仿刺参FoxO1介导夏眠抗氧化防御调控的分子基础研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31602155
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1902.水产生物遗传育种学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The sea cucumber Apostichopus japonicus is an important aquaculture species in China. During the period of aestivation, it tends to get damaged from the shock of reactive oxygen species, which increases the risk of aestivating aquaculture. Antioxidant defenses is the primary way to resist oxidative stress, and also an important guarantee for sea cucumber to go through aestivation safely. However, there is very limited information in terms of the molecular basis of antioxidant defenses regulation during aestivation in sea cucumber. In preliminary work of aestivation in sea cucumber, a unique regulating mode was observed in antioxidant defenses. Meanwhile, FoxO1 was found to play an important role in the regulation. In this research, the functional and expression mode will be studied by qRT-PCR and Western blot; the regulatory factors and target gene will be studied by Co-IP and CHIP-Seq; the regulation mode will be verified by RNAi and protein injection. The research achievements will elucidate the molecular basis of antioxidant defenses regulation mediated by FoxO1 during aestivation in sea cucumber, and promote the processes of selective breeding of resistant variety.
仿刺参是我国重要的海水养殖品种,其在夏眠过程中易遭受活性氧冲击而发生损伤,持续的氧化压力加大了夏眠过程的养殖风险。抗氧化防御是仿刺参夏眠期间抵御氧化冲击的主要手段,是其安全度过夏眠的重要保障。然而,仿刺参夏眠期间抗氧化防御调控的分子基础研究还十分有限。项目组前期研究发现,仿刺参在夏眠过程中可能具有独特的抗氧化防御调控模式;同时发现,FoxO1(叉头盒因子O1)可能在介导调控过程中发挥了重要作用。基于前期研究和项目组已掌握的仿刺参基因组数据,本研究由FoxO1入手,拟通过重组蛋白注射、RNA干扰、Co-IP与质谱联用、以及ChIP-Seq等技术,探明FoxO1的功能和表达模式,鉴定与FoxO1结合的调节因子和靶基因,并对其调控模式进行验证和分析。研究结果将阐明仿刺参夏眠过程中FoxO1介导抗氧化防御调控的分子基础,为提高仿刺参夏眠防御能力、推动仿刺参抗逆优良品种的选育工作提供重要依据。

结项摘要

仿刺参在夏眠期间,机体会处于一种高度缺氧状态,易造成氧化抑制或氧化应激,从而对机体造成损伤。抗氧化防御作用是仿刺参夏眠期间应对氧化冲击的主要防御手段,也是其安全度过夏眠的重要保障。在国家自然科学基金的资助下,本研究分析了FoxO1及其它抗氧化防御调控网络功能基因在仿刺参夏眠中的功能,以期进一步理解仿刺参夏眠抗氧化防御调控的分子机制。项目研究结果主要包括以下内容。项目分析了FoxO1基因的结构与进化特征,从仿刺参夏眠不同阶段、不同组织、以及成参与幼参对比等多个角度解析了FoxO1在仿刺参夏眠不同阶段的水平与表达变化以及对夏眠抗氧化防御特征的影响,并通过多样性关联分析鉴定了SNP位点-310 A-C与仿刺参夏眠抗氧化防御能力显著关联;对仿刺参夏眠抗氧化防御过程的mRNA转录组学和miRNA变化进行了解析,鉴定了10个在仿刺参夏眠抗氧化防御过程中调控FoxO1表达的miRNA,同时鉴定了FoxO1调控相关基因等仿刺参夏眠抗氧化防御调控网络功能基因并分析了调控关系;对Keap1、Nrf1、Prx和HSP等夏眠抗氧化防御调控网络功能基因结构、进化与表达特征进行了全面解析,研究结果有助于全面理解仿刺参夏眠抗氧化防御调控网络和调控分子机制,为仿刺参分子标记辅助育种提供技术支撑。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
辽宁黄渤海沿岸长牡蛎遗传多样性分析
  • DOI:
    10.13326/j.jea.2017.1232
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    经济动物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于思梦;高磊;王伟;赫崇波;鲍相渤;田梅林
  • 通讯作者:
    田梅林
Genome-wide comparative analysis of the SHSP, HSP60/10 and HSP90 genes reveals differential heat stress responses in estivation of the sea cucumber Apostichopus japonicus
SHSP、HSP60/10 和 HSP90 基因的全基因组比较分析揭示了刺参夏眠时的不同热应激反应
  • DOI:
    10.1111/are.13986
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Aquaculture Research
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Lei Gao;Zihao Yuan;Zhen Ma;Zhao Li;Simeng Yu;Yunfeng Li;Chongbo He
  • 通讯作者:
    Chongbo He
FOXO genes in channel catfish and their response after bacterial infection
斑点叉尾鮰的FOXO基因及其细菌感染后的反应
  • DOI:
    10.1016/j.dci.2019.03.010
  • 发表时间:
    2019-08-01
  • 期刊:
    DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Gao, Lei;Yuan, Zihao;Liu, Zhanjiang
  • 通讯作者:
    Liu, Zhanjiang
Transcriptome analysis of the sea cucumber (Apostichopus japonicus) with variation in individual growth.
海参(Apostichopus japonicus)个体生长差异的转录组分析
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0181471
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Gao L;He C;Bao X;Tian M;Ma Z
  • 通讯作者:
    Ma Z
Chromosome-level reference genome of the jellyfish Rhopilema esculentum
水母 Rhopilema esculentum 的染色体水平参考基因组
  • DOI:
    10.1093/gigascience/giaa036
  • 发表时间:
    2020-04-01
  • 期刊:
    GIGASCIENCE
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Li, Yunfeng;Gao, Lei;Zhou, Zunchun
  • 通讯作者:
    Zhou, Zunchun

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其他文献

Polarization-dependent pulse dynamics of mode-locked fiber laser with near-zero net dispersion
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019-10
  • 期刊:
    Applied Physics Express
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    曹玉龙;高磊;李雨佳;冉洪清;孔令迪;吴强;黄礼刚;黄维;朱涛
  • 通讯作者:
    朱涛
天津市孤独症谱系障碍儿童膳食营养状况
  • DOI:
    10.16835/j.cnki.1000-9817.2021.09.010
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国学校卫生
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    石芮;韩钰;高磊;汪耿夫;张欣
  • 通讯作者:
    张欣
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  • DOI:
    10.3969/j.issn.0254-0150.2017.04.014
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    润滑与密封
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张强;高磊;刘昱良;彭慧芬;蒋豹
  • 通讯作者:
    蒋豹
包头市小学生超重/肥胖影响因素分析
  • DOI:
    10.16833/j.cnki.jbmc.2017.09.036
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    包头医学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    袁甜;包艳;张梦洁;高磊;候瑞丽;史雪敏
  • 通讯作者:
    史雪敏
GFRP筋混凝土柱抗震性能试验
  • DOI:
    10.19721/j.cnki.1001-7372.2017.10.008
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国公路学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邓宗才;高磊;王献云
  • 通讯作者:
    王献云

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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