电喷雾质谱法研究抗癌先导药物与FAK蛋白的相互作用及机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21275167
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

FAK (Focal adhesion kinase) protein plays important roles in cancer cell invasion, migration and carcinogenesis, and it is thereby considered as a potential target in cancer therapy. Small molecule inhibitors targeting FAK can effectively inhibit the activity of FAK and have shown in many researches the inhibitive effects on apoptosis and migration of various tumor cells. Hence, this work is proposed to develop novel mass spectrometry methods, including the design of a new on-line reaction and hydrogen-deuterium exchange (H/D exchange) time-resolved electrospray ionization mass spectrometry, to study and characterize the interactions between inhibitor molecules and FAK protein or its functional domains. We will also probe the dynamic conformational changes of FAK protein during the inhibition process in order to explore the mechanism of FAK inhibitor, and initially identify the specific interaction sites of inhibitors and FAK protein. The methods established in this project can be applied to the screening and investigation of new FAK inhibitors, and also provide new approaches to discover new drug precursor molecules targeting FAK for the inhibition of cancer cell invasion and migration.
粘附斑激酶(FAK)蛋白与癌细胞侵袭、转移、发生行为密切相关,是一个肿瘤治疗的潜在靶点。FAK的抑制剂分子能够有效抑制FAK活性,并显示对肿瘤细胞增殖和迁移有明显的抑制效果。因此,本课题拟针对FAK特异性抑制剂的研究和筛选,发展并构建质谱学新方法,包括设计新的在线反应和氢氘交换(H/D exchange)时间分辨电喷雾质谱法(Time-resolved ESI mass spectrometry),研究和测定FAK、FAK的结构功能域与抑制剂分子的相互作用,表征抑制作用过程中FAK蛋白质构象的动态变化,确定抑制剂和FAK蛋白相互作用的具体区域和作用位点,以阐明FAK抑制剂的作用机制。本项目所建立的方法可以应用于新FAK抑制剂的筛选和考察,为寻找以FAK为靶点的抑制癌细胞侵袭转移的新药物前体分子提供新的方法和途径。

结项摘要

黏着斑激酶(Focal Adhesion Kinase,FAK)是一种调节细胞粘附、迁移、增殖的非受体蛋白质酪氨酸激酶,能促进肿瘤的生长和转移。针对FAK为靶点抑制剂分子的筛选和FAK蛋白复合物研究,探究FAK抑制剂的作用机制,和寻找以FAK为靶点的抑制肿瘤细胞的药物前体分子提供实验依据。本项目完成的研究工作主要包括:1)系统地开展了非共价蛋白复合物的质谱方法研究,如Top-down 电喷雾质谱(ESI-MS)、氢氘交换ESI-MS、亲和超滤质谱等技术,并应用于FAK蛋白质和其抑制剂分子,以及其它药物、环境污染物小分子与靶蛋白质的相互作用研究;2)完成了黏着斑激酶(FAK)两个重要结构域—FERM与Kinase融合蛋白表达载体的构建和纯化工作;3)研究和筛选了与FAK相结合的抑制剂候选分子,并探究和对比了一系列不同结构的抑制剂分子与FAK蛋白的结合能力、结合区域和作用方式;4)采用分子生物学实验验证了筛选出的FAK抑制剂分子在细胞生理条件下对FAK蛋白的抑制作用,以及对细胞行为的影响,确定细胞体系中抑制剂的生物效应;5) 研究了筛选出与FAK特异性抑制剂化合物的体外代谢产物结构和代谢途径。基于上述研究结果,本项目已发表20篇期刊论文,培养了2名博士研究生和10名硕士研究生。

项目成果

期刊论文数量(20)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(4)
专利数量(0)
电喷雾质谱法研究不同碳链长度的全氟羧酸与肌红蛋白的相互作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    化学与生物工程
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李志雄;王献
  • 通讯作者:
    王献
Study on the noncovalent interactions of saikosaponins and cytochrome c by electrospray ionization mass spectrometry
电喷雾电离质谱研究柴胡皂苷与细胞色素c的非共价相互作用
  • DOI:
    10.1002/rcm.6151
  • 发表时间:
    2012-04-15
  • 期刊:
    RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Liu, Yingzhi;Su, Bo;Wang, Xian
  • 通讯作者:
    Wang, Xian
广金钱草中槲皮素的定性分析及其与β-乳球蛋白相互作用的电喷雾质谱研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    化学与生物工程
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐康宁;黄娟;王献
  • 通讯作者:
    王献
Proposed nomenclature for peptide ion fragmentation
肽离子碎裂的拟议命名法
  • DOI:
    10.1016/j.ijms.2015.07.021
  • 发表时间:
    2015-11-15
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    Chu, Ivan K.;Siu, Chi-Kit;Siu, K. W. Michael
  • 通讯作者:
    Siu, K. W. Michael
女贞子中齐墩果酸的定性分析及其与人血清白蛋白相互作用的电喷雾质谱研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中医药导报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张文祥;李倩;王献
  • 通讯作者:
    王献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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