sgRNA, finally, confirm composition of members of rubber transferase complex by analysis of molecular weight of rubber hydrocarbon in edited plants. The successful implementation of the project will provide the target genes for the cultivation of high performance rubber, and promote the innovation of precise breeding technology.
天然橡胶是重要的战略物资和工业原料,然而,军民高性能胶品种培育处于世界空白。橡胶烃长度是影响天然胶性能的关键因素之一,最新体外实验结果显示,其受CPTL\CPT\REF等组成的橡胶转移酶复合体的调控,但是,尚未有体内实验证据解析此复合体的成员构成。本项目将在已有橡胶树高效体胚再生体系和基因枪技术的基础上,构建橡胶树CRISPR/Cas9-sgRNA RNP基因组编辑体系,并在此基础上,利用CRISPR/Cas9-sgRNA RNP精准编辑特性,筛选切割CPTL\CPT\REF基因家族成员功能域的特异双sgRNA,突变在胶乳中高表达的CPTL\CPT\REF家族成员,分析基因突变对编辑植株橡胶烃分子量的影响,解析橡胶转移酶复合体的成员构成。项目的成功实施,将为高性能橡胶基因工程品种培育提供靶基因,同时推动橡胶树精准育种技术创新。

结项摘要

天然橡胶是重要的战略物资和工业原料,然而,军民高性能胶品种培育处于世界空白。橡胶烃长度是影响天然橡胶性能的关键因素之一,分子量越高,品质越好。最新体外实验结果显示,其延伸长度受CPTL\CPT\REF等组成的橡胶转移酶复合体的调控,但是,尚未有体内实验证据解析此复合体的成员构成。本项目首先构建了橡胶树Crispr/Cas9基因组编辑体系,然后利用此体系对橡胶转移酶复合体家族成员进行编辑。首先,构建了高效的橡胶树原生质体瞬时转化体系,转化效率提高到50%以上,完全满足亚细胞定位与编辑效率检测等实验需要。然后,我们克隆了5个有功能的橡胶树内源的HbU6基因启动子,这些启动子为多靶点sgRNA载体构建提供了便利。随后,分别以质粒和RNP两种形式,实现了橡胶树原生质体CRISPR/Cas9瞬时转化基因编辑,编辑效率均超过了24%,此体系可以快速地对候选sgRNA靶点的编辑效率进行鉴定,为后续稳定转化编辑获得有效的编辑结果奠定基础。接着,用上述鉴定到HbU6-2启动子,构建了靶标橡胶树HbPDS基因的稳定转化基因编辑载体并完成对胚性愈伤的转化和抗性筛选,目前已经获得了发生白化表型的编辑胚块,并进入生根再生阶段,此结果证明了Crispr/Cas9系统在橡胶树功能基因研究中的有效性。最后,用鉴定到的高转录活性的HbU6-2启动子构建靶标CPTL/CPT/REF各家族基因,基于pCAMBIA1300的CRISPR/Cas9稳定转化编辑载体,并完成了对橡胶树胚性愈伤的转化,目前已筛选到CPTL、CPT发生编辑的愈伤,正在进行继代培养和植株再生工作,再生苗将为家族基因在橡胶树内功能首次提供体内证据,从而确定橡胶转移酶复合体的成员构成以及控制橡胶烃延伸的关键基因,并最终为高性能胶橡胶树新品种培育提供靶基因和进一步研究材料。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
Efficient genome editing of rubber tree (hevea brasiliensis) protoplasts using CRISPR/Cas9 ribonucleoproteins
使用 CRISPR/Cas9 核糖核蛋白对橡胶树 (hevea brasiliensis) 原生质体进行高效基因组编辑
  • DOI:
    10.1016/j.indcrop.2020.112146
  • 发表时间:
    2020-04-01
  • 期刊:
    INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Fan, Yueting;Xin, Shichao;Hua, Yuwei
  • 通讯作者:
    Hua, Yuwei

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其他文献

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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
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    邢运;张桥;杨先锋;刘华;杨嘉陵
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    2020
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    梅明珠;杨先锋;龙腾;张琼;赵静;田钦;彭娇娇;罗均;姜贺;林颖仪;林志雄;郭霄峰
  • 通讯作者:
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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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