CHU_3237介导的纤维素酶在哈氏噬纤维菌表面锚定机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31770080
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Development and utilization of renewable biomass as an alternative energy sourse has important practical significance and broad prospects. Cytophaga hutchinsonii, a Gram-negative Bacteroidetes bacterium, uses a novel unknown strategy to degrade cellulose completely and efficiently without free cellulases and multienzyme complexs like cellulosomes. Recently we found that several cellulases were anchored on the cell surface of C. hutchinsonii. However, these cellulases do not contain a hydrophobic transmembrane domain or any anchoring domain. Based on our previous study, we speculated that the anchoring system might be coupled with the protein transportation system T9SS. And CHU_3237 might play an important role in this process. It mediated ont only the recognation and cutting of the CTD domain of celulases, but also the anching of cellulases on the cell surface. This is a novel anchoring form of cell-surface protein for Gram-negative bacterium. In this project, the role of CHU_3237 in protein anchoring will be determined by structural analysis and functional study. The reporting system of proteins anchoing on the cell surface of C. hutchinsonii will be constructed in order to study the recognition sites and the recognition mechanism of CHU_3237. And the main influencing factors of anchoring efficiency will be explored. This study attempts to reveal the novel anchoring mechanism of cellulases on the cell surface of C. hutchinsonii, which would be helpful to reveal its cellulose degradation strategy and to construct new bioconversion system of cellulose.
开发利用生物质资源为替代能源具有重要的现实意义和广阔的发展前景。革兰氏阴性拟杆菌哈氏噬纤维菌既不分泌游离的纤维素酶,也没有类似纤维小体的多酶复合物结构,而是利用一种新型未知的策略迅速降解纤维素。最近我们发现该菌具有细胞表面锚定的纤维素酶系,但这些纤维素酶即没有疏水的跨外膜结构域,也没有其它锚定结构域。基于前期工作,我们推测纤维素酶的锚定与T9SS蛋白分泌系统相偶联,其中CHU_3237起着关键作用,它介导了对纤维素酶CTD结构域的识别切割以及在细胞表面的锚定。这是革兰氏阴性细菌一种新型的表面蛋白锚定方式。本课题拟通过结构分析和功能研究确定CHU_3237在锚定中的作用,通过构建表面蛋白锚定报告系统深入研究CHU_3237对效应蛋白的识别和锚定机制,探索影响锚定效率的关键因素,初步阐明哈氏噬纤维菌表面纤维素酶的新型锚定机制,为揭示其高效纤维素降解机制和构建新型纤维素生物转化体系提供帮助。

结项摘要

Cytophaga hutchinsonii是广泛存在于土壤中的拟杆菌门革兰氏阴性细菌,具有较强的纤维素降解能力。与厌氧梭菌和真菌降解纤维素不同,C. hutchinsonii不形成纤维小体结构,亦不分泌游离的纤维素酶,是通过细胞表面纤维素酶参与的新型纤维素降解机制快速高效地降解结晶纤维素。T9SS是近年发现的仅存在于拟杆菌门的新型蛋白分泌系统。T9SS的效应蛋白具有保守的C端结构域 (CTD),T9SS通过识别底物蛋白的CTD序列将底物蛋白转运出细胞外膜。推测T9SS参与表面纤维素的分泌和锚定。C. hutchinsonii基因组中含有T9SS的一系列编码基因,但各组分的功能尚不清楚。CHU_3237是T9SS中切割底物蛋白CTD的肽酶。我们通过定点突变鉴定了CHU_3237的肽酶活性位点,发现His803与 Cys837突变后会影响C. hutchinsonii滤纸降解和菌体扩散能力,同时也造成了部分表面蛋白和胞外蛋白显著缺失。我们的研究表明CHU_3237通过影响纤维素酶等表面蛋白的分泌和锚定进而影响菌体的纤维素降解和运动功能。我们发现CHU_3238也是T9SS的重要组分蛋白,其缺失会影响纤维素酶等表面蛋白的分泌,而且还影响了细胞外膜的完整性。此外,还发现纤维素酶在细胞表面锚定与LPS的完整性相关。我们初步尝试在大肠杆菌对CHU_3237进行异源表达,但是发现表达产物存在明显降解的现象。我们成功构建了表面蛋白锚定的报告系统,确定了CHU_3237切割T9SS底物蛋白CTD的位点,并意外发现C. hutchinsonii 的CTD存在N-糖基化修饰,且糖基化修饰影响 T9SS 底物的运输和定位。进一步研究发现CHU_3237功能缺失会影响CTD的糖基化。这是首次在拟杆菌门细菌发现的N-糖基化修饰现象。T9SS底物蛋白CTD的糖基化修饰与T9SS对底物蛋白的识别是否相关?值得进一步探讨研究。此外,我们还发现C. hutchinsonii T9SS参与钙离子和镁离子的跨外膜转运的新功能,并基于此通过改进突变株的筛选条件首次获得T9SS重要组分GldN、SprA,SprT及PorV编码基因的敲除株,并对其在纤维素降解和菌体滑动方面的功能进行了研究。我们的研究为揭示C. hutchinsonii独特的纤维素降解机制提供重要依据,也为其他拟杆菌T9SS的功能研究提供了新

