驱动南海氮循环关键过程的细菌、古菌功能群分布、多样性及活性特征

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41176095
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    69.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0605.海洋生态学与环境科学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

氮循环是所有生源要素的生物地球化学循环中,与微生物关系最密切、最彻底的元素循环。然而迄今为止南海生态系统尚未有详细的微生物介导的氮循环研究,并且存在着许多不确定的科学问题亟待解决。本申请课题根据申请者在南海已有的工作基础和认识,以分子生物(生态)学方法为主要技术手段,以与海域生物地球化学数据配合分析的科研思路,着重开展南海生态系统中占重要地位的两个氮循环关键过程的微生物功能群研究,包括固氮功能群(nifH)、氨氧化功能群(amoA)、亚硝酸氧化功能群(norB)的研究,并探讨南海氮循环关键过程可能的耦合过程和机制。以期达到如下研究目标:1)厘清南海典型环境固氮生物群落分子生物学特征、各主要类群分布特征,及对南海氮输入的贡献;2)确定氨氧化古菌的深度分布模式,及其在南海的主要生态小生境;3)给出南海亚硝酸氧化细菌群落的多样性特征,确认其与氨氧化过程的耦合,确认南海N2O产生的硝化作用贡献。

结项摘要

氮的生物地球化学循环几乎完全依赖于海洋生态系统中丰富的微生物,因此介导氮循环关键过程的微生物的生态过程与机制是一个至关重要的研究焦点。本项目瞄准这一前沿课题,以分子生物学和生态学方法为主要技术手段,通过氮循环不同过程关键功能基因的定量、分布、多样性研究,探讨了氮循环关键过程功能群在南海的重要作用以及相互关系。揭示了南海固氮菌群的多样性特征及其受中尺度冷涡影响的群落空间结构差异;揭示了河口氨氧化、反硝化基因多样性、丰度及群落结构,指出在有机物和营养盐不受限制的高悬浮颗粒物河口区域,当溶解氧浓度降到合适的水平,硝化-反硝化的耦合作用将对河口脱氮起重要作用;在南海部分海域开展的亚硝酸盐氧化菌的研究,获得了填补南海该项研究空白的第一手数据资料;以南海附近浅海热液区典型生态系统为例,探讨了细菌、古菌群落结构及其所介导的碳、氮、硫循环之间的耦联;在南海开展的细菌、古菌群落的高通量测序分析揭示了群落结构特征及时空演替规律和机理。本项目研究链接了微生物功能群与海洋氮循环,为认识全球尺度的碳-氮循环耦合提供了新的视角和资料。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Diversity and distribution of amoA-type nitrifying and nirS-type denitrifying microbial communities in the Yangtze River estuary
长江口amoA型硝化和nirS型反硝化微生物群落多样性及分布
  • DOI:
    10.5194/bg-11-2131-2014
  • 发表时间:
    2013-11
  • 期刊:
    Biogeosicences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang, Yao;Xie, Xiabing;Jiao, Nianzhi;Hsiao, Silver-Sun;Kao, Shuh-Ji
  • 通讯作者:
    Kao, Shuh-Ji
Why productive upwelling areas are often sources rather than sinks of CO2?ndash;a comparative study on eddy upwellings in the South China Sea
为什么生产性上升流区域通常是二氧化碳的源而不是汇?
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Biogeosciences Discussions
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jiao, N.;Zhang, Y.;Zhou, K.;Li, Q.;Dai, M.;Liu, J.;Guo, J.;Huang, B.
  • 通讯作者:
    Huang, B.
The research of typical microbial functional group reveals a new oceanic carbon sequestration mechanism—A case of innovative method promoting scientific discovery
典型微生物功能群研究揭示海洋固碳新机制——创新方法推动科学发现的案例
  • DOI:
    10.1007/s11430-015-5202-7
  • 发表时间:
    2016-03
  • 期刊:
    SCIENCE CHINA-EARTH SCIENCES
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Jihua Liu;Qiang Li;Lijie Zou;Yao Zhang
  • 通讯作者:
    Yao Zhang
Diverstiy and distribution of amoA-type nitrifying and nirS-type denitrifying microbial communities in the Yangtze River Estuary
长江口amoA型硝化和nirS型反硝化微生物群落多样性及分布
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Biogeosciences
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Xiabing Xie;Nianzhi Jiao;Sung-Yun Hsial;Shuh-Ji Kao
  • 通讯作者:
    Shuh-Ji Kao
Sulfur metabolizing microbes dominate microbial communities in Andesite-hosted shallow-sea hydrothermal systems.
硫代谢微生物在安山岩浅海热液系统中的微生物群落中占主导地位
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0044593
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhang Y;Zhao Z;Chen CT;Tang K;Su J;Jiao N
  • 通讯作者:
    Jiao N

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  • 作者:
    马长利;伍灵慧;张瑶;袁野;吕晓睿;郑阳恒;何康林;李卫东;刘怀民;马秋梅
  • 通讯作者:
    马秋梅

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张瑶的其他基金

深海生物圈能量来源、微生物碳需求及代谢策略
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  • 批准年份:
    2020
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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