DNA硫修饰蛋白DndE溶液结构确定及其功能初步研究

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基本信息

  • 批准号：
    20872169
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    曹春阳
  • 依托单位：
    中国科学院上海有机化学研究所
  • 学科分类：
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

DNA磷硫修饰为我国科学家邓子新院士等人最近在细菌中发现的DNA骨架上第一种生理修饰！它的发现产生了分子生物学领域新的"信息"流，并打开一个新的学科领域。含有磷硫修饰的DNA具有Dnd表型，即在Tris凝胶电泳过程中具有降解特征。研究发现，DndABCDE基因簇决定DNA磷硫修饰全过程，但它们具体如何决定DNA磷硫修饰过程目前没有任何文献报道。DndABCDE基因簇对应的蛋白分别为DndA,DndB,DndC,DndD和DndE，其中只有DndE蛋白分子量为14KDa。为了研究DNA硫修饰机制，以及将来阐述DNA磷硫修饰生物学、以及可能的病理学和药学意义，本项目利用分子生物学技术克隆DndE基因，表达和纯化DndE蛋白，并利用核磁共振技术对DndE溶液三维结构进行研究，同时对DndE与硫修饰与未修饰的DNA以及DndABCD系列蛋白相互作用进行初步探讨。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Structural insights into DndE from Escherichia coli B7A involved in DNA phosphorothioation modification
大肠杆菌 B7A 参与 DNA 硫代磷酸化修饰的 DndE 结构见解
  • DOI：
    10.1038/cr.2012.66
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Cell Reserach
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Ding JP;Lan WX;L JD;Wu G;Deng ZX;Wu HM;Wang C;Zhang T;Fang Li;Hu Z;Hu W;Wang Z;Cao C
  • 通讯作者：
    Cao C

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其他文献

DNA骨架磷硫酰化修饰的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    化学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    胡中培;王呈坤;蓝文贤;李芳;曹春阳
  • 通讯作者：
    曹春阳
Lin28特异性结合let-7 RNA结构基础（英文）
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    波谱学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    蓝文贤;王春喜;麻锦彪;曹春阳
  • 通讯作者：
    曹春阳
胞嘧啶脱氨基化酶APOBEC3家族及其与核酸复合物结构研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Acta Chimica Sinica
  • 影响因子：
    2.5
  • 作者：
    金交羽;严小璇;刘亚平;蓝文贤;王春喜;许斌;曹春阳
  • 通讯作者：
    曹春阳
胞嘧啶脱氨基酶APOBEC1研究进展
  • DOI：
    10.3969/j.issn.1000-5137.2020.02.012
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    上海师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周冰涵;严小璇;蓝文贤;王春喜;曹春阳
  • 通讯作者：
    曹春阳
胞嘧啶脱氨基化酶APOBEC3家族及其与核酸复合物结构研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Acta Chimica Sinica
  • 影响因子：
    2.5
  • 作者：
    金交羽;严小璇;刘亚平;蓝文贤;王春喜;许斌;曹春阳
  • 通讯作者：
    曹春阳

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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