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Effects of the histone-like protein HU on cellulose degradation and biofilm formation of Cytophaga hutchinsonii
组蛋白样蛋白 HU 对哈钦氏噬菌体纤维素降解和生物膜形成的影响
  • DOI:
    10.1007/s00253-018-9071-9
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Guan Zhiwei;Wang Ying;Gao Lijuan;Zhang Weican;Lu Xuemei
  • 通讯作者:
    Lu Xuemei
Cytophaga hutchinsonii SprA and SprT Are Essential Components of the Type IX Secretion System Required for Ca2+ Acquisition, Cellulose Degradation, and Cell Motility
Cytophaga hutchinsonii SprA 和 SprT 是 Ca2 获取、纤维素降解和细胞运动所需的 IX 型分泌系统的重要组成部分
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2021.628555
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Gao L;Tan Y;Zhang W;Qi Q;Lu X
  • 通讯作者:
    Lu X
Identification of a cell-surface protein involved in glucose assimilation and disruption of the crystalline region of cellulose by Cytophaga hutchinsonii
鉴定参与葡萄糖同化和哈钦森细胞噬菌体破坏纤维素结晶区的细胞表面蛋白
  • DOI:
    10.1007/s10295-019-02212-3
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Wang Sen;Zhao Dong;Zhang Weican;Lu Xuemei
  • 通讯作者:
    Lu Xuemei
A Disulfide Oxidoreductase (CHU_1165) Is Essential for Cellulose Degradation by Affecting Outer Membrane Proteins in Cytophaga hutchinsonii
二硫键氧化还原酶 (CHU_1165) 通过影响哈钦森噬细胞菌的外膜蛋白而对纤维素降解至关重要
  • DOI:
    10.1128/aem.02789-19
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Applied and Environmental Microbiology
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zhao Dong;Wang Ying;Wang Sen;Zhang Weican;Qi Qingsheng;Lu Xuemei
  • 通讯作者:
    Lu Xuemei
Identification of the Type IX Secretion System Component, PorV (CHU_3238), Involved in Secretion and Localization of Proteins in Cytophaga hutchinsonii
鉴定参与哈钦森噬细胞菌蛋白质分泌和定位的 IX 型分泌系统组件 PorV (CHU_3238)
  • DOI:
    doi:10.3389/fmicb.2021.742673
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Dong Zhao;Wenxia Song;Sen Wang;Weican Zhang;Yue Zhao;Xuemei Lu
  • 通讯作者:
    Xuemei Lu

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  • 通讯作者:
    卢雪梅

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哈氏噬纤维菌T9SS底物蛋白的N-糖基化修饰及其生物学功能
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
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技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
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实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
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          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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