拟南芥HDA15与HY5互作调控光信号转导的分子机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31771366
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Light is one the most important environmental signals that regulating plant growth and development. Histone deacetylases widely participate in light-mediated gene expression and developmental processes, however, the mechanism keeps unclear. In our previous studies, we found that RPD3/HDA1-type histone deacetylase HDA15 interacts with bZIP-type transcription factor HY5, the key factor in light sigal transduction in Arabidopsis. HDA15 and HY5 co-regulate hypocotyl elongation and the expression of cell elongation related genes in Arabidopsis seedling. Furthermore, HDA15 affects the protein stability of HY5 in Arabidopsis. Based on these findings, in this study, we will analyze the genetic interplay of HDA15 and HY5 in regulating hypcotyl elongation. Next, we will study the target gene network and transcriptional mechanism co-regulated by HDA15 and HY5. Furthermore, we will also examine the mechinsim how HDA15 regulates the protein stability of HY5. These studies will elucidate the interplay of HDA15-HY5 module in regulating light sigal transduction, which may ultimately be applicable in improvement of properties of crops.
光是调节植物生长发育最重要的环境信号因子之一。组蛋白去乙酰化酶广泛参与光调控的基因表达与发育过程,然而其作用机制尚不清楚。我们前期的研究表明,拟南芥RPD3/HDA1型组蛋白去乙酰化酶HDA15与光信号转导途径中重要的转录因子HY5发生互作,并共同抑制幼苗下胚轴伸长及相关基因的表达;此外,HDA15参与维持HY5蛋白在拟南芥幼苗中的稳定性。在此基础上,本项目拟进行以下研究:(1)分析HDA15和HY5在调控拟南芥下胚轴伸长途径中的遗传关系;(2)解析HDA15和HY5互作共同调控的靶基因网络及转录调控机制;(3)探索HDA15对HY5蛋白稳定性的调节机制。本研究将阐明HDA15-HY5互作调控光信号转导的分子机理,研究成果将为农作物的性状改良提供理论基础。

结项摘要

光是调节植物生长发育最重要的环境信号因子之一。光形态建成是植物生长发育过程中的一个重要过程,这个过程由光介导的转录和组蛋白修饰变化所调控。转录因子HY5作用于多个植物光受体的下游,通过调节光响应基因的表达促进植物的光形态建成。然而,HY5介导的转录调控机制仍不清楚。本研究中,我们发现HY5与RPD3/HDA1型的组蛋白去乙酰化酶HDA15在体外和体内发生直接的相互作用。表型分析表明HDA15在红光和远红光下负调控拟南芥幼苗的下胚轴伸长。酶活性分析显示,HDA15的去乙酰化酶活性对于抑制幼苗下胚轴伸长是必需的。同时,HDA15和HY5以相互依赖的方式参与抑制光形态建成中下胚轴的细胞伸长。全基因组转录组分析表明HDA15和HY5共同的抑制了一类细胞壁组织和生长素信号相关基因的表达水平。此外,HDA15对于HY5抑制下胚轴伸长的功能是不可或缺的。HY5以光依赖的方式招募HDA15蛋白到目标基因的启动子区域,并通过降低这些基因的组蛋白H4乙酰化水平,从而抑制其表达。我们的研究揭示HDA15-HY5为植物光形态建成中下胚轴的细胞伸长为一个重要的转录调控节点。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
SWI3B and HDA6 interact and are required for transposon silencing in Arabidopsis
SWI3B 和 HDA6 相互作用并且是拟南芥中转座子沉默所必需的
  • DOI:
    10.1002/adhm.201901259
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Plant Journal
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    Yang Jie;Yuan Lianyu;Yen Ming-Ren;Zheng Feng;Ji Rujun;Peng Tao;Gu Dachuan;Yang Songguang;Cui Yuhai;Chen Pao-Yang;Wu Keqiang;Liu Xuncheng
  • 通讯作者:
    Liu Xuncheng
Arabidopsis Histone Methyltransferase SUVH5 Is a Positive Regulator of Light-Mediated Seed Germination
拟南芥组蛋白甲基转移酶 SUVH5 是光介导种子萌发的正调节因子
  • DOI:
    10.3389/fpls.2019.00841
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Frontiers in Plant Science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Gu Dachuan;Ji Rujun;He Chunmei;Peng Tao;Zhang Mingyong;Duan Jun;Xiong Changyun;Liu Xuncheng
  • 通讯作者:
    Liu Xuncheng
HY5 Interacts with the Histone Deacetylase HDA15 to Repress Hypocotyl Cell Elongation in Photomorphogenesis
HY5 与组蛋白脱乙酰酶 HDA15 相互作用抑制光形态发生中的下胚轴细胞伸长
  • DOI:
    10.1104/pp.19.00055
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Plant Physiology
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zhao Linmao;Peng Tao;Chen Chia-Yang;Ji Rujun;Gu Dachuan;Li Tingting;Zhang Dongdong;Tu Yi-Tsung;Wu Keqiang;Liu Xuncheng
  • 通讯作者:
    Liu Xuncheng
SlJMJ7 orchestrates tomato fruit ripening via crosstalk between H3K4me3 and DML2-mediated DNA demethylation
SlJMJ7 通过 H3K4me3 和 DML2 介导的 DNA 去甲基化之间的串扰协调番茄果实成熟
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    NEW PHYTOLOGIST
  • 影响因子:
    9.4
  • 作者:
    Ding Xiaochun;Liu Xuncheng;Jiang Guoxiang;Li Zhiwei;Song Yunbo;Zhang D;an;Jiang Yueming;Duan Xuewu
  • 通讯作者:
    Duan Xuewu

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  • 通讯作者:
    吴克
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    --
  • 发表时间:
    2017
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    9.4
  • 作者:
    邝健飞;陈建业;刘勋成;韩延超;萧允艺;单伟;汤杨;吴克强;何军贤;陆旺金
  • 通讯作者:
    陆旺金

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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